More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4111 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4111  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 		 516 aa  1039    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3165  Betaine-aldehyde dehydrogenase  55.93 
 
 		 492 aa  558  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4241  aldehyde dehydrogenase  56.96 
 
 		 498 aa  560  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0825  aldehyde dehydrogenase  58.88 
 
 		 499 aa  553  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7067  Aldehyde Dehydrogenase  55.93 
 
 		 496 aa  550  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0183  betaine-aldehyde dehydrogenase  55.51 
 
 		 499 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3577  betaine-aldehyde dehydrogenase  55.51 
 
 		 491 aa  542  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162462  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3685  betaine-aldehyde dehydrogenase  54.87 
 
 		 495 aa  543  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4502  Aldehyde Dehydrogenase  55.72 
 
 		 500 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319143  normal  0.917567 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1493  aldehyde dehydrogenase family protein  56.13 
 
 		 488 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4634  Aldehyde Dehydrogenase  55.72 
 
 		 500 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20636  normal  0.0898533 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5599  betaine-aldehyde dehydrogenase  56.55 
 
 		 496 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0279735  normal  0.51588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1113  betaine-aldehyde dehydrogenase  56.55 
 
 		 496 aa  534  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.016361  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0142  aldehyde dehydrogenase  57.14 
 
 		 489 aa  533  1e-150  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0960  aldehyde dehydrogenase  55.3 
 
 		 491 aa  534  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4560  betaine-aldehyde dehydrogenase  56.76 
 
 		 496 aa  531  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.288864  hitchhiker  0.00438962 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2502  aldehyde dehydrogenase family protein  56.34 
 
 		 496 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1315  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  56.34 
 
 		 496 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.953752  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1242  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  56.34 
 
 		 496 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3666  betaine-aldehyde dehydrogenase  56.13 
 
 		 496 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4095  betaine-aldehyde dehydrogenase  56.55 
 
 		 496 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4701  betaine-aldehyde dehydrogenase  56.13 
 
 		 496 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00415207  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0311  aldehyde dehydrogenase family protein  55.93 
 
 		 496 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0753946  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1328  aldehyde dehydrogenase family protein  55.93 
 
 		 496 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3957  aldehyde dehydrogenase  55.49 
 
 		 489 aa  525  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0980  aldehyde dehydrogenase family protein  55.93 
 
 		 496 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.340649  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3992  betaine-aldehyde dehydrogenase  55.72 
 
 		 496 aa  526  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254336  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0587  aldehyde dehydrogenase family protein  55.93 
 
 		 496 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1004  betaine-aldehyde dehydrogenase  48.03 
 
 		 492 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4430  betaine aldehyde dehydrogenase, NAD-dependent  51.93 
 
 		 496 aa  458  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.81725  normal  0.345273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2088  betaine-aldehyde dehydrogenase  52.47 
 
 		 483 aa  451  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.214438  normal  0.175719 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0181  aldehyde dehydrogenase  48.16 
 
 		 478 aa  434  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  39.59 
 
 		 490 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.89 
 
 		 498 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1164  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.62 
 
 		 512 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  40.7 
 
 		 493 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.12 
 
 		 493 aa  371  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  39.49 
 
 		 502 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4323  aldehyde dehydrogenase  41.63 
 
 		 503 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2213  aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 		 490 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00475065  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.29 
 
 		 493 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  40.41 
 
 		 493 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  41.31 
 
 		 493 aa  363  4e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  40.41 
 
 		 493 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  40.41 
 
 		 493 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  40.29 
 
 		 493 aa  362  8e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  40 
 
 		 493 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2524  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.66 
 
 		 509 aa  361  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.70277  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  40.12 
 
 		 496 aa  359  5e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4697  aldehyde dehydrogenase  38.57 
 
 		 496 aa  358  9e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754003  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  37.95 
 
 		 473 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2290  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.92 
 
 		 503 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  39.63 
 
 		 503 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13620  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.6 
 
 		 497 aa  354  2e-96  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  40.17 
 
 		 488 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.17 
 
 		 488 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70950  betaine aldehyde dehydrogenase  39.09 
 
 		 490 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.934353 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4941  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.48 
 
 		 498 aa  351  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.13 
 
 		 488 aa  350  4e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6158  betaine aldehyde dehydrogenase  38.89 
 
 		 490 aa  349  8e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  41.91 
 
 		 504 aa  348  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  39.7 
 
 		 497 aa  347  2e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6789  Aldehyde Dehydrogenase  42.4 
 
 		 495 aa  348  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772669  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.13 
 
 		 488 aa  348  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5505  Aldehyde Dehydrogenase  40.73 
 
 		 504 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000574808 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  39.92 
 
 		 505 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  39.13 
 
 		 488 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  38.21 
 
 		 494 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  39.09 
 
 		 499 aa  346  7e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  37.39 
 
 		 494 aa  345  8e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  37.39 
 
 		 494 aa  345  8e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  37.39 
 
 		 494 aa  345  8e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  37.39 
 
 		 494 aa  345  8e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  37.39 
 
 		 494 aa  345  8e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  37.11 
 
 		 494 aa  345  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  39.58 
 
 		 490 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  36.78 
 
 		 488 aa  344  2e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3174  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  37.47 
 
 		 487 aa  344  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000466622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  37.11 
 
 		 494 aa  344  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2295  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  40.51 
 
 		 491 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  38.98 
 
 		 491 aa  345  2e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  37.11 
 
 		 494 aa  343  4e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  36.69 
 
 		 494 aa  343  4e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6831  aldehyde dehydrogenase  40.72 
 
 		 493 aa  343  4e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4824  aldehyde dehydrogenase  40.46 
 
 		 492 aa  342  8e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00512486  normal  0.364288 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04229  5-carboxy-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  39.26 
 
 		 488 aa  342  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3703  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  39.05 
 
 		 488 aa  341  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.195699 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04195  hypothetical protein  39.26 
 
 		 488 aa  342  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  38.33 
 
 		 488 aa  342  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1177  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  39.63 
 
 		 488 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.585771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3610  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  40.69 
 
 		 503 aa  341  2e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  38.32 
 
 		 490 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  37.32 
 
 		 490 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3822  Aldehyde Dehydrogenase  38.79 
 
 		 518 aa  340  4e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.959646  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4889  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  39.05 
 
 		 488 aa  340  4e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4583  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  39.05 
 
 		 488 aa  340  4e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1166  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  39.21 
 
 		 488 aa  340  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.608265  normal  0.856893 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1212  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  39.42 
 
 		 488 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5173  Aldehyde Dehydrogenase  38.51 
 
 		 503 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.82 
 
 		 496 aa  339  5.9999999999999996e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>