More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1732 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  66.53 
 
 		 477 aa  648    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  65.69 
 
 		 477 aa  642    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1119  aldehyde dehydrogenase  69.25 
 
 		 479 aa  657    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65747 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  68.76 
 
 		 481 aa  689    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2664  aldehyde dehydrogenase  80.08 
 
 		 480 aa  761    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  81.3 
 
 		 485 aa  776    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  74.68 
 
 		 479 aa  740    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  81.09 
 
 		 485 aa  774    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  66.11 
 
 		 477 aa  642    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6489  aldehyde dehydrogenase  68.07 
 
 		 482 aa  642    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0452  aldehyde dehydrogenase  77.89 
 
 		 480 aa  764    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1025  aldehyde dehydrogenase  77.68 
 
 		 480 aa  763    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2844  aldehyde dehydrogenase  81.54 
 
 		 482 aa  796    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281069  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3422  aldehyde dehydrogenase  67.57 
 
 		 479 aa  649    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0247  aldehyde dehydrogenase  79.25 
 
 		 482 aa  735    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  67.36 
 
 		 477 aa  652    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  66.53 
 
 		 480 aa  658    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1598  aldehyde dehydrogenase  80.67 
 
 		 479 aa  795    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  66.11 
 
 		 477 aa  645    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  63.79 
 
 		 480 aa  646    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  67.86 
 
 		 479 aa  648    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  63.79 
 
 		 480 aa  640    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1732  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 		 478 aa  977    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0174509  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  67.36 
 
 		 498 aa  659    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  62.61 
 
 		 475 aa  620  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6141  aldehyde dehydrogenase  69.34 
 
 		 446 aa  616  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  63.5 
 
 		 482 aa  597  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  61.72 
 
 		 477 aa  593  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  57.81 
 
 		 480 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2694  aldehyde dehydrogenase family protein  57.81 
 
 		 480 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  58.17 
 
 		 476 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  57.74 
 
 		 478 aa  568  1e-161  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  57.2 
 
 		 480 aa  567  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  57.75 
 
 		 483 aa  555  1e-157  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1043  Aldehyde Dehydrogenase  56.39 
 
 		 483 aa  551  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  54.49 
 
 		 486 aa  528  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3381  aldehyde dehydrogenase  54.89 
 
 		 482 aa  529  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.464458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0877  aldehyde dehydrogenase  54.27 
 
 		 487 aa  526  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2128  aldehyde dehydrogenase  53.85 
 
 		 486 aa  526  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0517784  hitchhiker  0.00570201 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05501  hypothetical protein  54.06 
 
 		 486 aa  523  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1815  aldehyde dehydrogenase  54.56 
 
 		 491 aa  521  1e-146  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3017  aldehyde dehydrogenase  55.98 
 
 		 478 aa  504  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0813  aldehyde dehydrogenase  52.56 
 
 		 482 aa  503  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1240  aldehyde dehydrogenase  51.91 
 
 		 484 aa  490  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208234 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1054  aldehyde dehydrogenase  64.69 
 
 		 441 aa  488  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2256  aldehyde dehydrogenase  51.78 
 
 		 478 aa  486  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134767  hitchhiker  0.000000459097 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3959  Aldehyde Dehydrogenase  49.79 
 
 		 482 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.424065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  45.89 
 
 		 482 aa  388  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  45.51 
 
 		 483 aa  385  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  42.83 
 
 		 479 aa  382  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  43.42 
 
 		 493 aa  376  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  41.21 
 
 		 498 aa  375  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  40.75 
 
 		 496 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  44.33 
 
 		 483 aa  370  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  46.62 
 
 		 488 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  41.72 
 
 		 503 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  40.51 
 
 		 499 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  40.25 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  41.51 
 
 		 497 aa  363  4e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  45.15 
 
 		 474 aa  361  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  42.05 
 
 		 485 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  42.65 
 
 		 482 aa  359  7e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  41.65 
 
 		 500 aa  359  7e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3632  aldehyde dehydrogenase family protein  41.46 
 
 		 482 aa  351  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  40.83 
 
 		 481 aa  351  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  43.88 
 
 		 493 aa  349  5e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  41.61 
 
 		 496 aa  348  1e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  41.68 
 
 		 493 aa  348  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  40.31 
 
 		 478 aa  347  4e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  40.42 
 
 		 496 aa  345  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  42.23 
 
 		 516 aa  343  4e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  42.5 
 
 		 498 aa  343  4e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4351  aldehyde dehydrogenase  41.51 
 
 		 491 aa  343  5e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1076  aldehyde dehydrogenase  46.54 
 
 		 505 aa  341  2e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.992962  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3306  Aldehyde Dehydrogenase  45.51 
 
 		 497 aa  340  4e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  41.18 
 
 		 485 aa  339  8e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  40.88 
 
 		 498 aa  336  5.999999999999999e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  39.04 
 
 		 484 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  39.67 
 
 		 483 aa  322  7e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  39.35 
 
 		 483 aa  319  7e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  41.25 
 
 		 496 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1328  aldehyde dehydrogenase  40.88 
 
 		 483 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2257  aldehyde dehydrogenase  42.2 
 
 		 457 aa  315  9.999999999999999e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.955322  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.61 
 
 		 498 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  38.7 
 
 		 483 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  38.33 
 
 		 493 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  37.92 
 
 		 493 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  38.33 
 
 		 493 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.74 
 
 		 508 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  37.71 
 
 		 493 aa  307  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.25 
 
 		 483 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2311  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  40.46 
 
 		 506 aa  306  5.0000000000000004e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5826  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  39.79 
 
 		 485 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26319  normal  0.439131 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4441  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  40.04 
 
 		 505 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.411822 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  36.53 
 
 		 490 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.26 
 
 		 479 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  38.66 
 
 		 506 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2030  5-carboxy-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase (HpaE)  40.21 
 
 		 485 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0934174 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  37.29 
 
 		 493 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07430  hypothetical protein  38.12 
 
 		 481 aa  303  3.0000000000000004e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.782737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>