More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2910 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  83.44 
 
 
477 aa  810    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  83.86 
 
 
498 aa  823    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  70.92 
 
 
481 aa  706    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  65.04 
 
 
479 aa  643    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  97.27 
 
 
477 aa  932    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1119  aldehyde dehydrogenase  70.35 
 
 
479 aa  670    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65747 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6141  aldehyde dehydrogenase  83.52 
 
 
446 aa  758    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
477 aa  973    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3422  aldehyde dehydrogenase  69.31 
 
 
479 aa  659    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228587  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  84.07 
 
 
477 aa  817    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  65.05 
 
 
480 aa  638    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  83.02 
 
 
477 aa  804    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  65.26 
 
 
480 aa  643    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6489  aldehyde dehydrogenase  72.75 
 
 
482 aa  689    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  78.15 
 
 
479 aa  743    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  78.95 
 
 
475 aa  769    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1732  Aldehyde Dehydrogenase  66.11 
 
 
478 aa  634  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0174509  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  64 
 
 
480 aa  628  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2844  aldehyde dehydrogenase  63.69 
 
 
482 aa  625  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281069  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  65.34 
 
 
485 aa  621  1e-177  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1598  aldehyde dehydrogenase  64.77 
 
 
479 aa  621  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  65.13 
 
 
485 aa  619  1e-176  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0247  aldehyde dehydrogenase  66.6 
 
 
482 aa  615  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2664  aldehyde dehydrogenase  64.02 
 
 
480 aa  607  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0452  aldehyde dehydrogenase  61.65 
 
 
480 aa  596  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1025  aldehyde dehydrogenase  61.44 
 
 
480 aa  595  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  62.55 
 
 
477 aa  595  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  57.38 
 
 
480 aa  569  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  61.02 
 
 
482 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  57.95 
 
 
478 aa  562  1.0000000000000001e-159  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2694  aldehyde dehydrogenase family protein  57.42 
 
 
480 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  57.42 
 
 
480 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1043  Aldehyde Dehydrogenase  57.5 
 
 
483 aa  547  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  56.26 
 
 
476 aa  548  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  54.43 
 
 
483 aa  532  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  54.06 
 
 
486 aa  526  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1815  aldehyde dehydrogenase  53.5 
 
 
491 aa  525  1e-148  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05501  hypothetical protein  54.06 
 
 
486 aa  524  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2128  aldehyde dehydrogenase  52.07 
 
 
486 aa  521  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0517784  hitchhiker  0.00570201 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3381  aldehyde dehydrogenase  52.31 
 
 
482 aa  520  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.464458  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0877  aldehyde dehydrogenase  52.35 
 
 
487 aa  518  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2256  aldehyde dehydrogenase  54.43 
 
 
478 aa  501  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134767  hitchhiker  0.000000459097 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0813  aldehyde dehydrogenase  50.85 
 
 
482 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1240  aldehyde dehydrogenase  50.85 
 
 
484 aa  491  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.208234 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3017  aldehyde dehydrogenase  55.06 
 
 
478 aa  490  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1054  aldehyde dehydrogenase  63.46 
 
 
441 aa  477  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395537  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3959  Aldehyde Dehydrogenase  48.83 
 
 
482 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.424065  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  44.44 
 
 
505 aa  398  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  43.61 
 
 
503 aa  395  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  43.4 
 
 
497 aa  394  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  44.96 
 
 
482 aa  388  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  44.65 
 
 
483 aa  382  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  44.38 
 
 
500 aa  382  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  44.65 
 
 
498 aa  379  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  43.54 
 
 
481 aa  382  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  42.32 
 
 
493 aa  381  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  41.26 
 
 
498 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  43.76 
 
 
479 aa  380  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  40.96 
 
 
496 aa  378  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  42.77 
 
 
498 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  44.66 
 
 
485 aa  373  1e-102  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  42.17 
 
 
485 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3632  aldehyde dehydrogenase family protein  43.61 
 
 
482 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  41.34 
 
 
478 aa  369  1e-101  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  45.92 
 
 
474 aa  366  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  43.84 
 
 
483 aa  366  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  43.72 
 
 
516 aa  367  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  43.1 
 
 
482 aa  363  3e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  42.23 
 
 
496 aa  363  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  39.71 
 
 
499 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4351  aldehyde dehydrogenase  42.89 
 
 
491 aa  359  5e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  42.32 
 
 
496 aa  358  9.999999999999999e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  45.15 
 
 
488 aa  354  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  42.02 
 
 
493 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1076  aldehyde dehydrogenase  45.07 
 
 
505 aa  343  5e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.992962  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  39.04 
 
 
484 aa  341  1e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  41.56 
 
 
493 aa  341  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3306  Aldehyde Dehydrogenase  43.25 
 
 
497 aa  340  4e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  38.6 
 
 
490 aa  336  5e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  39.17 
 
 
490 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  38.67 
 
 
494 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.76 
 
 
479 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  38.62 
 
 
491 aa  316  5e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  39.17 
 
 
483 aa  315  9e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.76 
 
 
483 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  40.84 
 
 
480 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  38.99 
 
 
480 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.71 
 
 
508 aa  310  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  36.85 
 
 
496 aa  308  9e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.14 
 
 
498 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0846  aldehyde dehydrogenase  38.16 
 
 
493 aa  307  3e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  38.41 
 
 
488 aa  306  4.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  39 
 
 
483 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.89 
 
 
493 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  38.2 
 
 
488 aa  306  5.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  37.89 
 
 
490 aa  306  6e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  38.95 
 
 
483 aa  306  7e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.28 
 
 
479 aa  306  7e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.25 
 
 
479 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.1 
 
 
483 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>