More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3381 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  72.71 
 
 		 483 aa  728    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3381  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 482 aa  991    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.464458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  63.03 
 
 		 486 aa  620  1e-176  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05501  hypothetical protein  63.03 
 
 		 486 aa  621  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1815  aldehyde dehydrogenase  61.51 
 
 		 491 aa  621  1e-176  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0877  aldehyde dehydrogenase  61.32 
 
 		 487 aa  610  1e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2128  aldehyde dehydrogenase  61.1 
 
 		 486 aa  610  1e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0517784  hitchhiker  0.00570201 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  61.86 
 
 		 480 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2694  aldehyde dehydrogenase family protein  61.86 
 
 		 480 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1240  aldehyde dehydrogenase  58.96 
 
 		 484 aa  591  1e-168  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208234 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  59.87 
 
 		 480 aa  590  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0813  aldehyde dehydrogenase  58.35 
 
 		 482 aa  570  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  56.3 
 
 		 485 aa  534  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  56.3 
 
 		 485 aa  533  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  53.57 
 
 		 477 aa  527  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2844  aldehyde dehydrogenase  55.11 
 
 		 482 aa  522  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281069  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  53.15 
 
 		 477 aa  522  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  53.12 
 
 		 479 aa  524  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1598  aldehyde dehydrogenase  54.41 
 
 		 479 aa  520  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  52.73 
 
 		 477 aa  519  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  53.24 
 
 		 479 aa  520  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  52.31 
 
 		 477 aa  521  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2664  aldehyde dehydrogenase  55 
 
 		 480 aa  519  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  52.31 
 
 		 477 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1732  Aldehyde Dehydrogenase  54.76 
 
 		 478 aa  514  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0174509  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  52.94 
 
 		 498 aa  513  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  52.87 
 
 		 475 aa  512  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6489  aldehyde dehydrogenase  53.56 
 
 		 482 aa  510  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  52.81 
 
 		 481 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3422  aldehyde dehydrogenase  53.04 
 
 		 479 aa  503  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0247  aldehyde dehydrogenase  55.35 
 
 		 482 aa  498  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  51.36 
 
 		 480 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  51.36 
 
 		 480 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1119  aldehyde dehydrogenase  53.25 
 
 		 479 aa  494  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65747 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  50.84 
 
 		 480 aa  491  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  51.48 
 
 		 477 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0452  aldehyde dehydrogenase  51.26 
 
 		 480 aa  483  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1025  aldehyde dehydrogenase  51.26 
 
 		 480 aa  483  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  51.57 
 
 		 482 aa  479  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  51.27 
 
 		 478 aa  480  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  49.05 
 
 		 476 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6141  aldehyde dehydrogenase  53.94 
 
 		 446 aa  475  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1043  Aldehyde Dehydrogenase  51.04 
 
 		 483 aa  467  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3017  aldehyde dehydrogenase  49.06 
 
 		 478 aa  455  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2256  aldehyde dehydrogenase  47.39 
 
 		 478 aa  426  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134767  hitchhiker  0.000000459097 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1054  aldehyde dehydrogenase  58.69 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3959  Aldehyde Dehydrogenase  46.51 
 
 		 482 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.424065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  42.65 
 
 		 482 aa  359  7e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  41.29 
 
 		 516 aa  354  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  41.49 
 
 		 483 aa  353  2.9999999999999997e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  40.62 
 
 		 498 aa  353  5e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  39.58 
 
 		 479 aa  351  1e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  37.58 
 
 		 505 aa  348  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  38.62 
 
 		 503 aa  346  5e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  40.99 
 
 		 483 aa  344  2e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  37.47 
 
 		 499 aa  343  4e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  38.41 
 
 		 497 aa  343  4e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  38.25 
 
 		 493 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3632  aldehyde dehydrogenase family protein  39.83 
 
 		 482 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  39.83 
 
 		 496 aa  337  3.9999999999999995e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  37.68 
 
 		 496 aa  334  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1076  aldehyde dehydrogenase  43.4 
 
 		 505 aa  334  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.992962  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  39.26 
 
 		 498 aa  333  3e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  41.63 
 
 		 488 aa  333  4e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  40.33 
 
 		 482 aa  332  6e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  38.7 
 
 		 500 aa  332  9e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4351  aldehyde dehydrogenase  39.63 
 
 		 491 aa  332  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  39.58 
 
 		 493 aa  331  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  35.92 
 
 		 498 aa  330  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  38.95 
 
 		 481 aa  326  5e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  40.61 
 
 		 493 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3306  Aldehyde Dehydrogenase  41.98 
 
 		 497 aa  319  6e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  40.75 
 
 		 474 aa  317  2e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  36.78 
 
 		 496 aa  317  4e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  37.53 
 
 		 485 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.225626 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  35.38 
 
 		 478 aa  311  1e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  36.85 
 
 		 485 aa  311  2e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1328  aldehyde dehydrogenase  40.62 
 
 		 483 aa  306  7e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4281  aldehyde dehydrogenase  38.67 
 
 		 481 aa  302  8.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000626871  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  36.25 
 
 		 484 aa  302  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  37.81 
 
 		 483 aa  302  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  37.6 
 
 		 483 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2260  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.97 
 
 		 484 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.16 
 
 		 498 aa  294  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  37.45 
 
 		 480 aa  291  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  37.63 
 
 		 483 aa  289  9e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  37.06 
 
 		 489 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  37.06 
 
 		 489 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5059  betaine aldehyde dehydrogenase  38.44 
 
 		 489 aa  286  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0560116 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1591  betaine aldehyde dehydrogenase  37.24 
 
 		 489 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2257  aldehyde dehydrogenase  39.52 
 
 		 457 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.955322  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  36.36 
 
 		 497 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2311  betaine aldehyde dehydrogenase  38.03 
 
 		 483 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4560  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.61 
 
 		 496 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.288864  hitchhiker  0.00438962 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7067  Aldehyde Dehydrogenase  36.71 
 
 		 496 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  36.44 
 
 		 488 aa  281  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5599  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.19 
 
 		 496 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0279735  normal  0.51588 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4701  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.19 
 
 		 496 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00415207  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3666  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.19 
 
 		 496 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0183  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.29 
 
 		 499 aa  279  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352909  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>