More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2694 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2694  aldehyde dehydrogenase family protein  100 
 
 		 480 aa  990    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  71.61 
 
 		 480 aa  727    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  99.79 
 
 		 480 aa  988    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  67.16 
 
 		 486 aa  666    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05501  hypothetical protein  66.31 
 
 		 486 aa  658    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0877  aldehyde dehydrogenase  66.74 
 
 		 487 aa  658    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1815  aldehyde dehydrogenase  66.03 
 
 		 491 aa  662    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0813  aldehyde dehydrogenase  65.47 
 
 		 482 aa  641    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2128  aldehyde dehydrogenase  66.1 
 
 		 486 aa  657    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0517784  hitchhiker  0.00570201 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1240  aldehyde dehydrogenase  63.69 
 
 		 484 aa  628  1e-179  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208234 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  64.26 
 
 		 483 aa  625  1e-178  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3381  aldehyde dehydrogenase  62 
 
 		 482 aa  610  1e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.464458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  60.17 
 
 		 479 aa  597  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  58.56 
 
 		 480 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1598  aldehyde dehydrogenase  59.58 
 
 		 479 aa  585  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  57.89 
 
 		 480 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  58.61 
 
 		 481 aa  579  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  59.32 
 
 		 498 aa  578  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  57.89 
 
 		 479 aa  578  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2844  aldehyde dehydrogenase  59.21 
 
 		 482 aa  581  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281069  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  57.68 
 
 		 480 aa  580  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3422  aldehyde dehydrogenase  59.58 
 
 		 479 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  59.53 
 
 		 475 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  58.05 
 
 		 477 aa  569  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6489  aldehyde dehydrogenase  58.82 
 
 		 482 aa  570  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  58.86 
 
 		 485 aa  568  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  59.07 
 
 		 485 aa  568  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1732  Aldehyde Dehydrogenase  57.81 
 
 		 478 aa  565  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0174509  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  57.63 
 
 		 477 aa  565  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  56.78 
 
 		 477 aa  566  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2664  aldehyde dehydrogenase  58.86 
 
 		 480 aa  564  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  57.42 
 
 		 477 aa  561  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0452  aldehyde dehydrogenase  56.9 
 
 		 480 aa  561  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1025  aldehyde dehydrogenase  56.69 
 
 		 480 aa  558  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1119  aldehyde dehydrogenase  59.16 
 
 		 479 aa  560  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65747 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  59.17 
 
 		 482 aa  558  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  56.57 
 
 		 477 aa  558  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  58.02 
 
 		 477 aa  552  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0247  aldehyde dehydrogenase  58.19 
 
 		 482 aa  543  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6141  aldehyde dehydrogenase  60.43 
 
 		 446 aa  540  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  54.56 
 
 		 476 aa  537  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1043  Aldehyde Dehydrogenase  55.56 
 
 		 483 aa  530  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  54.72 
 
 		 478 aa  521  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2256  aldehyde dehydrogenase  52.21 
 
 		 478 aa  474  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134767  hitchhiker  0.000000459097 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3017  aldehyde dehydrogenase  54.16 
 
 		 478 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1054  aldehyde dehydrogenase  64.77 
 
 		 441 aa  464  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3959  Aldehyde Dehydrogenase  49.89 
 
 		 482 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.424065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  42.28 
 
 		 479 aa  379  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  43.72 
 
 		 482 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  43.75 
 
 		 483 aa  374  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  41.6 
 
 		 498 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  42.8 
 
 		 483 aa  364  2e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  41.18 
 
 		 493 aa  360  2e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  44.77 
 
 		 488 aa  360  2e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  38.78 
 
 		 505 aa  357  3.9999999999999996e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  41.68 
 
 		 496 aa  350  3e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3632  aldehyde dehydrogenase family protein  40.29 
 
 		 482 aa  350  4e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  40.46 
 
 		 481 aa  349  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  40.42 
 
 		 500 aa  349  6e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  38.7 
 
 		 485 aa  347  4e-94  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4351  aldehyde dehydrogenase  41.2 
 
 		 491 aa  346  6e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  41.3 
 
 		 516 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  38.99 
 
 		 503 aa  343  4e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  38.8 
 
 		 499 aa  342  7e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  43.7 
 
 		 474 aa  342  1e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  38.78 
 
 		 497 aa  340  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  38.97 
 
 		 485 aa  340  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  40.63 
 
 		 482 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  40.55 
 
 		 493 aa  335  9e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  39.79 
 
 		 493 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  38.54 
 
 		 498 aa  333  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  36.82 
 
 		 478 aa  333  6e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  36.59 
 
 		 496 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  38.48 
 
 		 496 aa  326  6e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  39.29 
 
 		 498 aa  325  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3306  Aldehyde Dehydrogenase  43.82 
 
 		 497 aa  318  9e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1076  aldehyde dehydrogenase  43.63 
 
 		 505 aa  317  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.992962  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  38.33 
 
 		 491 aa  316  5e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  38.37 
 
 		 494 aa  316  5e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  38.8 
 
 		 488 aa  313  2.9999999999999996e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  36.06 
 
 		 484 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  38.59 
 
 		 488 aa  312  6.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  37.01 
 
 		 490 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  35.03 
 
 		 496 aa  311  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  35.03 
 
 		 496 aa  311  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1328  aldehyde dehydrogenase  40.96 
 
 		 483 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.98 
 
 		 479 aa  307  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  36.98 
 
 		 490 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1054  Aldehyde Dehydrogenase  37.68 
 
 		 513 aa  302  8.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0958  aldehyde dehydrogenase  35.19 
 
 		 492 aa  302  9e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.938749  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  35.54 
 
 		 496 aa  301  1e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.32 
 
 		 483 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3572  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.42 
 
 		 506 aa  301  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.26 
 
 		 480 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  36.97 
 
 		 510 aa  300  4e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  34.66 
 
 		 497 aa  300  4e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0846  aldehyde dehydrogenase  37.84 
 
 		 493 aa  300  5e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5059  betaine aldehyde dehydrogenase  37.89 
 
 		 489 aa  299  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0560116 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1591  betaine aldehyde dehydrogenase  38.32 
 
 		 489 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3174  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  35.32 
 
 		 487 aa  297  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000466622  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>