More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0544 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
482 aa  953    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  46.74 
 
 
480 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  47.03 
 
 
480 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  46.17 
 
 
479 aa  409  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  45.68 
 
 
480 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3017  aldehyde dehydrogenase  48.42 
 
 
478 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  45.49 
 
 
481 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  46.09 
 
 
479 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  46.96 
 
 
485 aa  393  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  42.03 
 
 
498 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  46.96 
 
 
485 aa  392  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  45.49 
 
 
478 aa  393  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2844  aldehyde dehydrogenase  46.67 
 
 
482 aa  395  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281069  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  44.96 
 
 
498 aa  394  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  47.38 
 
 
477 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  43.46 
 
 
484 aa  393  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  45.8 
 
 
475 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  45.85 
 
 
498 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  45.65 
 
 
476 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  44.86 
 
 
477 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6489  aldehyde dehydrogenase  45.57 
 
 
482 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  42.23 
 
 
505 aa  388  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2664  aldehyde dehydrogenase  47.08 
 
 
480 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  45.07 
 
 
477 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0247  aldehyde dehydrogenase  47.6 
 
 
482 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  44.86 
 
 
477 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  47.9 
 
 
482 aa  382  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  43.22 
 
 
500 aa  384  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  42.02 
 
 
499 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  45.45 
 
 
479 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  41.61 
 
 
496 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3422  aldehyde dehydrogenase  45.89 
 
 
479 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228587  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  43.07 
 
 
503 aa  381  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  43.07 
 
 
497 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  44.14 
 
 
483 aa  378  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  44.96 
 
 
477 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  42.49 
 
 
480 aa  375  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  43.97 
 
 
483 aa  376  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1815  aldehyde dehydrogenase  43.1 
 
 
491 aa  375  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  44.84 
 
 
482 aa  374  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05501  hypothetical protein  42.77 
 
 
486 aa  373  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  44.96 
 
 
477 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1119  aldehyde dehydrogenase  45.89 
 
 
479 aa  371  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65747 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  45.8 
 
 
516 aa  369  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  44.21 
 
 
498 aa  369  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0877  aldehyde dehydrogenase  42.32 
 
 
487 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6141  aldehyde dehydrogenase  47.47 
 
 
446 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  43.49 
 
 
480 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1043  Aldehyde Dehydrogenase  44.24 
 
 
483 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2694  aldehyde dehydrogenase family protein  43.49 
 
 
480 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1598  aldehyde dehydrogenase  44.73 
 
 
479 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  42.89 
 
 
486 aa  368  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  43.28 
 
 
493 aa  366  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  45.26 
 
 
483 aa  367  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0452  aldehyde dehydrogenase  45.24 
 
 
480 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1025  aldehyde dehydrogenase  45.03 
 
 
480 aa  366  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1732  Aldehyde Dehydrogenase  45.89 
 
 
478 aa  364  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0174509  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  45.69 
 
 
474 aa  363  3e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  40.76 
 
 
478 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2128  aldehyde dehydrogenase  41.05 
 
 
486 aa  361  2e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0517784  hitchhiker  0.00570201 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3381  aldehyde dehydrogenase  42.65 
 
 
482 aa  359  7e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.464458  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3306  Aldehyde Dehydrogenase  45.28 
 
 
497 aa  359  8e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  43.93 
 
 
496 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  42.11 
 
 
496 aa  358  1.9999999999999998e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  41.54 
 
 
493 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0813  aldehyde dehydrogenase  41.98 
 
 
482 aa  355  1e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1240  aldehyde dehydrogenase  43.01 
 
 
484 aa  354  2e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.208234 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1076  aldehyde dehydrogenase  44.61 
 
 
505 aa  348  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.992962  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2257  aldehyde dehydrogenase  45.58 
 
 
457 aa  348  1e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.955322  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  42.05 
 
 
485 aa  346  6e-94  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  40.5 
 
 
493 aa  346  6e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0274  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  41.93 
 
 
515 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  40.83 
 
 
485 aa  345  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1054  aldehyde dehydrogenase  50.71 
 
 
441 aa  344  2e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395537  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2125  Aldehyde Dehydrogenase  44.51 
 
 
488 aa  343  2.9999999999999997e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  44.65 
 
 
488 aa  341  1e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3632  aldehyde dehydrogenase family protein  40.47 
 
 
482 aa  338  9e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1043  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  40.82 
 
 
515 aa  335  7e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2256  aldehyde dehydrogenase  42.08 
 
 
478 aa  334  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134767  hitchhiker  0.000000459097 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0289  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  40.04 
 
 
515 aa  330  3e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4351  aldehyde dehydrogenase  40.89 
 
 
491 aa  328  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  39.16 
 
 
480 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  41.82 
 
 
510 aa  325  8.000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0442  Aldehyde Dehydrogenase  41.81 
 
 
486 aa  324  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  41.65 
 
 
485 aa  323  5e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.75 
 
 
483 aa  323  5e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  39.75 
 
 
483 aa  322  7e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4196  Aldehyde Dehydrogenase  42.59 
 
 
483 aa  322  9.000000000000001e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.115052  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  41.51 
 
 
480 aa  322  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0338  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  39.62 
 
 
515 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0355  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  39.62 
 
 
515 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0279  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  39.62 
 
 
515 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0282  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  39.62 
 
 
515 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  39.53 
 
 
483 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  39.83 
 
 
481 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0309  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  39.62 
 
 
515 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0381  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  39.62 
 
 
515 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0340  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  39.62 
 
 
515 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4965  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  39.62 
 
 
515 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0290  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  38.99 
 
 
515 aa  320  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>