More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2844 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  83.61 
 
 
485 aa  808    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2664  aldehyde dehydrogenase  87.24 
 
 
480 aa  837    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  66.39 
 
 
498 aa  642    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1732  Aldehyde Dehydrogenase  81.54 
 
 
478 aa  777    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0174509  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  64.3 
 
 
480 aa  636    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  66.11 
 
 
481 aa  652    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  77.1 
 
 
479 aa  751    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0452  aldehyde dehydrogenase  79.75 
 
 
480 aa  758    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1025  aldehyde dehydrogenase  79.54 
 
 
480 aa  757    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2844  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
482 aa  983    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281069  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3422  aldehyde dehydrogenase  69.31 
 
 
479 aa  667    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228587  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  83.19 
 
 
485 aa  805    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  66.39 
 
 
480 aa  649    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1598  aldehyde dehydrogenase  81.46 
 
 
479 aa  788    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  67.57 
 
 
479 aa  640    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1119  aldehyde dehydrogenase  69.94 
 
 
479 aa  655    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65747 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0247  aldehyde dehydrogenase  82.78 
 
 
482 aa  786    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  65.15 
 
 
477 aa  629  1e-179  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6489  aldehyde dehydrogenase  66.25 
 
 
482 aa  627  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  64.52 
 
 
477 aa  623  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  64.73 
 
 
477 aa  624  1e-177  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  62.63 
 
 
480 aa  618  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  63.69 
 
 
477 aa  618  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  63.07 
 
 
477 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  62.21 
 
 
475 aa  609  1e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6141  aldehyde dehydrogenase  67.99 
 
 
446 aa  598  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  63.88 
 
 
482 aa  595  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  59.66 
 
 
476 aa  590  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  62.03 
 
 
477 aa  590  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2694  aldehyde dehydrogenase family protein  59.21 
 
 
480 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  59.21 
 
 
480 aa  581  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1043  Aldehyde Dehydrogenase  57.59 
 
 
483 aa  569  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  57.98 
 
 
480 aa  569  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  58.71 
 
 
478 aa  563  1.0000000000000001e-159  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  58.53 
 
 
483 aa  558  1e-158  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3381  aldehyde dehydrogenase  55.25 
 
 
482 aa  529  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.464458  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1815  aldehyde dehydrogenase  55.16 
 
 
491 aa  524  1e-147  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2128  aldehyde dehydrogenase  54.45 
 
 
486 aa  520  1e-146  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0517784  hitchhiker  0.00570201 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05501  hypothetical protein  54.24 
 
 
486 aa  520  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  54.03 
 
 
486 aa  520  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0877  aldehyde dehydrogenase  53.39 
 
 
487 aa  511  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2256  aldehyde dehydrogenase  54.6 
 
 
478 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134767  hitchhiker  0.000000459097 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3017  aldehyde dehydrogenase  55.72 
 
 
478 aa  501  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1240  aldehyde dehydrogenase  52.94 
 
 
484 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.208234 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0813  aldehyde dehydrogenase  51.69 
 
 
482 aa  491  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1054  aldehyde dehydrogenase  64.53 
 
 
441 aa  480  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395537  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3959  Aldehyde Dehydrogenase  52.1 
 
 
482 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.424065  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  46.67 
 
 
482 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  46.38 
 
 
483 aa  395  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  44.61 
 
 
493 aa  387  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  42.35 
 
 
479 aa  385  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  42.17 
 
 
498 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  42.26 
 
 
503 aa  379  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  42.17 
 
 
497 aa  378  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  40.55 
 
 
499 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  47.81 
 
 
488 aa  375  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  39.75 
 
 
505 aa  362  6e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  41.2 
 
 
496 aa  362  9e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  44.26 
 
 
516 aa  362  1e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  47.36 
 
 
474 aa  361  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  41.49 
 
 
500 aa  360  3e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  42.14 
 
 
483 aa  358  9.999999999999999e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  42.32 
 
 
481 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3632  aldehyde dehydrogenase family protein  42.38 
 
 
482 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  42.29 
 
 
485 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  42.38 
 
 
498 aa  350  2e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  41.53 
 
 
482 aa  351  2e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  41.29 
 
 
496 aa  351  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4351  aldehyde dehydrogenase  43.01 
 
 
491 aa  351  2e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  39.34 
 
 
478 aa  349  8e-95  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  41.88 
 
 
493 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  41.24 
 
 
496 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  43.49 
 
 
493 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  41.75 
 
 
498 aa  342  8e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1076  aldehyde dehydrogenase  46.33 
 
 
505 aa  340  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.992962  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3306  Aldehyde Dehydrogenase  45.61 
 
 
497 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  39.78 
 
 
485 aa  337  3.9999999999999995e-91  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.88 
 
 
498 aa  326  5e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  40.17 
 
 
483 aa  323  6e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  38.54 
 
 
484 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  39.26 
 
 
490 aa  318  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  39.3 
 
 
483 aa  317  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  38.33 
 
 
506 aa  316  5e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  39.04 
 
 
501 aa  316  6e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  39.21 
 
 
494 aa  312  7.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  39.13 
 
 
493 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  38.88 
 
 
491 aa  311  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  39.75 
 
 
483 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  39.38 
 
 
493 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.59 
 
 
494 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.29 
 
 
508 aa  310  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.5 
 
 
479 aa  309  9e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  39.17 
 
 
493 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  38.92 
 
 
493 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.54 
 
 
493 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.13 
 
 
493 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  39.17 
 
 
493 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  39.46 
 
 
490 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  38.96 
 
 
493 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.16 
 
 
483 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>