More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3017 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3017  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 478 aa  943    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  58.81 
 
 		 477 aa  528  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  56.03 
 
 		 480 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  56.29 
 
 		 480 aa  524  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  57.05 
 
 		 485 aa  512  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  55.51 
 
 		 480 aa  514  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  56.85 
 
 		 485 aa  510  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  54.68 
 
 		 481 aa  511  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  54.3 
 
 		 479 aa  509  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2844  aldehyde dehydrogenase  55.6 
 
 		 482 aa  510  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281069  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  54.56 
 
 		 483 aa  506  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1732  Aldehyde Dehydrogenase  55.98 
 
 		 478 aa  502  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0174509  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  57.45 
 
 		 482 aa  503  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  56.2 
 
 		 477 aa  498  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  55.98 
 
 		 477 aa  496  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  55.39 
 
 		 477 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  55.73 
 
 		 478 aa  495  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  55.18 
 
 		 477 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6489  aldehyde dehydrogenase  54.81 
 
 		 482 aa  498  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  55.81 
 
 		 498 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  55.77 
 
 		 477 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2664  aldehyde dehydrogenase  55.06 
 
 		 480 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1598  aldehyde dehydrogenase  53.78 
 
 		 479 aa  494  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  54.7 
 
 		 479 aa  493  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0452  aldehyde dehydrogenase  53.94 
 
 		 480 aa  491  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1025  aldehyde dehydrogenase  53.5 
 
 		 480 aa  490  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6141  aldehyde dehydrogenase  58.91 
 
 		 446 aa  489  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1119  aldehyde dehydrogenase  55.53 
 
 		 479 aa  488  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65747 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  53.21 
 
 		 476 aa  485  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  54.12 
 
 		 475 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2694  aldehyde dehydrogenase family protein  53.93 
 
 		 480 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0247  aldehyde dehydrogenase  56.46 
 
 		 482 aa  482  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3422  aldehyde dehydrogenase  54.07 
 
 		 479 aa  483  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  53.93 
 
 		 480 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3381  aldehyde dehydrogenase  49.06 
 
 		 482 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.464458  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  49.58 
 
 		 480 aa  467  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05501  hypothetical protein  49.57 
 
 		 486 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  49.36 
 
 		 486 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0877  aldehyde dehydrogenase  48.5 
 
 		 487 aa  448  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1815  aldehyde dehydrogenase  49.26 
 
 		 491 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1043  Aldehyde Dehydrogenase  52.2 
 
 		 483 aa  443  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2128  aldehyde dehydrogenase  47.86 
 
 		 486 aa  444  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0517784  hitchhiker  0.00570201 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1240  aldehyde dehydrogenase  48.09 
 
 		 484 aa  434  1e-120  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208234 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  48.41 
 
 		 482 aa  419  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1054  aldehyde dehydrogenase  60.11 
 
 		 441 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0813  aldehyde dehydrogenase  47.22 
 
 		 482 aa  414  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  48.37 
 
 		 479 aa  406  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2256  aldehyde dehydrogenase  47.18 
 
 		 478 aa  392  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134767  hitchhiker  0.000000459097 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  50.11 
 
 		 474 aa  379  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  46.77 
 
 		 483 aa  375  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  42.3 
 
 		 499 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  42.61 
 
 		 493 aa  362  1e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  43.8 
 
 		 498 aa  360  2e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  50 
 
 		 488 aa  361  2e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  41.05 
 
 		 498 aa  356  5e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1076  aldehyde dehydrogenase  50.1 
 
 		 505 aa  352  8e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.992962  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3959  Aldehyde Dehydrogenase  45.88 
 
 		 482 aa  351  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.424065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  42.86 
 
 		 516 aa  351  2e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  42.8 
 
 		 482 aa  350  4e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  41.9 
 
 		 503 aa  347  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  41.68 
 
 		 497 aa  347  3e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  44.69 
 
 		 483 aa  347  4e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  41.99 
 
 		 505 aa  346  6e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3306  Aldehyde Dehydrogenase  47.99 
 
 		 497 aa  344  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  38.95 
 
 		 496 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  41.77 
 
 		 496 aa  339  7e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  43.99 
 
 		 493 aa  338  9e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  40.21 
 
 		 484 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  41.3 
 
 		 500 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  40.13 
 
 		 478 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  41.79 
 
 		 498 aa  335  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1328  aldehyde dehydrogenase  44.57 
 
 		 483 aa  330  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  43.57 
 
 		 496 aa  330  3e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  40 
 
 		 485 aa  327  2.0000000000000001e-88  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  41.82 
 
 		 493 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4281  aldehyde dehydrogenase  43.37 
 
 		 481 aa  322  9.000000000000001e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000626871  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  39.4 
 
 		 494 aa  311  1e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  40.35 
 
 		 485 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4047  Aldehyde Dehydrogenase  42.79 
 
 		 468 aa  310  2.9999999999999997e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.69 
 
 		 488 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  40.26 
 
 		 488 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  41.46 
 
 		 488 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  40.74 
 
 		 480 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2257  aldehyde dehydrogenase  41.7 
 
 		 457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.955322  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0503  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  40.91 
 
 		 476 aa  307  3e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2311  betaine aldehyde dehydrogenase  41.61 
 
 		 483 aa  306  8.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  36.17 
 
 		 490 aa  306  8.000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0442  Aldehyde Dehydrogenase  42.36 
 
 		 486 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5059  betaine aldehyde dehydrogenase  40.35 
 
 		 489 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0560116 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1591  betaine aldehyde dehydrogenase  39.91 
 
 		 489 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.17 
 
 		 488 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3632  aldehyde dehydrogenase family protein  40.13 
 
 		 482 aa  303  5.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  39.29 
 
 		 481 aa  302  7.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.32 
 
 		 488 aa  302  9e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.08 
 
 		 496 aa  301  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  40.55 
 
 		 488 aa  302  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2710  betaine aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 		 487 aa  301  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  39.87 
 
 		 491 aa  301  2e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4351  aldehyde dehydrogenase  40.31 
 
 		 491 aa  300  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  39.52 
 
 		 488 aa  300  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>