More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4430 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_4430  betaine aldehyde dehydrogenase, NAD-dependent  100 
 
 
496 aa  1004    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.81725  normal  0.345273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2088  betaine-aldehyde dehydrogenase  67.47 
 
 
483 aa  610  1e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.214438  normal  0.175719 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4241  aldehyde dehydrogenase  56.28 
 
 
498 aa  531  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7067  Aldehyde Dehydrogenase  56.28 
 
 
496 aa  526  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3577  betaine-aldehyde dehydrogenase  55.53 
 
 
491 aa  518  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162462  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1493  aldehyde dehydrogenase family protein  54.28 
 
 
488 aa  520  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0183  betaine-aldehyde dehydrogenase  55.19 
 
 
499 aa  521  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352909  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3992  betaine-aldehyde dehydrogenase  56.01 
 
 
496 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254336  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1113  betaine-aldehyde dehydrogenase  56.01 
 
 
496 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.016361  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0181  aldehyde dehydrogenase  55.97 
 
 
478 aa  514  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0587  aldehyde dehydrogenase family protein  54.07 
 
 
496 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1328  aldehyde dehydrogenase family protein  54.07 
 
 
496 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2502  aldehyde dehydrogenase family protein  54.49 
 
 
496 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1315  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  54.07 
 
 
496 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.953752  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0311  aldehyde dehydrogenase family protein  54.07 
 
 
496 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0753946  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1242  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  54.49 
 
 
496 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3666  betaine-aldehyde dehydrogenase  55.58 
 
 
496 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0980  aldehyde dehydrogenase family protein  54.07 
 
 
496 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.340649  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5599  betaine-aldehyde dehydrogenase  55.79 
 
 
496 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0279735  normal  0.51588 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4701  betaine-aldehyde dehydrogenase  55.58 
 
 
496 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00415207  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4560  betaine-aldehyde dehydrogenase  54.94 
 
 
496 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.288864  hitchhiker  0.00438962 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4095  betaine-aldehyde dehydrogenase  54.94 
 
 
496 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4502  Aldehyde Dehydrogenase  54.37 
 
 
500 aa  501  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319143  normal  0.917567 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4634  Aldehyde Dehydrogenase  54.37 
 
 
500 aa  501  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20636  normal  0.0898533 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3685  betaine-aldehyde dehydrogenase  52.06 
 
 
495 aa  497  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3165  Betaine-aldehyde dehydrogenase  50.86 
 
 
492 aa  492  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1004  betaine-aldehyde dehydrogenase  50.32 
 
 
492 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3957  aldehyde dehydrogenase  53.45 
 
 
489 aa  480  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0960  aldehyde dehydrogenase  51.84 
 
 
491 aa  481  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0142  aldehyde dehydrogenase  51.83 
 
 
489 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4111  Aldehyde Dehydrogenase  51.93 
 
 
516 aa  466  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0825  aldehyde dehydrogenase  51.72 
 
 
499 aa  456  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  47.08 
 
 
493 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4323  aldehyde dehydrogenase  46.81 
 
 
503 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 
490 aa  402  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2290  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.88 
 
 
503 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  43.87 
 
 
493 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  43.87 
 
 
493 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  43.54 
 
 
493 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.75 
 
 
493 aa  393  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4697  aldehyde dehydrogenase  40.16 
 
 
496 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754003  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2524  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.44 
 
 
509 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.70277  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  43.69 
 
 
503 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.75 
 
 
493 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  43.87 
 
 
493 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  43.87 
 
 
493 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.67 
 
 
498 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  43.33 
 
 
493 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1164  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.6 
 
 
512 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5505  Aldehyde Dehydrogenase  44.84 
 
 
504 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000574808 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4941  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.08 
 
 
498 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  42.74 
 
 
502 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  43.28 
 
 
499 aa  378  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7156  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.68 
 
 
494 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2720  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.53 
 
 
496 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133505  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1970  aldehyde dehydrogenase  40.75 
 
 
494 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0798984  normal  0.254214 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2295  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  41.76 
 
 
491 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1250  aldehyde dehydrogenase  41.44 
 
 
503 aa  369  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.790003 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6789  Aldehyde Dehydrogenase  41.84 
 
 
495 aa  365  1e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772669  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2476  aldehyde dehydrogenase  40.13 
 
 
497 aa  365  1e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.124158  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6831  aldehyde dehydrogenase  41.82 
 
 
493 aa  365  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  42.5 
 
 
497 aa  364  2e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2154  aldehyde dehydrogenase  39.62 
 
 
489 aa  363  3e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  40.71 
 
 
488 aa  363  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  41.05 
 
 
473 aa  363  4e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2213  aldehyde dehydrogenase  41.83 
 
 
490 aa  363  6e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00475065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.87 
 
 
494 aa  362  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3107  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  42.55 
 
 
503 aa  361  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  42.58 
 
 
505 aa  361  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  42.24 
 
 
487 aa  359  7e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.51 
 
 
488 aa  358  9e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  40.78 
 
 
491 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.43 
 
 
494 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5267  aldehyde dehydrogenase  44.54 
 
 
493 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  40.34 
 
 
490 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  43.28 
 
 
496 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  40.26 
 
 
494 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  40.76 
 
 
490 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.3 
 
 
488 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  41.72 
 
 
488 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13620  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.5 
 
 
497 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  39.46 
 
 
488 aa  357  2.9999999999999997e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0153  aldehyde dehydrogenase  40.58 
 
 
495 aa  357  2.9999999999999997e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0158  aldehyde dehydrogenase  40.58 
 
 
495 aa  357  2.9999999999999997e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  40.43 
 
 
494 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1838  Aldehyde Dehydrogenase  40.9 
 
 
494 aa  357  2.9999999999999997e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  41.09 
 
 
488 aa  356  5e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.58 
 
 
494 aa  356  5e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.09 
 
 
488 aa  356  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  39.38 
 
 
494 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  39.38 
 
 
494 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1147  betaine aldehyde dehydrogenase  42.44 
 
 
488 aa  355  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  39.38 
 
 
494 aa  355  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  41.54 
 
 
506 aa  355  1e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  40.04 
 
 
494 aa  354  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  39.25 
 
 
488 aa  354  2e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.04 
 
 
494 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  41.51 
 
 
488 aa  354  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1006  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.3 
 
 
491 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.179638  normal  0.457717 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5173  Aldehyde Dehydrogenase  41.72 
 
 
503 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>