More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1119 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  70.86 
 
 
477 aa  678    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6489  aldehyde dehydrogenase  71.82 
 
 
482 aa  680    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  69.68 
 
 
480 aa  677    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  70.48 
 
 
481 aa  699    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6141  aldehyde dehydrogenase  74.94 
 
 
446 aa  647    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  68.21 
 
 
479 aa  670    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  68.63 
 
 
480 aa  669    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  70.35 
 
 
477 aa  679    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1732  Aldehyde Dehydrogenase  69.25 
 
 
478 aa  658    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0174509  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0247  aldehyde dehydrogenase  71.19 
 
 
482 aa  647    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0452  aldehyde dehydrogenase  69.34 
 
 
480 aa  650    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1025  aldehyde dehydrogenase  68.7 
 
 
480 aa  649    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1119  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
479 aa  968    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65747 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2844  aldehyde dehydrogenase  69.94 
 
 
482 aa  676    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281069  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3422  aldehyde dehydrogenase  83.51 
 
 
479 aa  816    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228587  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  70.59 
 
 
485 aa  658    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  71.16 
 
 
480 aa  687    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  70.35 
 
 
477 aa  681    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1598  aldehyde dehydrogenase  69.83 
 
 
479 aa  667    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2664  aldehyde dehydrogenase  68.33 
 
 
480 aa  646    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  70.44 
 
 
477 aa  672    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  67.85 
 
 
479 aa  651    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  68.68 
 
 
475 aa  659    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  72.23 
 
 
498 aa  692    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  70.77 
 
 
477 aa  686    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  70.38 
 
 
485 aa  656    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  64.42 
 
 
482 aa  599  1e-170  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  63.6 
 
 
477 aa  597  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  57.83 
 
 
480 aa  577  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1043  Aldehyde Dehydrogenase  59.96 
 
 
483 aa  574  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2694  aldehyde dehydrogenase family protein  59.16 
 
 
480 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  58.7 
 
 
476 aa  568  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  60.89 
 
 
478 aa  568  1e-161  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  59.16 
 
 
480 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  57.81 
 
 
483 aa  543  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1815  aldehyde dehydrogenase  56.75 
 
 
491 aa  538  9.999999999999999e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2256  aldehyde dehydrogenase  58.49 
 
 
478 aa  532  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134767  hitchhiker  0.000000459097 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05501  hypothetical protein  56.26 
 
 
486 aa  529  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  56.05 
 
 
486 aa  528  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2128  aldehyde dehydrogenase  55.41 
 
 
486 aa  526  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0517784  hitchhiker  0.00570201 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0877  aldehyde dehydrogenase  53.93 
 
 
487 aa  511  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3381  aldehyde dehydrogenase  53.25 
 
 
482 aa  505  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.464458  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0813  aldehyde dehydrogenase  53.29 
 
 
482 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3017  aldehyde dehydrogenase  55.53 
 
 
478 aa  488  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1240  aldehyde dehydrogenase  52.21 
 
 
484 aa  491  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.208234 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1054  aldehyde dehydrogenase  64.15 
 
 
441 aa  466  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395537  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3959  Aldehyde Dehydrogenase  52.21 
 
 
482 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.424065  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  45.89 
 
 
482 aa  392  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  41.84 
 
 
505 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  45.68 
 
 
483 aa  376  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  41.63 
 
 
503 aa  375  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  42.24 
 
 
485 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3632  aldehyde dehydrogenase family protein  43.31 
 
 
482 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  42.8 
 
 
479 aa  369  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  41.42 
 
 
497 aa  371  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  46.71 
 
 
474 aa  365  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  42.29 
 
 
500 aa  366  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  42.35 
 
 
496 aa  368  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  42.61 
 
 
485 aa  367  1e-100  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  44.93 
 
 
483 aa  364  2e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  40.63 
 
 
478 aa  362  6e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  41.63 
 
 
493 aa  362  6e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  42.05 
 
 
498 aa  360  4e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4351  aldehyde dehydrogenase  43.84 
 
 
491 aa  359  6e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  43.24 
 
 
481 aa  355  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  38.7 
 
 
498 aa  353  4e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  38.53 
 
 
499 aa  348  8e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  42.59 
 
 
516 aa  348  1e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  42.29 
 
 
498 aa  348  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  38 
 
 
496 aa  348  2e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  41.93 
 
 
493 aa  346  4e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  42.77 
 
 
482 aa  345  8.999999999999999e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3306  Aldehyde Dehydrogenase  45 
 
 
497 aa  336  5.999999999999999e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1076  aldehyde dehydrogenase  45.4 
 
 
505 aa  334  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.992962  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  41.26 
 
 
493 aa  333  3e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  45.85 
 
 
488 aa  333  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4047  Aldehyde Dehydrogenase  43.57 
 
 
468 aa  332  1e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  40.25 
 
 
496 aa  330  5.0000000000000004e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1328  aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 
483 aa  324  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447584  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  38.24 
 
 
484 aa  323  6e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  37.58 
 
 
490 aa  320  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  35.74 
 
 
496 aa  310  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  35.74 
 
 
496 aa  310  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  39.19 
 
 
480 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  38.62 
 
 
480 aa  309  5e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4281  aldehyde dehydrogenase  41.94 
 
 
481 aa  310  5e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000626871  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0846  aldehyde dehydrogenase  40.25 
 
 
493 aa  309  9e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.42 
 
 
479 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2257  aldehyde dehydrogenase  42.05 
 
 
457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.955322  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  39.19 
 
 
494 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.94 
 
 
479 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3572  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.95 
 
 
506 aa  306  6e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  36.46 
 
 
496 aa  306  6e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.21 
 
 
479 aa  306  6e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 
491 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.3 
 
 
483 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  37.71 
 
 
490 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  40 
 
 
479 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3174  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  37.08 
 
 
487 aa  299  6e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000466622  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.94 
 
 
480 aa  299  7e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>