More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3959 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3959  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 		 482 aa  966    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.424065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1043  Aldehyde Dehydrogenase  60.17 
 
 		 483 aa  559  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  52.44 
 
 		 479 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2256  aldehyde dehydrogenase  54.35 
 
 		 478 aa  491  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134767  hitchhiker  0.000000459097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6489  aldehyde dehydrogenase  53.16 
 
 		 482 aa  480  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  53.26 
 
 		 477 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1598  aldehyde dehydrogenase  51.7 
 
 		 479 aa  471  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2844  aldehyde dehydrogenase  51.99 
 
 		 482 aa  473  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281069  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3422  aldehyde dehydrogenase  53.89 
 
 		 479 aa  471  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  50.42 
 
 		 480 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  50.75 
 
 		 476 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  51.98 
 
 		 485 aa  462  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2664  aldehyde dehydrogenase  51.16 
 
 		 480 aa  460  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  51.77 
 
 		 485 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0452  aldehyde dehydrogenase  50.85 
 
 		 480 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1025  aldehyde dehydrogenase  50.42 
 
 		 480 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  48.73 
 
 		 481 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  49.16 
 
 		 480 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1732  Aldehyde Dehydrogenase  49.79 
 
 		 478 aa  453  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0174509  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  53.49 
 
 		 482 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1119  aldehyde dehydrogenase  52.21 
 
 		 479 aa  448  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65747 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  48.31 
 
 		 480 aa  444  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  49.05 
 
 		 475 aa  444  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  46.53 
 
 		 480 aa  438  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  49.89 
 
 		 483 aa  439  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  49.47 
 
 		 498 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  48.62 
 
 		 477 aa  437  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2694  aldehyde dehydrogenase family protein  49.89 
 
 		 480 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  48.83 
 
 		 477 aa  434  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0247  aldehyde dehydrogenase  50.63 
 
 		 482 aa  433  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  49.89 
 
 		 480 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  48.41 
 
 		 477 aa  429  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  49.04 
 
 		 477 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  48.83 
 
 		 477 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  47.57 
 
 		 479 aa  424  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6141  aldehyde dehydrogenase  51.96 
 
 		 446 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3381  aldehyde dehydrogenase  46.51 
 
 		 482 aa  421  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.464458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  44.78 
 
 		 486 aa  412  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  45.42 
 
 		 478 aa  412  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05501  hypothetical protein  44.56 
 
 		 486 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2128  aldehyde dehydrogenase  44.14 
 
 		 486 aa  404  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0517784  hitchhiker  0.00570201 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1815  aldehyde dehydrogenase  44.35 
 
 		 491 aa  397  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1240  aldehyde dehydrogenase  44.26 
 
 		 484 aa  389  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208234 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0877  aldehyde dehydrogenase  42.86 
 
 		 487 aa  390  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0813  aldehyde dehydrogenase  43.92 
 
 		 482 aa  388  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3017  aldehyde dehydrogenase  45.88 
 
 		 478 aa  350  2e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1054  aldehyde dehydrogenase  49.86 
 
 		 441 aa  342  8e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  40.3 
 
 		 493 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  38 
 
 		 500 aa  323  4e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  40.67 
 
 		 479 aa  319  6e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  38.88 
 
 		 498 aa  316  7e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  39.54 
 
 		 496 aa  311  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  35.92 
 
 		 505 aa  311  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  40.37 
 
 		 483 aa  309  5.9999999999999995e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  39.75 
 
 		 498 aa  309  6.999999999999999e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  39.87 
 
 		 496 aa  309  9e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  37.37 
 
 		 496 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  39.79 
 
 		 482 aa  307  3e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  39.79 
 
 		 516 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  36.02 
 
 		 503 aa  304  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  36.53 
 
 		 497 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  36.63 
 
 		 499 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  38.96 
 
 		 478 aa  300  4e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  37.61 
 
 		 485 aa  291  2e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  37.31 
 
 		 493 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  37.25 
 
 		 493 aa  289  7e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  36.13 
 
 		 484 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3632  aldehyde dehydrogenase family protein  38.24 
 
 		 482 aa  283  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  37.09 
 
 		 488 aa  281  2e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  38.08 
 
 		 483 aa  280  4e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2311  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  38.48 
 
 		 506 aa  280  5e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  42.36 
 
 		 474 aa  280  5e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  37.39 
 
 		 481 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  37.09 
 
 		 488 aa  277  4e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  36.46 
 
 		 485 aa  276  8e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  34.69 
 
 		 497 aa  273  6e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3226  aldehyde dehydrogenase  38.13 
 
 		 493 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  36.06 
 
 		 482 aa  271  2e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.04 
 
 		 483 aa  270  4e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  35.28 
 
 		 498 aa  270  5.9999999999999995e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2290  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.33 
 
 		 503 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  36.32 
 
 		 490 aa  268  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  35.29 
 
 		 493 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  38.31 
 
 		 496 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  36.21 
 
 		 493 aa  267  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1333  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  37.34 
 
 		 505 aa  266  5.999999999999999e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.285916  normal  0.0481185 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  35.29 
 
 		 493 aa  266  8e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4441  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  36.4 
 
 		 505 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.411822 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4351  aldehyde dehydrogenase  37.26 
 
 		 491 aa  265  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  35.46 
 
 		 510 aa  265  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.52 
 
 		 483 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  35.65 
 
 		 493 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  37.86 
 
 		 480 aa  263  4e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.87 
 
 		 483 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0759  nonphosphorylating glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  39.52 
 
 		 484 aa  263  6e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0247006  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.37 
 
 		 482 aa  263  6e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  38.13 
 
 		 494 aa  262  8.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5267  aldehyde dehydrogenase  37.23 
 
 		 493 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.37 
 
 		 482 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.37 
 
 		 482 aa  262  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>