More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4502 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0311  aldehyde dehydrogenase family protein  67.94 
 
 
496 aa  685    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0753946  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3165  Betaine-aldehyde dehydrogenase  79.3 
 
 
492 aa  806    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4560  betaine-aldehyde dehydrogenase  70.47 
 
 
496 aa  688    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.288864  hitchhiker  0.00438962 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1328  aldehyde dehydrogenase family protein  67.94 
 
 
496 aa  685    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0587  aldehyde dehydrogenase family protein  67.94 
 
 
496 aa  685    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3577  betaine-aldehyde dehydrogenase  88.48 
 
 
491 aa  898    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162462  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4634  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
500 aa  1024    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20636  normal  0.0898533 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2502  aldehyde dehydrogenase family protein  68.35 
 
 
496 aa  687    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1113  betaine-aldehyde dehydrogenase  70.47 
 
 
496 aa  688    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.016361  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0960  aldehyde dehydrogenase  80.45 
 
 
491 aa  784    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1493  aldehyde dehydrogenase family protein  69.36 
 
 
488 aa  698    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0980  aldehyde dehydrogenase family protein  67.94 
 
 
496 aa  685    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.340649  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3685  betaine-aldehyde dehydrogenase  80.36 
 
 
495 aa  819    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3992  betaine-aldehyde dehydrogenase  70.47 
 
 
496 aa  692    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254336  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1315  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  68.15 
 
 
496 aa  686    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.953752  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0183  betaine-aldehyde dehydrogenase  69.65 
 
 
499 aa  707    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352909  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4241  aldehyde dehydrogenase  70.47 
 
 
498 aa  717    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3666  betaine-aldehyde dehydrogenase  70.06 
 
 
496 aa  685    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4095  betaine-aldehyde dehydrogenase  70.47 
 
 
496 aa  689    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7067  Aldehyde Dehydrogenase  69.25 
 
 
496 aa  704    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4502  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
500 aa  1024    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319143  normal  0.917567 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5599  betaine-aldehyde dehydrogenase  70.47 
 
 
496 aa  688    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0279735  normal  0.51588 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1242  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  68.35 
 
 
496 aa  687    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4701  betaine-aldehyde dehydrogenase  70.06 
 
 
496 aa  685    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00415207  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0142  aldehyde dehydrogenase  61.57 
 
 
489 aa  598  1e-170  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3957  aldehyde dehydrogenase  61.11 
 
 
489 aa  597  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4111  Aldehyde Dehydrogenase  55.72 
 
 
516 aa  542  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0825  aldehyde dehydrogenase  55.6 
 
 
499 aa  529  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4430  betaine aldehyde dehydrogenase, NAD-dependent  54.37 
 
 
496 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.81725  normal  0.345273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0181  aldehyde dehydrogenase  51.52 
 
 
478 aa  483  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1004  betaine-aldehyde dehydrogenase  46.97 
 
 
492 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2088  betaine-aldehyde dehydrogenase  51.87 
 
 
483 aa  449  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.214438  normal  0.175719 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.95 
 
 
493 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  45.32 
 
 
493 aa  425  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  44.91 
 
 
493 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  43.27 
 
 
490 aa  424  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  44.7 
 
 
493 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  44.7 
 
 
493 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.62 
 
 
498 aa  419  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  44.91 
 
 
493 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  44.7 
 
 
493 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.7 
 
 
493 aa  413  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  43.24 
 
 
502 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4941  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.7 
 
 
498 aa  396  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1164  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.46 
 
 
512 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  45.04 
 
 
496 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4697  aldehyde dehydrogenase  40.42 
 
 
496 aa  391  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754003  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  41.26 
 
 
473 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  43.07 
 
 
505 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2154  aldehyde dehydrogenase  42.24 
 
 
489 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0958  aldehyde dehydrogenase  40.2 
 
 
492 aa  383  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.938749  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  42.5 
 
 
493 aa  384  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  41.01 
 
 
490 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  39.8 
 
 
503 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  40.99 
 
 
494 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  40.99 
 
 
494 aa  378  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  40.99 
 
 
494 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  39.39 
 
 
488 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  40.77 
 
 
494 aa  376  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2213  aldehyde dehydrogenase  42.64 
 
 
490 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00475065  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  42.8 
 
 
504 aa  378  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  40.99 
 
 
494 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  40.99 
 
 
494 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  44.02 
 
 
483 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  40.77 
 
 
494 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2295  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  43.29 
 
 
491 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  40.77 
 
 
494 aa  375  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1966  Aldehyde Dehydrogenase  41.96 
 
 
478 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.57596 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  39.18 
 
 
488 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  40.56 
 
 
494 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1838  Aldehyde Dehydrogenase  39.84 
 
 
494 aa  374  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  40.48 
 
 
490 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.4 
 
 
493 aa  372  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6789  Aldehyde Dehydrogenase  44.02 
 
 
495 aa  371  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772669  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  41.16 
 
 
494 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1054  Aldehyde Dehydrogenase  42.2 
 
 
513 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4824  aldehyde dehydrogenase  41.83 
 
 
492 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00512486  normal  0.364288 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7156  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.14 
 
 
494 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  39.91 
 
 
494 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.59 
 
 
490 aa  372  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13620  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40 
 
 
497 aa  369  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  41.42 
 
 
510 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0158  aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 
495 aa  366  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0153  aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 
495 aa  366  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2084  aldehyde dehydrogenase  42.22 
 
 
497 aa  368  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  40.73 
 
 
494 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  40.73 
 
 
494 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  41.16 
 
 
494 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.46 
 
 
494 aa  368  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  41.85 
 
 
483 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2758  Betaine-aldehyde dehydrogenase  40.45 
 
 
482 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.98 
 
 
508 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  40.73 
 
 
494 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.73 
 
 
494 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  41.08 
 
 
494 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  41.56 
 
 
494 aa  366  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.95 
 
 
494 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  39.71 
 
 
499 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5505  Aldehyde Dehydrogenase  41.08 
 
 
504 aa  369  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000574808 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.91 
 
 
494 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>