More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2128 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2694  aldehyde dehydrogenase family protein  66.1 
 
 
480 aa  640    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0877  aldehyde dehydrogenase  87.81 
 
 
487 aa  890    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05501  hypothetical protein  87.24 
 
 
486 aa  891    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0813  aldehyde dehydrogenase  80.92 
 
 
482 aa  800    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  86.42 
 
 
486 aa  883    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1815  aldehyde dehydrogenase  80.29 
 
 
491 aa  825    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  66.1 
 
 
480 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1240  aldehyde dehydrogenase  76.35 
 
 
484 aa  785    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.208234 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2128  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
486 aa  998    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0517784  hitchhiker  0.00570201 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  62 
 
 
480 aa  627  1e-178  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3381  aldehyde dehydrogenase  61.1 
 
 
482 aa  610  1e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.464458  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  57.87 
 
 
483 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  53.32 
 
 
477 aa  527  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  53.3 
 
 
479 aa  523  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  53.11 
 
 
477 aa  521  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6489  aldehyde dehydrogenase  54.22 
 
 
482 aa  520  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  52.7 
 
 
477 aa  515  1.0000000000000001e-145  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  52.58 
 
 
480 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  52.75 
 
 
480 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  52.07 
 
 
498 aa  512  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  53.83 
 
 
481 aa  514  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  52.28 
 
 
480 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2844  aldehyde dehydrogenase  54.45 
 
 
482 aa  511  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281069  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  52.07 
 
 
477 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  53.21 
 
 
479 aa  510  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  52.07 
 
 
477 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1732  Aldehyde Dehydrogenase  53.85 
 
 
478 aa  507  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0174509  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  52.95 
 
 
485 aa  504  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  52.95 
 
 
485 aa  504  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  53.4 
 
 
475 aa  501  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1119  aldehyde dehydrogenase  55.41 
 
 
479 aa  503  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65747 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2664  aldehyde dehydrogenase  52.73 
 
 
480 aa  500  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1598  aldehyde dehydrogenase  51.8 
 
 
479 aa  496  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3422  aldehyde dehydrogenase  52.22 
 
 
479 aa  491  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228587  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0452  aldehyde dehydrogenase  52.14 
 
 
480 aa  488  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1025  aldehyde dehydrogenase  51.92 
 
 
480 aa  487  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  51.38 
 
 
477 aa  487  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0247  aldehyde dehydrogenase  52.97 
 
 
482 aa  487  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  50.64 
 
 
482 aa  484  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6141  aldehyde dehydrogenase  51.84 
 
 
446 aa  481  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  48.73 
 
 
476 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  49.16 
 
 
478 aa  476  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1043  Aldehyde Dehydrogenase  50.11 
 
 
483 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2256  aldehyde dehydrogenase  46.79 
 
 
478 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134767  hitchhiker  0.000000459097 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3017  aldehyde dehydrogenase  47.86 
 
 
478 aa  425  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1054  aldehyde dehydrogenase  56.53 
 
 
441 aa  428  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395537  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3959  Aldehyde Dehydrogenase  44.14 
 
 
482 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.424065  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  41.05 
 
 
482 aa  361  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  36.8 
 
 
479 aa  337  1.9999999999999998e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  37.63 
 
 
496 aa  330  3e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  37.08 
 
 
505 aa  329  8e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  38.11 
 
 
485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  37.34 
 
 
500 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3632  aldehyde dehydrogenase family protein  38.45 
 
 
482 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  39.38 
 
 
488 aa  326  7e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  37.18 
 
 
484 aa  325  1e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4351  aldehyde dehydrogenase  38.24 
 
 
491 aa  325  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  39.74 
 
 
474 aa  321  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  37.17 
 
 
485 aa  320  3e-86  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  39.2 
 
 
483 aa  320  3e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  35.29 
 
 
493 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  38.87 
 
 
482 aa  320  5e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  36.12 
 
 
498 aa  319  6e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  36.79 
 
 
516 aa  318  2e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  38.38 
 
 
483 aa  317  3e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  34.76 
 
 
496 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  36.96 
 
 
503 aa  313  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  37.39 
 
 
497 aa  312  6.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  36.55 
 
 
481 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  35.94 
 
 
493 aa  309  8e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  36.79 
 
 
493 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  36.71 
 
 
498 aa  307  3e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  35.52 
 
 
499 aa  306  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  34.25 
 
 
478 aa  302  7.000000000000001e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.13 
 
 
479 aa  300  3e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  35.08 
 
 
496 aa  295  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.85 
 
 
493 aa  293  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.26 
 
 
480 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1076  aldehyde dehydrogenase  40.28 
 
 
505 aa  291  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.992962  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.26 
 
 
480 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.26 
 
 
480 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.68 
 
 
480 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  36.33 
 
 
498 aa  290  5.0000000000000004e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.47 
 
 
480 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.68 
 
 
483 aa  290  6e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.47 
 
 
483 aa  289  8e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4428  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.44 
 
 
499 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.111659  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.44 
 
 
499 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.26 
 
 
483 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  34.85 
 
 
491 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2257  aldehyde dehydrogenase  36.92 
 
 
457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.955322  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.81 
 
 
483 aa  286  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.04 
 
 
488 aa  286  7e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.55 
 
 
479 aa  285  9e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.7 
 
 
479 aa  285  9e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.83 
 
 
480 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  35.06 
 
 
494 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  34.02 
 
 
490 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.03 
 
 
496 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.61 
 
 
486 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>