More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1043 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2256  aldehyde dehydrogenase  70.29 
 
 		 478 aa  658    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134767  hitchhiker  0.000000459097 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1043  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 		 483 aa  979    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3422  aldehyde dehydrogenase  60.17 
 
 		 479 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  59.02 
 
 		 479 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6489  aldehyde dehydrogenase  60.08 
 
 		 482 aa  565  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  58.39 
 
 		 480 aa  566  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2844  aldehyde dehydrogenase  57.59 
 
 		 482 aa  560  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281069  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1119  aldehyde dehydrogenase  59.96 
 
 		 479 aa  554  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65747 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  56.87 
 
 		 481 aa  545  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  56.99 
 
 		 480 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  58.44 
 
 		 477 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  56.99 
 
 		 480 aa  544  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  57.08 
 
 		 498 aa  541  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3959  Aldehyde Dehydrogenase  60.17 
 
 		 482 aa  544  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.424065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2664  aldehyde dehydrogenase  57.32 
 
 		 480 aa  538  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1598  aldehyde dehydrogenase  56.6 
 
 		 479 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  58.32 
 
 		 485 aa  537  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  57.2 
 
 		 477 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  57.5 
 
 		 477 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  58.28 
 
 		 485 aa  537  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  55.95 
 
 		 477 aa  533  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0452  aldehyde dehydrogenase  56.3 
 
 		 480 aa  533  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1732  Aldehyde Dehydrogenase  56.39 
 
 		 478 aa  532  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0174509  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  57.68 
 
 		 475 aa  535  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  56.16 
 
 		 477 aa  528  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  54.26 
 
 		 476 aa  531  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1025  aldehyde dehydrogenase  56.09 
 
 		 480 aa  530  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  55.74 
 
 		 477 aa  524  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2694  aldehyde dehydrogenase family protein  55.56 
 
 		 480 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  55.56 
 
 		 480 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0247  aldehyde dehydrogenase  58.32 
 
 		 482 aa  519  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  54.91 
 
 		 479 aa  520  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6141  aldehyde dehydrogenase  58.45 
 
 		 446 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  54.35 
 
 		 478 aa  513  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  56.48 
 
 		 482 aa  511  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  52.65 
 
 		 480 aa  509  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  51.81 
 
 		 486 aa  483  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  52.75 
 
 		 483 aa  484  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05501  hypothetical protein  51.6 
 
 		 486 aa  480  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2128  aldehyde dehydrogenase  50.11 
 
 		 486 aa  473  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0517784  hitchhiker  0.00570201 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1815  aldehyde dehydrogenase  49.48 
 
 		 491 aa  474  1e-132  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1240  aldehyde dehydrogenase  51.37 
 
 		 484 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208234 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0877  aldehyde dehydrogenase  49.68 
 
 		 487 aa  465  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3381  aldehyde dehydrogenase  51.04 
 
 		 482 aa  467  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.464458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0813  aldehyde dehydrogenase  50.75 
 
 		 482 aa  461  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3017  aldehyde dehydrogenase  52.2 
 
 		 478 aa  430  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1054  aldehyde dehydrogenase  61.02 
 
 		 441 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  44.24 
 
 		 482 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  41.21 
 
 		 498 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  41.09 
 
 		 485 aa  351  1e-95  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  39.96 
 
 		 493 aa  352  1e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  40.92 
 
 		 500 aa  347  4e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  41.23 
 
 		 479 aa  338  9.999999999999999e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  42.35 
 
 		 483 aa  332  7.000000000000001e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  42.14 
 
 		 483 aa  332  9e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  40.59 
 
 		 496 aa  332  1e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  38 
 
 		 496 aa  330  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3632  aldehyde dehydrogenase family protein  40.96 
 
 		 482 aa  330  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  40.34 
 
 		 485 aa  330  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  37.89 
 
 		 499 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  39.79 
 
 		 496 aa  326  7e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  37.76 
 
 		 503 aa  324  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  39.75 
 
 		 481 aa  325  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  40.84 
 
 		 484 aa  324  2e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  38.17 
 
 		 497 aa  323  3e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  39.67 
 
 		 493 aa  323  5e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  38.56 
 
 		 478 aa  322  9.999999999999999e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  40.46 
 
 		 482 aa  320  3e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  45.52 
 
 		 474 aa  318  9e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  40.04 
 
 		 498 aa  317  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  36.97 
 
 		 505 aa  317  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  42.47 
 
 		 488 aa  316  5e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  39.07 
 
 		 490 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  41 
 
 		 516 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4351  aldehyde dehydrogenase  40.21 
 
 		 491 aa  313  2.9999999999999996e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3107  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  39.59 
 
 		 503 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  38.66 
 
 		 493 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2311  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  40.67 
 
 		 506 aa  307  3e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1333  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  39.12 
 
 		 505 aa  306  5.0000000000000004e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.285916  normal  0.0481185 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  39.5 
 
 		 496 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  37.29 
 
 		 490 aa  302  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2257  aldehyde dehydrogenase  42.64 
 
 		 457 aa  302  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.955322  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4441  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  39.11 
 
 		 505 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.411822 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  38.46 
 
 		 498 aa  299  6e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4281  aldehyde dehydrogenase  40.62 
 
 		 481 aa  298  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000626871  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0846  aldehyde dehydrogenase  39.07 
 
 		 493 aa  297  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  38.66 
 
 		 510 aa  297  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0965  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  37.03 
 
 		 507 aa  295  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1161  5-carboxy-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  40.52 
 
 		 504 aa  291  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  37.92 
 
 		 480 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1328  aldehyde dehydrogenase  40.38 
 
 		 483 aa  288  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2507  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  38.38 
 
 		 503 aa  288  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  38.51 
 
 		 482 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  37.32 
 
 		 488 aa  286  5e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07430  hypothetical protein  34.94 
 
 		 481 aa  286  5e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.782737  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  35.77 
 
 		 497 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1064  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  40.89 
 
 		 502 aa  286  7e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0104638  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7524  Betaine-aldehyde dehydrogenase  43.24 
 
 		 488 aa  286  8e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.389404  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  37.34 
 
 		 488 aa  285  9e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3522  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  39.62 
 
 		 504 aa  285  9e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>