More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3422 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  67.16 
 
 
480 aa  662    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  71.19 
 
 
477 aa  675    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  69.1 
 
 
498 aa  661    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  69.94 
 
 
477 aa  665    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  70.44 
 
 
477 aa  665    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1119  aldehyde dehydrogenase  83.51 
 
 
479 aa  800    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65747 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  67.79 
 
 
480 aa  665    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0247  aldehyde dehydrogenase  71.82 
 
 
482 aa  656    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  67.98 
 
 
481 aa  682    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  67.16 
 
 
479 aa  657    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  70.02 
 
 
477 aa  659    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  69.12 
 
 
485 aa  653    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1598  aldehyde dehydrogenase  69.83 
 
 
479 aa  656    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0452  aldehyde dehydrogenase  68.08 
 
 
480 aa  640    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1025  aldehyde dehydrogenase  67.86 
 
 
480 aa  639    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2844  aldehyde dehydrogenase  69.31 
 
 
482 aa  675    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281069  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3422  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
479 aa  976    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228587  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  69.31 
 
 
477 aa  660    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1732  Aldehyde Dehydrogenase  67.57 
 
 
478 aa  640    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0174509  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  67.16 
 
 
480 aa  659    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  68.89 
 
 
479 aa  652    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  69.12 
 
 
485 aa  653    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  67.43 
 
 
475 aa  650    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2664  aldehyde dehydrogenase  67.92 
 
 
480 aa  652    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6489  aldehyde dehydrogenase  72.03 
 
 
482 aa  680    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6141  aldehyde dehydrogenase  71.36 
 
 
446 aa  615  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  64.23 
 
 
477 aa  593  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  63.37 
 
 
482 aa  586  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1043  Aldehyde Dehydrogenase  60.17 
 
 
483 aa  585  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  60.17 
 
 
476 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2694  aldehyde dehydrogenase family protein  59.58 
 
 
480 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  57.62 
 
 
480 aa  573  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  59.58 
 
 
480 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  57.93 
 
 
478 aa  548  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  57.59 
 
 
483 aa  549  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1815  aldehyde dehydrogenase  55.7 
 
 
491 aa  528  1e-148  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2256  aldehyde dehydrogenase  56.6 
 
 
478 aa  522  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134767  hitchhiker  0.000000459097 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  53.05 
 
 
486 aa  513  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05501  hypothetical protein  52.85 
 
 
486 aa  509  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3381  aldehyde dehydrogenase  53.04 
 
 
482 aa  507  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.464458  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0877  aldehyde dehydrogenase  51.8 
 
 
487 aa  504  1e-141  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2128  aldehyde dehydrogenase  52.22 
 
 
486 aa  504  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0517784  hitchhiker  0.00570201 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0813  aldehyde dehydrogenase  50.32 
 
 
482 aa  482  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3017  aldehyde dehydrogenase  54.07 
 
 
478 aa  476  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1240  aldehyde dehydrogenase  50.74 
 
 
484 aa  473  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.208234 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3959  Aldehyde Dehydrogenase  53.89 
 
 
482 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.424065  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1054  aldehyde dehydrogenase  65.27 
 
 
441 aa  468  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395537  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  45.89 
 
 
482 aa  395  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  43.01 
 
 
479 aa  374  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  43.8 
 
 
483 aa  369  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  41.52 
 
 
485 aa  366  1e-100  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  39.75 
 
 
505 aa  369  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  41.84 
 
 
493 aa  363  4e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  45.39 
 
 
474 aa  361  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  40.59 
 
 
503 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  40.13 
 
 
478 aa  355  1e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3632  aldehyde dehydrogenase family protein  41.63 
 
 
482 aa  354  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  40.38 
 
 
497 aa  353  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  42.65 
 
 
483 aa  352  5.9999999999999994e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  41 
 
 
496 aa  350  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  40.99 
 
 
485 aa  349  6e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  40.62 
 
 
500 aa  344  2e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  41.13 
 
 
481 aa  344  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  42.95 
 
 
516 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  41.54 
 
 
482 aa  343  4e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4351  aldehyde dehydrogenase  41.58 
 
 
491 aa  342  1e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3306  Aldehyde Dehydrogenase  44.98 
 
 
497 aa  338  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  37.18 
 
 
498 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1076  aldehyde dehydrogenase  46.23 
 
 
505 aa  338  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.992962  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  39.96 
 
 
498 aa  335  7.999999999999999e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  37.05 
 
 
499 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  43.91 
 
 
488 aa  335  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  38.83 
 
 
490 aa  335  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  41 
 
 
498 aa  333  6e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  36.38 
 
 
496 aa  331  2e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  40.38 
 
 
493 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1328  aldehyde dehydrogenase  43.93 
 
 
483 aa  329  6e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447584  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  37.61 
 
 
484 aa  324  2e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  40.21 
 
 
493 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4047  Aldehyde Dehydrogenase  42.06 
 
 
468 aa  322  9.999999999999999e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  38.78 
 
 
496 aa  320  3e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  36.57 
 
 
496 aa  312  7.999999999999999e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2257  aldehyde dehydrogenase  41.61 
 
 
457 aa  312  9e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.955322  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  38.75 
 
 
494 aa  310  4e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  38.96 
 
 
491 aa  309  8e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  35.73 
 
 
496 aa  306  7e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  35.73 
 
 
496 aa  306  7e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  39.25 
 
 
480 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  38.77 
 
 
480 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  36.1 
 
 
497 aa  301  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4281  aldehyde dehydrogenase  40.42 
 
 
481 aa  302  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000626871  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.87 
 
 
483 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  40 
 
 
479 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.15 
 
 
481 aa  298  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3572  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.16 
 
 
506 aa  297  3e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2125  Aldehyde Dehydrogenase  38.32 
 
 
488 aa  294  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.3 
 
 
479 aa  294  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5059  betaine aldehyde dehydrogenase  38.83 
 
 
489 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0560116 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.65 
 
 
479 aa  293  4e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0846  aldehyde dehydrogenase  38.36 
 
 
493 aa  293  4e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>