More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6489 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  73.17 
 
 		 477 aa  702    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  72.75 
 
 		 477 aa  689    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  73.26 
 
 		 498 aa  705    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  72.84 
 
 		 477 aa  693    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  66.24 
 
 		 480 aa  650    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  74.38 
 
 		 481 aa  751    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1598  aldehyde dehydrogenase  68.21 
 
 		 479 aa  643    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  66.32 
 
 		 479 aa  648    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6141  aldehyde dehydrogenase  72.87 
 
 		 446 aa  653    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6489  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 482 aa  987    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  72.42 
 
 		 477 aa  688    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2844  aldehyde dehydrogenase  66.25 
 
 		 482 aa  635    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281069  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3422  aldehyde dehydrogenase  72.03 
 
 		 479 aa  680    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  67.58 
 
 		 480 aa  675    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1119  aldehyde dehydrogenase  71.82 
 
 		 479 aa  666    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65747 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  65.41 
 
 		 480 aa  647    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  70.56 
 
 		 479 aa  667    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  69.6 
 
 		 475 aa  674    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  73.58 
 
 		 477 aa  696    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1732  Aldehyde Dehydrogenase  68.07 
 
 		 478 aa  632  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0174509  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  67.92 
 
 		 485 aa  629  1e-179  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  67.71 
 
 		 485 aa  627  1e-178  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2664  aldehyde dehydrogenase  65.97 
 
 		 480 aa  620  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0452  aldehyde dehydrogenase  65.47 
 
 		 480 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1025  aldehyde dehydrogenase  65.25 
 
 		 480 aa  610  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  65.54 
 
 		 477 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0247  aldehyde dehydrogenase  67.15 
 
 		 482 aa  597  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  59.62 
 
 		 476 aa  593  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  62.74 
 
 		 482 aa  590  1e-167  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  58.4 
 
 		 480 aa  582  1.0000000000000001e-165  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1043  Aldehyde Dehydrogenase  60.08 
 
 		 483 aa  576  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2694  aldehyde dehydrogenase family protein  58.82 
 
 		 480 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  58.82 
 
 		 480 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  57.59 
 
 		 478 aa  565  1e-160  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  56.69 
 
 		 483 aa  547  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05501  hypothetical protein  56 
 
 		 486 aa  535  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  55.79 
 
 		 486 aa  535  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2128  aldehyde dehydrogenase  54.22 
 
 		 486 aa  534  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0517784  hitchhiker  0.00570201 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2256  aldehyde dehydrogenase  55.83 
 
 		 478 aa  521  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134767  hitchhiker  0.000000459097 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0877  aldehyde dehydrogenase  53.47 
 
 		 487 aa  518  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1815  aldehyde dehydrogenase  53.72 
 
 		 491 aa  518  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3381  aldehyde dehydrogenase  53.56 
 
 		 482 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.464458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0813  aldehyde dehydrogenase  52.53 
 
 		 482 aa  501  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3017  aldehyde dehydrogenase  54.81 
 
 		 478 aa  491  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1240  aldehyde dehydrogenase  52.85 
 
 		 484 aa  491  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208234 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3959  Aldehyde Dehydrogenase  53.16 
 
 		 482 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.424065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1054  aldehyde dehydrogenase  63.66 
 
 		 441 aa  475  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  45.57 
 
 		 482 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  43.28 
 
 		 493 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  43.42 
 
 		 479 aa  377  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  44.24 
 
 		 483 aa  374  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  40.54 
 
 		 496 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  41.54 
 
 		 505 aa  373  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  41.75 
 
 		 503 aa  373  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  41.75 
 
 		 497 aa  371  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  42.98 
 
 		 500 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  39.83 
 
 		 498 aa  368  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  44.42 
 
 		 483 aa  367  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  42.48 
 
 		 485 aa  364  2e-99  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  43.12 
 
 		 485 aa  359  6e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  38.91 
 
 		 499 aa  355  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  41.75 
 
 		 493 aa  355  1e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  41.42 
 
 		 496 aa  353  4e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  42.23 
 
 		 493 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3632  aldehyde dehydrogenase family protein  40.87 
 
 		 482 aa  351  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  39.19 
 
 		 478 aa  348  1e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  39.59 
 
 		 484 aa  348  2e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  39.05 
 
 		 496 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  41.53 
 
 		 482 aa  342  7e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  41.16 
 
 		 498 aa  341  1e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  41.82 
 
 		 481 aa  341  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  42.06 
 
 		 516 aa  340  5e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  43.96 
 
 		 488 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  46.99 
 
 		 474 aa  337  1.9999999999999998e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  40.71 
 
 		 498 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  39.88 
 
 		 490 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4351  aldehyde dehydrogenase  41.16 
 
 		 491 aa  328  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  40.13 
 
 		 490 aa  323  3e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1328  aldehyde dehydrogenase  40.87 
 
 		 483 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2257  aldehyde dehydrogenase  42.61 
 
 		 457 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.955322  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3306  Aldehyde Dehydrogenase  41.51 
 
 		 497 aa  313  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  38.84 
 
 		 491 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1076  aldehyde dehydrogenase  42.71 
 
 		 505 aa  311  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.992962  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  40.43 
 
 		 480 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0965  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  38.36 
 
 		 507 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  38.68 
 
 		 494 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  37.68 
 
 		 497 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  38.62 
 
 		 490 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.97 
 
 		 479 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1729  aldehyde dehydrogenase  38.98 
 
 		 475 aa  302  7.000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00132327  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  35.7 
 
 		 502 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0338  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  40.34 
 
 		 513 aa  301  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0563  betaine aldehyde dehydrogenase  39.62 
 
 		 487 aa  300  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.886348  normal  0.578799 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5835  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.87 
 
 		 488 aa  300  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3498  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  37.21 
 
 		 489 aa  299  9e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.23 
 
 		 483 aa  299  9e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.97 
 
 		 500 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  35.67 
 
 		 496 aa  298  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2158  aldehyde dehydrogenase  38.59 
 
 		 475 aa  298  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  35.67 
 
 		 496 aa  298  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>