More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1076 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3306  Aldehyde Dehydrogenase  83.5 
 
 
497 aa  767    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1076  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
505 aa  999    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.992962  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  47.38 
 
 
479 aa  416  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  45.02 
 
 
482 aa  382  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  47.69 
 
 
485 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  47.48 
 
 
485 aa  374  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.393989 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  42.32 
 
 
478 aa  369  1e-101  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  45.61 
 
 
482 aa  369  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  44.63 
 
 
479 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  45.83 
 
 
478 aa  368  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  50.76 
 
 
474 aa  367  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3017  aldehyde dehydrogenase  50.1 
 
 
478 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  45.19 
 
 
483 aa  364  2e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2844  aldehyde dehydrogenase  46.33 
 
 
482 aa  365  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281069  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.7 
 
 
477 aa  363  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3381  aldehyde dehydrogenase  43.4 
 
 
482 aa  360  3e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.464458  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  45.07 
 
 
477 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  45.09 
 
 
483 aa  358  1.9999999999999998e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  44.44 
 
 
477 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  42.56 
 
 
480 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.28 
 
 
480 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  41.29 
 
 
499 aa  352  8e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1598  aldehyde dehydrogenase  44.31 
 
 
479 aa  352  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  42.35 
 
 
480 aa  351  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  43.51 
 
 
475 aa  350  4e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2664  aldehyde dehydrogenase  45.19 
 
 
480 aa  350  5e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3422  aldehyde dehydrogenase  46.23 
 
 
479 aa  349  7e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228587  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  43.42 
 
 
481 aa  348  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0247  aldehyde dehydrogenase  47.4 
 
 
482 aa  348  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1732  Aldehyde Dehydrogenase  46.54 
 
 
478 aa  347  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0174509  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  44.23 
 
 
479 aa  345  7e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  44.23 
 
 
477 aa  343  2.9999999999999997e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  44.23 
 
 
477 aa  342  9e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  43.71 
 
 
498 aa  341  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1119  aldehyde dehydrogenase  45.4 
 
 
479 aa  340  2.9999999999999998e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65747 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  39.42 
 
 
498 aa  340  5e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  43.04 
 
 
477 aa  338  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  42.95 
 
 
483 aa  338  9.999999999999999e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4351  aldehyde dehydrogenase  43.33 
 
 
491 aa  338  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0452  aldehyde dehydrogenase  43.28 
 
 
480 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  43.75 
 
 
480 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2694  aldehyde dehydrogenase family protein  43.75 
 
 
480 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1025  aldehyde dehydrogenase  43.07 
 
 
480 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  42.35 
 
 
476 aa  333  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  40.29 
 
 
493 aa  332  8e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  40.92 
 
 
493 aa  331  2e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  46.68 
 
 
488 aa  330  3e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6489  aldehyde dehydrogenase  42.71 
 
 
482 aa  330  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  39.92 
 
 
480 aa  329  9e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4047  Aldehyde Dehydrogenase  45.77 
 
 
468 aa  327  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  42.29 
 
 
496 aa  327  3e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4281  aldehyde dehydrogenase  42.17 
 
 
481 aa  326  5e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000626871  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1815  aldehyde dehydrogenase  41.05 
 
 
491 aa  325  2e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  38.73 
 
 
496 aa  323  4e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  40.21 
 
 
486 aa  323  6e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  41.58 
 
 
481 aa  322  8e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2128  aldehyde dehydrogenase  38.82 
 
 
486 aa  322  9.999999999999999e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0517784  hitchhiker  0.00570201 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  39.13 
 
 
485 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  39.25 
 
 
497 aa  322  9.999999999999999e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  39.25 
 
 
503 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  41.96 
 
 
516 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6141  aldehyde dehydrogenase  44.63 
 
 
446 aa  320  5e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05501  hypothetical protein  39.79 
 
 
486 aa  318  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  38.57 
 
 
484 aa  317  3e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3632  aldehyde dehydrogenase family protein  40.08 
 
 
482 aa  317  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0877  aldehyde dehydrogenase  38.78 
 
 
487 aa  315  1.9999999999999998e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  44.4 
 
 
482 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  40.71 
 
 
498 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  39.75 
 
 
493 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  37.92 
 
 
505 aa  311  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  38.41 
 
 
500 aa  309  8e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1240  aldehyde dehydrogenase  40.21 
 
 
484 aa  306  5.0000000000000004e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.208234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1043  Aldehyde Dehydrogenase  41.09 
 
 
483 aa  306  8.000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  39.46 
 
 
498 aa  305  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1054  aldehyde dehydrogenase  48.17 
 
 
441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395537  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  37.24 
 
 
485 aa  302  1e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0813  aldehyde dehydrogenase  39.71 
 
 
482 aa  301  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1328  aldehyde dehydrogenase  41.44 
 
 
483 aa  295  9e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447584  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  37.27 
 
 
496 aa  290  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2256  aldehyde dehydrogenase  38.41 
 
 
478 aa  281  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134767  hitchhiker  0.000000459097 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  38.11 
 
 
506 aa  276  5e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2125  Aldehyde Dehydrogenase  40.61 
 
 
488 aa  274  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2257  aldehyde dehydrogenase  37.09 
 
 
457 aa  273  8.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.955322  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1749  lactaldehyde dehydrogenase  39.14 
 
 
481 aa  272  9e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.451931  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1591  betaine aldehyde dehydrogenase  37.84 
 
 
489 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5059  betaine aldehyde dehydrogenase  38.1 
 
 
489 aa  270  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0560116 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0395  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.17 
 
 
475 aa  268  2e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3959  Aldehyde Dehydrogenase  38.91 
 
 
482 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.424065  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1307  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.59 
 
 
476 aa  268  2e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.424355  normal  0.0731768 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0985  phenylacetaldehyde dehydrogenase  36.44 
 
 
499 aa  268  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1997  Aldehyde Dehydrogenase  37.95 
 
 
480 aa  267  4e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  37.03 
 
 
505 aa  266  5e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.1 
 
 
482 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.1 
 
 
482 aa  266  7e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.9 
 
 
482 aa  265  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0566  Aldehyde Dehydrogenase  37.08 
 
 
476 aa  265  2e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.359165  normal  0.116957 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0442  Aldehyde Dehydrogenase  39.24 
 
 
486 aa  264  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  34.98 
 
 
501 aa  263  4e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3309  betaine aldehyde dehydrogenase  37.66 
 
 
489 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.38 
 
 
508 aa  263  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>