More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0649 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  62.57 
 
 
681 aa  867    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.42 
 
 
684 aa  705    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.92 
 
 
686 aa  688    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  55.62 
 
 
679 aa  772    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.83 
 
 
683 aa  708    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  62.57 
 
 
681 aa  868    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.43 
 
 
686 aa  744    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  62.28 
 
 
681 aa  864    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0748  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  49.78 
 
 
675 aa  637    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.62 
 
 
684 aa  739    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  62.39 
 
 
690 aa  877    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.42 
 
 
684 aa  709    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4152  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.66 
 
 
686 aa  663    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39195  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
683 aa  1418    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.49 
 
 
684 aa  708    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.83 
 
 
682 aa  720    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.02 
 
 
690 aa  714    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  62.43 
 
 
681 aa  865    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.37 
 
 
695 aa  680    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.69 
 
 
683 aa  699    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4804  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  49.71 
 
 
686 aa  649    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27422 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26540  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  46.69 
 
 
681 aa  630  1e-179  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.212629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5320  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  47.58 
 
 
675 aa  613  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248137  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0934  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  49.63 
 
 
691 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0437  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  47.56 
 
 
676 aa  614  9.999999999999999e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.68112 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1910  phenylacetic acid degradation protein paaN  47.2 
 
 
686 aa  612  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0031  phenylacetic acid degradation protein paaN  47.57 
 
 
678 aa  612  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300256  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0907  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.53 
 
 
687 aa  608  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338542  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1832  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  47.65 
 
 
678 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05275  aldehyde dehydrogenase  46.88 
 
 
836 aa  602  1.0000000000000001e-171  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3827  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  46.53 
 
 
678 aa  601  1e-170  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.145671  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1925  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  48.78 
 
 
679 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838003  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  47.86 
 
 
685 aa  593  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0685  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  46.9 
 
 
674 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0658  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  45.95 
 
 
664 aa  582  1.0000000000000001e-165  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3636  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  47.66 
 
 
678 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2485  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  45.12 
 
 
683 aa  570  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00712993  hitchhiker  0.00576818 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20290  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.38 
 
 
706 aa  560  1e-158  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0650346  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3053  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  45.68 
 
 
702 aa  560  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3255  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  44.03 
 
 
703 aa  559  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.607573  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0094  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  42.65 
 
 
688 aa  548  1e-154  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0895  aldehyde dehydrogenase  40.5 
 
 
531 aa  369  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.335826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1625  aldehyde dehydrogenase  37.86 
 
 
518 aa  337  2.9999999999999997e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0898756  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2699  aldehyde dehydrogenase  37.76 
 
 
531 aa  337  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3656  aldehyde dehydrogenase  38.16 
 
 
519 aa  333  4e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1420  aldehyde dehydrogenase  37.55 
 
 
531 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0677446  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2947  aldehyde dehydrogenase  38.67 
 
 
523 aa  327  4.0000000000000003e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.738502  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0090  aldehyde dehydrogenase  37.7 
 
 
516 aa  323  8e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4944  Aldehyde Dehydrogenase  39.49 
 
 
517 aa  320  7e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141691  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0217  aldehyde dehydrogenase  36.35 
 
 
520 aa  298  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1607  dehydratase  39.13 
 
 
515 aa  126  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.244807  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  28.34 
 
 
517 aa  123  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  26.49 
 
 
485 aa  121  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2695  aldehyde dehydrogenase  30.95 
 
 
477 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.152226  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000365  betaine aldehyde dehydrogenase  27.4 
 
 
486 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0240  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.39 
 
 
491 aa  118  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.183603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  28.19 
 
 
512 aa  118  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0207  aldehyde dehydrogenase  28.38 
 
 
491 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0428  betaine-aldehyde dehydrogenase  26.7 
 
 
492 aa  117  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0260686  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0227  aldehyde dehydrogenase  28.38 
 
 
491 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.596332  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0217  aldehyde dehydrogenase  28.38 
 
 
491 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5200  aldehyde dehydrogenase  28.48 
 
 
493 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10225  aldehyde dehydrogenase  26.77 
 
 
487 aa  114  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.749667  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4593  aldehyde dehydrogenase  28.57 
 
 
487 aa  114  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1708  Betaine-aldehyde dehydrogenase  28.31 
 
 
494 aa  114  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6321  aldehyde dehydrogenase  28.35 
 
 
478 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1758  aldehyde dehydrogenase  28.35 
 
 
478 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4080  betaine aldehyde dehydrogenase  27 
 
 
485 aa  114  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4470  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.12 
 
 
483 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.740479  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0073  aldehyde dehydrogenase  27.57 
 
 
468 aa  113  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1410  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  26.65 
 
 
488 aa  112  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1682  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.67 
 
 
502 aa  112  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1677  aldehyde dehydrogenase  27.67 
 
 
478 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2788  betaine-aldehyde dehydrogenase  25.89 
 
 
493 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5206  2-aminomuconic 6-semialdehyde dehydrogenase  27.38 
 
 
487 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.532716  normal  0.251126 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0646  succinate semialdehyde dehydrogenase  28.76 
 
 
459 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70950  betaine aldehyde dehydrogenase  27.47 
 
 
490 aa  111  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.934353 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  28.39 
 
 
490 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2916  betaine aldehyde dehydrogenase  27.97 
 
 
490 aa  110  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6785  aldehyde dehydrogenase  30.04 
 
 
486 aa  110  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  25.52 
 
 
496 aa  109  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  25.52 
 
 
496 aa  109  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1833  betaine aldehyde dehydrogenase  28.02 
 
 
490 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.330385 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4733  betaine aldehyde dehydrogenase  27.52 
 
 
490 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187184  normal  0.498706 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6158  betaine aldehyde dehydrogenase  27.25 
 
 
490 aa  109  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2555  betaine aldehyde dehydrogenase  27.06 
 
 
490 aa  108  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0789453  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0544  Aldehyde Dehydrogenase_  25.67 
 
 
477 aa  108  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.257528  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  25.75 
 
 
496 aa  108  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2290  betaine-aldehyde dehydrogenase  26.68 
 
 
503 aa  108  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3700  aldehyde dehydrogenase  27.98 
 
 
484 aa  108  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  25.17 
 
 
493 aa  108  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2524  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  25.96 
 
 
509 aa  108  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.70277  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  28.69 
 
 
494 aa  107  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1357  aldehyde dehydrogenase  26.86 
 
 
487 aa  107  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3379  phenylacetaldehyde dehydrogenase  28.34 
 
 
494 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1515  betaine aldehyde dehydrogenase  28.06 
 
 
494 aa  107  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1944  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.46 
 
 
474 aa  107  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0167894  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3372  phenylacetaldehyde dehydrogenase  28.57 
 
 
494 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5054  aldehyde dehydrogenase  25.99 
 
 
478 aa  106  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3305  phenylacetaldehyde dehydrogenase  28.34 
 
 
494 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>