More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0748 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.04 
 
 		 683 aa  664    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0907  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  61.78 
 
 		 687 aa  810    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  54.15 
 
 		 686 aa  712    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.31 
 
 		 681 aa  639    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.72 
 
 		 686 aa  654    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.44 
 
 		 682 aa  671    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.31 
 
 		 681 aa  640    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0748  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 675 aa  1369    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4804  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  60.77 
 
 		 686 aa  802    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.27422 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.31 
 
 		 681 aa  639    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  54.96 
 
 		 679 aa  733    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3053  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.62 
 
 		 702 aa  669    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.04 
 
 		 684 aa  635    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3636  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  60.89 
 
 		 678 aa  783    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4152  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  60.48 
 
 		 686 aa  796    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0658  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  61.37 
 
 		 664 aa  773    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26540  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  59.05 
 
 		 681 aa  774    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.212629 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0685  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  60.36 
 
 		 674 aa  777    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.26 
 
 		 684 aa  678    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1832  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  60.44 
 
 		 678 aa  802    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0934  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  60.48 
 
 		 691 aa  771    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1910  phenylacetic acid degradation protein paaN  58.72 
 
 		 686 aa  760    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0302284  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.23 
 
 		 695 aa  651    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0437  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  63.6 
 
 		 676 aa  851    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.68112 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20290  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.67 
 
 		 706 aa  647    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0650346  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3827  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  62.84 
 
 		 678 aa  838    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.145671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2485  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  54.09 
 
 		 683 aa  704    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00712993  hitchhiker  0.00576818 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  58.67 
 
 		 690 aa  770    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1925  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  60.89 
 
 		 679 aa  799    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838003  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0031  phenylacetic acid degradation protein paaN  57.04 
 
 		 678 aa  728    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300256  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  61.93 
 
 		 685 aa  793    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5320  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  57.23 
 
 		 675 aa  740    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.248137  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.33 
 
 		 683 aa  635    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  49.78 
 
 		 683 aa  639    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.31 
 
 		 681 aa  641    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3255  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  52.84 
 
 		 703 aa  690    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.607573  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.04 
 
 		 684 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  53.04 
 
 		 684 aa  631  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0094  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  51.32 
 
 		 688 aa  627  1e-178  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  50.59 
 
 		 690 aa  626  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05275  aldehyde dehydrogenase  47.36 
 
 		 836 aa  584  1.0000000000000001e-165  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2699  aldehyde dehydrogenase  44.58 
 
 		 531 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0895  aldehyde dehydrogenase  44.68 
 
 		 531 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.335826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1625  aldehyde dehydrogenase  44.03 
 
 		 518 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0898756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1420  aldehyde dehydrogenase  43.97 
 
 		 531 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0677446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3656  aldehyde dehydrogenase  45.56 
 
 		 519 aa  378  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0090  aldehyde dehydrogenase  44.19 
 
 		 516 aa  372  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2947  aldehyde dehydrogenase  44.31 
 
 		 523 aa  359  9.999999999999999e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.738502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0217  aldehyde dehydrogenase  44.77 
 
 		 520 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4944  Aldehyde Dehydrogenase  43.98 
 
 		 517 aa  356  7.999999999999999e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1607  dehydratase  51.43 
 
 		 515 aa  167  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.244807  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2844  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.83 
 
 		 481 aa  119  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6113  Aldehyde Dehydrogenase  28.61 
 
 		 466 aa  117  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401659  normal  0.835317 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1075  Aldehyde Dehydrogenase  27.36 
 
 		 475 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4593  aldehyde dehydrogenase  29.36 
 
 		 487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  28.57 
 
 		 485 aa  111  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  28.51 
 
 		 500 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0870  Aldehyde Dehydrogenase  28.38 
 
 		 528 aa  110  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  31.12 
 
 		 484 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3717  aldehyde dehydrogenase  29 
 
 		 485 aa  108  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4113  Aldehyde Dehydrogenase  32.34 
 
 		 512 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.189618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4080  betaine aldehyde dehydrogenase  29.67 
 
 		 485 aa  108  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  27.37 
 
 		 510 aa  107  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0898  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  31.62 
 
 		 503 aa  107  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3410  Aldehyde Dehydrogenase  30.39 
 
 		 473 aa  107  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  27.63 
 
 		 512 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0387  aldehyde dehydrogenase family protein  28.61 
 
 		 473 aa  107  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1104  aldehyde dehydrogenase  28.49 
 
 		 474 aa  106  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2844  aldehyde dehydrogenase  27.72 
 
 		 482 aa  106  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281069  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0544  Aldehyde Dehydrogenase_  25.69 
 
 		 477 aa  105  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.257528  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.7 
 
 		 480 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2043  aldehyde dehydrogenase  31.49 
 
 		 470 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4630  aldehyde dehydrogenase  30.71 
 
 		 503 aa  105  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  28.36 
 
 		 517 aa  104  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5405  Aldehyde Dehydrogenase  28.38 
 
 		 529 aa  104  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2411  aldehyde dehydrogenase  31.41 
 
 		 516 aa  105  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5160  aldehyde dehydrogenase  30.43 
 
 		 503 aa  104  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.447339 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1983  putative piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  31.08 
 
 		 535 aa  104  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.467397  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2080  putative piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  31.08 
 
 		 535 aa  104  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0495  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  31.08 
 
 		 535 aa  104  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  27.18 
 
 		 510 aa  103  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  28.66 
 
 		 492 aa  103  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  28.46 
 
 		 493 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  28.89 
 
 		 481 aa  103  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3845  putative aldehyde dehydrogenase family protein  28.19 
 
 		 470 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0566  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  31.08 
 
 		 535 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0745334  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0678  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  31.08 
 
 		 535 aa  103  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.808953  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3589  aldehyde dehydrogenase  25.54 
 
 		 475 aa  103  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.927653  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4269  Aldehyde Dehydrogenase  27.92 
 
 		 496 aa  103  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2499  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.4 
 
 		 496 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00184375  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05194  putative benzaldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  30.34 
 
 		 492 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0026447  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0092  aldehyde dehydrogenase  28.35 
 
 		 467 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204667  normal  0.62822 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1631  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  31.08 
 
 		 503 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0779  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  31.08 
 
 		 503 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0381383  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6785  aldehyde dehydrogenase  31.29 
 
 		 486 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2788  betaine-aldehyde dehydrogenase  28.48 
 
 		 493 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  28.93 
 
 		 488 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1456  putative betaine aldehyde dehydrogenase (BADH) oxidoreductase protein  28.96 
 
 		 478 aa  102  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2916  betaine aldehyde dehydrogenase  27.38 
 
 		 490 aa  102  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5719  aldehyde dehydrogenase  32.07 
 
 		 511 aa  102  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>