More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0828 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_1732  Aldehyde Dehydrogenase  74.68 
 
 
478 aa  722    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0174509  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  66.95 
 
 
481 aa  669    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  66.53 
 
 
498 aa  643    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  75.21 
 
 
485 aa  722    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  65.61 
 
 
480 aa  653    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
479 aa  984    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6489  aldehyde dehydrogenase  66.32 
 
 
482 aa  638    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1598  aldehyde dehydrogenase  74.79 
 
 
479 aa  741    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0452  aldehyde dehydrogenase  74 
 
 
480 aa  724    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1025  aldehyde dehydrogenase  73.89 
 
 
480 aa  721    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2844  aldehyde dehydrogenase  77.1 
 
 
482 aa  749    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281069  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3422  aldehyde dehydrogenase  67.16 
 
 
479 aa  647    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228587  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1119  aldehyde dehydrogenase  68.21 
 
 
479 aa  647    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65747 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  66.88 
 
 
480 aa  657    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2664  aldehyde dehydrogenase  74.05 
 
 
480 aa  708    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  74.79 
 
 
485 aa  720    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  67.23 
 
 
479 aa  649    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  65.04 
 
 
477 aa  635    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  66.81 
 
 
480 aa  661    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0247  aldehyde dehydrogenase  75.05 
 
 
482 aa  703    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  65.04 
 
 
477 aa  633  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  65.25 
 
 
477 aa  631  1e-179  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  64.83 
 
 
477 aa  626  1e-178  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  64.83 
 
 
477 aa  624  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  63.56 
 
 
475 aa  616  1e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  63.5 
 
 
477 aa  609  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  60.59 
 
 
476 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  63.03 
 
 
482 aa  595  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6141  aldehyde dehydrogenase  67.46 
 
 
446 aa  597  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  57.05 
 
 
480 aa  582  1.0000000000000001e-165  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1043  Aldehyde Dehydrogenase  59.02 
 
 
483 aa  580  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2694  aldehyde dehydrogenase family protein  57.89 
 
 
480 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  57.89 
 
 
480 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  57.41 
 
 
483 aa  569  1e-161  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  57.83 
 
 
478 aa  564  1.0000000000000001e-159  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  54.16 
 
 
486 aa  536  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2128  aldehyde dehydrogenase  53.3 
 
 
486 aa  532  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0517784  hitchhiker  0.00570201 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05501  hypothetical protein  54.16 
 
 
486 aa  531  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1815  aldehyde dehydrogenase  55.01 
 
 
491 aa  532  1e-150  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3381  aldehyde dehydrogenase  53.46 
 
 
482 aa  530  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.464458  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0877  aldehyde dehydrogenase  52.67 
 
 
487 aa  518  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2256  aldehyde dehydrogenase  54.09 
 
 
478 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134767  hitchhiker  0.000000459097 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0813  aldehyde dehydrogenase  52.67 
 
 
482 aa  508  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1240  aldehyde dehydrogenase  52.34 
 
 
484 aa  504  1e-141  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.208234 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3017  aldehyde dehydrogenase  54.3 
 
 
478 aa  498  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3959  Aldehyde Dehydrogenase  52.44 
 
 
482 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.424065  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1054  aldehyde dehydrogenase  62.68 
 
 
441 aa  472  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395537  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  46.09 
 
 
482 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  43.13 
 
 
479 aa  393  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  45.25 
 
 
483 aa  388  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  42.71 
 
 
493 aa  383  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  45.71 
 
 
474 aa  379  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  40.84 
 
 
498 aa  376  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  41.26 
 
 
499 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  46.11 
 
 
488 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 
503 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3632  aldehyde dehydrogenase family protein  43.36 
 
 
482 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  41.88 
 
 
500 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  42.24 
 
 
483 aa  365  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  42.77 
 
 
497 aa  365  1e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  40.13 
 
 
496 aa  364  2e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  41.49 
 
 
482 aa  362  9e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  42 
 
 
481 aa  362  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  43.78 
 
 
516 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  41.75 
 
 
485 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 
505 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  40.29 
 
 
478 aa  355  7.999999999999999e-97  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  39.71 
 
 
496 aa  354  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  41.65 
 
 
485 aa  352  8.999999999999999e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  41.63 
 
 
493 aa  349  7e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4351  aldehyde dehydrogenase  41.37 
 
 
491 aa  346  5e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1076  aldehyde dehydrogenase  43.47 
 
 
505 aa  346  6e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.992962  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3306  Aldehyde Dehydrogenase  45.87 
 
 
497 aa  346  7e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  43.16 
 
 
493 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  42.71 
 
 
498 aa  342  7e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  39.2 
 
 
484 aa  341  1e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  40.96 
 
 
498 aa  339  5e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  40.21 
 
 
496 aa  338  9.999999999999999e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  39.25 
 
 
483 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  40.12 
 
 
488 aa  319  9e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  40.12 
 
 
488 aa  318  1e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2257  aldehyde dehydrogenase  41.7 
 
 
457 aa  317  3e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.955322  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1328  aldehyde dehydrogenase  41 
 
 
483 aa  316  7e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447584  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  38.62 
 
 
483 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  37.53 
 
 
490 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  40.54 
 
 
496 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  37.42 
 
 
490 aa  312  9e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  37.53 
 
 
497 aa  310  4e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.49 
 
 
482 aa  310  5e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  38.4 
 
 
494 aa  309  8e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  40 
 
 
479 aa  309  8e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.28 
 
 
482 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.28 
 
 
482 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  38.28 
 
 
482 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.28 
 
 
482 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  38.96 
 
 
506 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.17 
 
 
483 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  38.28 
 
 
482 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.99 
 
 
498 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  38.67 
 
 
501 aa  307  3e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.259255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>