More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3165 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0587  aldehyde dehydrogenase family protein  66.87 
 
 		 496 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4701  betaine-aldehyde dehydrogenase  68.05 
 
 		 496 aa  667    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00415207  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1328  aldehyde dehydrogenase family protein  66.87 
 
 		 496 aa  667    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0311  aldehyde dehydrogenase family protein  66.87 
 
 		 496 aa  667    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0753946  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3577  betaine-aldehyde dehydrogenase  79.8 
 
 		 491 aa  813    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162462  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2502  aldehyde dehydrogenase family protein  66.87 
 
 		 496 aa  669    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1242  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  66.87 
 
 		 496 aa  669    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1113  betaine-aldehyde dehydrogenase  68.67 
 
 		 496 aa  673    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.016361  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4502  Aldehyde Dehydrogenase  79.3 
 
 		 500 aa  793    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319143  normal  0.917567 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7067  Aldehyde Dehydrogenase  66.26 
 
 		 496 aa  684    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1493  aldehyde dehydrogenase family protein  67.63 
 
 		 488 aa  688    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3685  betaine-aldehyde dehydrogenase  81.15 
 
 		 495 aa  830    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4634  Aldehyde Dehydrogenase  79.3 
 
 		 500 aa  793    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20636  normal  0.0898533 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3992  betaine-aldehyde dehydrogenase  68.05 
 
 		 496 aa  667    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254336  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0183  betaine-aldehyde dehydrogenase  66.06 
 
 		 499 aa  683    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1315  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  67.07 
 
 		 496 aa  669    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.953752  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3666  betaine-aldehyde dehydrogenase  68.05 
 
 		 496 aa  667    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5599  betaine-aldehyde dehydrogenase  68.05 
 
 		 496 aa  667    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0279735  normal  0.51588 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0980  aldehyde dehydrogenase family protein  66.87 
 
 		 496 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.340649  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3165  Betaine-aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 492 aa  1003    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4560  betaine-aldehyde dehydrogenase  68.67 
 
 		 496 aa  677    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.288864  hitchhiker  0.00438962 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4095  betaine-aldehyde dehydrogenase  68.46 
 
 		 496 aa  674    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0960  aldehyde dehydrogenase  80.61 
 
 		 491 aa  794    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4241  aldehyde dehydrogenase  68.7 
 
 		 498 aa  706    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3957  aldehyde dehydrogenase  59.75 
 
 		 489 aa  572  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0142  aldehyde dehydrogenase  59.01 
 
 		 489 aa  561  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4111  Aldehyde Dehydrogenase  55.93 
 
 		 516 aa  552  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0825  aldehyde dehydrogenase  54.36 
 
 		 499 aa  530  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0181  aldehyde dehydrogenase  50.76 
 
 		 478 aa  489  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1004  betaine-aldehyde dehydrogenase  49.06 
 
 		 492 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4430  betaine aldehyde dehydrogenase, NAD-dependent  50.86 
 
 		 496 aa  479  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.81725  normal  0.345273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2088  betaine-aldehyde dehydrogenase  51.42 
 
 		 483 aa  451  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.214438  normal  0.175719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  44.4 
 
 		 493 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  44.4 
 
 		 493 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.93 
 
 		 493 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.41 
 
 		 498 aa  413  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.48 
 
 		 493 aa  409  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  41.53 
 
 		 490 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  43.04 
 
 		 502 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  43.27 
 
 		 493 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  43.48 
 
 		 493 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  43.15 
 
 		 493 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  43.06 
 
 		 493 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1164  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.46 
 
 		 512 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4697  aldehyde dehydrogenase  41.29 
 
 		 496 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754003  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4941  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.83 
 
 		 498 aa  395  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  42.44 
 
 		 473 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  42.36 
 
 		 496 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  41.77 
 
 		 493 aa  390  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2213  aldehyde dehydrogenase  43.13 
 
 		 490 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00475065  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  40.72 
 
 		 503 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2154  aldehyde dehydrogenase  41.52 
 
 		 489 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0965  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  40.66 
 
 		 507 aa  376  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2295  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  43.6 
 
 		 491 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13620  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.29 
 
 		 497 aa  378  1e-103  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  41.21 
 
 		 490 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  41.51 
 
 		 510 aa  373  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1838  Aldehyde Dehydrogenase  42 
 
 		 494 aa  373  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  39.92 
 
 		 499 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  41 
 
 		 490 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  39.01 
 
 		 488 aa  369  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  39.22 
 
 		 488 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0940  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  41.95 
 
 		 487 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2265  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  41.95 
 
 		 487 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  41.59 
 
 		 505 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1025  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  41.95 
 
 		 487 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.230435  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0958  aldehyde dehydrogenase  40 
 
 		 492 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.938749  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  40.56 
 
 		 494 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1138  5-carboxy-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  41.74 
 
 		 487 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.75141  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1966  Aldehyde Dehydrogenase  40.49 
 
 		 478 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.57596 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0158  aldehyde dehydrogenase  40.25 
 
 		 495 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0153  aldehyde dehydrogenase  40.25 
 
 		 495 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1733  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  41.77 
 
 		 487 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  42.74 
 
 		 483 aa  368  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0102  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  41.74 
 
 		 487 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.371818  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.17 
 
 		 490 aa  368  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1511  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  41.74 
 
 		 487 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0625314  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2758  Betaine-aldehyde dehydrogenase  40.5 
 
 		 482 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  40.56 
 
 		 494 aa  364  1e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  40.56 
 
 		 494 aa  364  1e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  40.56 
 
 		 494 aa  364  1e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  40.56 
 
 		 494 aa  364  1e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  40.56 
 
 		 494 aa  364  1e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  40.34 
 
 		 494 aa  365  1e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2084  aldehyde dehydrogenase  42.39 
 
 		 497 aa  364  2e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  40.34 
 
 		 494 aa  364  2e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  40.13 
 
 		 494 aa  364  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  39.09 
 
 		 491 aa  364  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4824  aldehyde dehydrogenase  40.93 
 
 		 492 aa  364  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00512486  normal  0.364288 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  39.91 
 
 		 494 aa  364  2e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  40.78 
 
 		 497 aa  363  3e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  39.83 
 
 		 494 aa  363  4e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4323  aldehyde dehydrogenase  39.62 
 
 		 503 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  39.79 
 
 		 492 aa  362  6e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.83 
 
 		 494 aa  362  6e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  38.16 
 
 		 490 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  38.83 
 
 		 494 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  42.12 
 
 		 483 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.06 
 
 		 493 aa  362  9e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.83 
 
 		 494 aa  362  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>