More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1357 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  79.79 
 
 
480 aa  805    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1732  Aldehyde Dehydrogenase  66.53 
 
 
478 aa  639    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0174509  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  66.24 
 
 
481 aa  665    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  66.88 
 
 
479 aa  646    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2844  aldehyde dehydrogenase  66.39 
 
 
482 aa  639    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281069  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  79.17 
 
 
480 aa  796    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3422  aldehyde dehydrogenase  67.16 
 
 
479 aa  647    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228587  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  72 
 
 
477 aa  697    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6489  aldehyde dehydrogenase  67.3 
 
 
482 aa  662    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
480 aa  979    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  68.64 
 
 
485 aa  646    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  66.46 
 
 
479 aa  644    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1119  aldehyde dehydrogenase  71.01 
 
 
479 aa  661    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65747 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  68.86 
 
 
485 aa  648    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  65.26 
 
 
498 aa  634  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1598  aldehyde dehydrogenase  66.17 
 
 
479 aa  632  1e-180  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  64.42 
 
 
477 aa  629  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  65.26 
 
 
477 aa  630  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2664  aldehyde dehydrogenase  67.09 
 
 
480 aa  629  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  65.68 
 
 
475 aa  629  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  64.21 
 
 
477 aa  625  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  63.58 
 
 
477 aa  621  1e-176  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0247  aldehyde dehydrogenase  67.01 
 
 
482 aa  619  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  62.55 
 
 
478 aa  619  1e-176  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0452  aldehyde dehydrogenase  64.78 
 
 
480 aa  619  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1025  aldehyde dehydrogenase  64.78 
 
 
480 aa  619  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  63.16 
 
 
477 aa  615  1e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6141  aldehyde dehydrogenase  68.04 
 
 
446 aa  593  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  57.47 
 
 
480 aa  578  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  60.63 
 
 
482 aa  578  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  58.09 
 
 
476 aa  566  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1043  Aldehyde Dehydrogenase  58.39 
 
 
483 aa  566  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2694  aldehyde dehydrogenase family protein  57.68 
 
 
480 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  57.68 
 
 
480 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  56.12 
 
 
483 aa  540  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1815  aldehyde dehydrogenase  53.94 
 
 
491 aa  517  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2128  aldehyde dehydrogenase  52.75 
 
 
486 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0517784  hitchhiker  0.00570201 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  53.6 
 
 
486 aa  511  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2256  aldehyde dehydrogenase  55.63 
 
 
478 aa  511  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134767  hitchhiker  0.000000459097 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05501  hypothetical protein  52.75 
 
 
486 aa  503  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0877  aldehyde dehydrogenase  52.12 
 
 
487 aa  501  1e-141  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3017  aldehyde dehydrogenase  55.51 
 
 
478 aa  503  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1240  aldehyde dehydrogenase  52.33 
 
 
484 aa  499  1e-140  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.208234 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0813  aldehyde dehydrogenase  52.33 
 
 
482 aa  496  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1054  aldehyde dehydrogenase  66.86 
 
 
441 aa  493  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395537  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3381  aldehyde dehydrogenase  50.84 
 
 
482 aa  491  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.464458  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3959  Aldehyde Dehydrogenase  50.42 
 
 
482 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.424065  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  47.03 
 
 
482 aa  417  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  45.03 
 
 
479 aa  402  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  42.8 
 
 
493 aa  397  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  42.11 
 
 
498 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  42.62 
 
 
500 aa  395  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 
505 aa  395  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  46.44 
 
 
488 aa  375  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  42.05 
 
 
497 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  41.84 
 
 
503 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  42.59 
 
 
483 aa  369  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  39.92 
 
 
484 aa  370  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  42.02 
 
 
496 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  39.71 
 
 
496 aa  368  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 
498 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3632  aldehyde dehydrogenase family protein  42.86 
 
 
482 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  43.4 
 
 
516 aa  366  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  42.17 
 
 
498 aa  364  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  42.5 
 
 
481 aa  364  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  41.21 
 
 
493 aa  363  3e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  43.37 
 
 
482 aa  363  4e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  43.61 
 
 
483 aa  363  5.0000000000000005e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  41.47 
 
 
496 aa  363  5.0000000000000005e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  38.53 
 
 
499 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  41.39 
 
 
485 aa  359  7e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  45.15 
 
 
474 aa  358  9.999999999999999e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  41.05 
 
 
493 aa  355  1e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4351  aldehyde dehydrogenase  41.39 
 
 
491 aa  355  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  41.3 
 
 
485 aa  353  4e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  39.23 
 
 
478 aa  346  6e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3306  Aldehyde Dehydrogenase  43.34 
 
 
497 aa  340  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  39.09 
 
 
490 aa  340  4e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1076  aldehyde dehydrogenase  43.28 
 
 
505 aa  334  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.992962  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  39.31 
 
 
491 aa  334  2e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3572  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.04 
 
 
506 aa  331  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  38.25 
 
 
490 aa  329  8e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  40 
 
 
494 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  38.46 
 
 
493 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.88 
 
 
493 aa  326  7e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  37.74 
 
 
496 aa  321  9.999999999999999e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2257  aldehyde dehydrogenase  41.99 
 
 
457 aa  322  9.999999999999999e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.955322  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  38.05 
 
 
493 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  38.52 
 
 
488 aa  320  3e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  38.54 
 
 
480 aa  319  6e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1328  aldehyde dehydrogenase  40.53 
 
 
483 aa  319  7.999999999999999e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447584  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  40.13 
 
 
491 aa  317  2e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  38.25 
 
 
493 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  36.74 
 
 
496 aa  316  6e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  36.74 
 
 
496 aa  316  6e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.76 
 
 
481 aa  316  7e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  38.32 
 
 
488 aa  315  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.46 
 
 
493 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.69 
 
 
479 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  37.86 
 
 
510 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>