More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1410 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1410  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
488 aa  1011    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5132  aldehyde dehydrogenase  60.37 
 
 
499 aa  620  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.223972  normal  0.0301886 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5206  2-aminomuconic 6-semialdehyde dehydrogenase  57.17 
 
 
487 aa  586  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.532716  normal  0.251126 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2012  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  56.67 
 
 
490 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.981188 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1147  2-aminomuconic 6-semialdehyde dehydrogenase  55.09 
 
 
492 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5498  aldehyde dehydrogenase  56.88 
 
 
487 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0685  betaine-aldehyde dehydrogenase  54.36 
 
 
485 aa  574  1.0000000000000001e-162  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3903  aldehyde dehydrogenase  54.77 
 
 
493 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3519  aldehyde dehydrogenase  55.51 
 
 
496 aa  553  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.116391 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1465  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  57.14 
 
 
496 aa  554  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7647  betaine-aldehyde dehydrogenase  57.05 
 
 
496 aa  549  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3528  aldehyde dehydrogenase  53.53 
 
 
501 aa  550  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.757321  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1476  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  54.89 
 
 
504 aa  542  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08730  2-hydroxymuconic semi-aldehyde dehydrogenase  55.9 
 
 
486 aa  544  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3092  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  52.81 
 
 
486 aa  540  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.169742  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2775  aldehyde dehydrogenase  52.6 
 
 
486 aa  531  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000107521  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9116  Betaine-aldehyde dehydrogenase  53.21 
 
 
484 aa  531  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3787  aldehyde dehydrogenase  53.85 
 
 
484 aa  526  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169768  hitchhiker  0.0011277 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1322  aldehyde dehydrogenase  51.98 
 
 
503 aa  526  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0143114  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3354  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  53.44 
 
 
484 aa  527  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2275  putative 5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  54.7 
 
 
484 aa  526  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2787  betaine-aldehyde dehydrogenase  52.82 
 
 
484 aa  522  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.216415 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30620  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase; LapC  49.9 
 
 
486 aa  523  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141179  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3806  aldehyde dehydrogenase  52.76 
 
 
489 aa  524  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657404 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5689  betaine-aldehyde dehydrogenase  52.82 
 
 
484 aa  523  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4622  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  53.24 
 
 
484 aa  525  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3546  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  53.24 
 
 
484 aa  525  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.740042  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0890  putative 5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  51.34 
 
 
488 aa  520  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2962  betaine-aldehyde dehydrogenase  51.98 
 
 
534 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.293572  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0220  betaine-aldehyde dehydrogenase  52.19 
 
 
486 aa  511  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3855  aldehyde dehydrogenase  52.59 
 
 
494 aa  496  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146546  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2295  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  47.29 
 
 
491 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1622  Betaine-aldehyde dehydrogenase  45.42 
 
 
478 aa  436  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07430  hypothetical protein  42.15 
 
 
481 aa  424  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.782737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2154  aldehyde dehydrogenase  39.83 
 
 
489 aa  386  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0539  Betaine-aldehyde dehydrogenase  44.17 
 
 
478 aa  383  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.809876  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3326  putative 5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  55.29 
 
 
340 aa  384  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0237  Betaine-aldehyde dehydrogenase  42.83 
 
 
493 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2459  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  38.56 
 
 
488 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2555  betaine aldehyde dehydrogenase  40.29 
 
 
490 aa  376  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0789453  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2038  Aldehyde Dehydrogenase  41.39 
 
 
484 aa  376  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2507  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  42.92 
 
 
503 aa  376  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4206  aldehyde dehydrogenase  42.65 
 
 
487 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0338  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  41.1 
 
 
513 aa  373  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2577  aldehyde dehydrogenase  40.76 
 
 
484 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2363  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  38.14 
 
 
488 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.702786  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3174  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  36.83 
 
 
487 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000466622  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1515  betaine aldehyde dehydrogenase  41.77 
 
 
494 aa  373  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  38.88 
 
 
494 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  38.88 
 
 
494 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  38.88 
 
 
494 aa  371  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  38.88 
 
 
494 aa  371  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06180  betaine aldehyde dehydrogenase  41.54 
 
 
486 aa  372  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  38.88 
 
 
494 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000365  betaine aldehyde dehydrogenase  41.34 
 
 
486 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0965  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  41.08 
 
 
507 aa  369  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4583  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  36.65 
 
 
488 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04229  5-carboxy-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  36.65 
 
 
488 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  39.42 
 
 
503 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  38.46 
 
 
494 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  38.25 
 
 
494 aa  365  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  38.46 
 
 
494 aa  368  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1212  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  36.31 
 
 
488 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.63 
 
 
494 aa  368  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  38.46 
 
 
494 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.42 
 
 
494 aa  366  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2406  aldehyde dehydrogenase  39.71 
 
 
484 aa  368  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3703  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  36.65 
 
 
488 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.195699 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0050  phenylacetaldehyde dehydrogenase  42.2 
 
 
501 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1197  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  36.31 
 
 
488 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  38.27 
 
 
483 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1177  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  36.31 
 
 
488 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.585771  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04195  hypothetical protein  36.65 
 
 
488 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.12 
 
 
498 aa  366  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1166  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  36.1 
 
 
488 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.608265  normal  0.856893 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1061  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  36.31 
 
 
488 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4889  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  36.65 
 
 
488 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  39.63 
 
 
494 aa  364  2e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  39.63 
 
 
494 aa  363  3e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.83 
 
 
494 aa  363  3e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  39.63 
 
 
494 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  39.63 
 
 
494 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  38.59 
 
 
502 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  38.96 
 
 
497 aa  362  6e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4441  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  41.59 
 
 
505 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.411822 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.42 
 
 
494 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  39.42 
 
 
494 aa  362  8e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  39.17 
 
 
494 aa  362  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3107  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  39.42 
 
 
503 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2071  betaine aldehyde dehydrogenase  40.33 
 
 
488 aa  360  3e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.83958 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2916  betaine aldehyde dehydrogenase  39.31 
 
 
490 aa  360  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  37.37 
 
 
483 aa  360  4e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1100  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.86 
 
 
493 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.486917 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5243  betaine aldehyde dehydrogenase  40 
 
 
490 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0991696  normal  0.0622571 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  37.84 
 
 
494 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6158  betaine aldehyde dehydrogenase  38.89 
 
 
490 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4080  betaine aldehyde dehydrogenase  39.71 
 
 
485 aa  357  2.9999999999999997e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  36.8 
 
 
473 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1147  betaine aldehyde dehydrogenase  40 
 
 
488 aa  357  3.9999999999999996e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  38.46 
 
 
490 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>