More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2257 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2257  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
457 aa  910    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.955322  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0437  aldehyde dehydrogenase  49.56 
 
 
457 aa  385  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.888266 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6003  aldehyde dehydrogenase  50.33 
 
 
463 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.746354  normal  0.0544155 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  45.58 
 
 
482 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  41.74 
 
 
484 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  42.89 
 
 
483 aa  333  5e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  45 
 
 
482 aa  331  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5125  Aldehyde Dehydrogenase  51.74 
 
 
460 aa  326  5e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  41.09 
 
 
483 aa  326  5e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  41.99 
 
 
480 aa  326  7e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.99 
 
 
480 aa  325  9e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  43.57 
 
 
485 aa  323  3e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  43.57 
 
 
485 aa  323  4e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1025  aldehyde dehydrogenase  42.92 
 
 
480 aa  323  5e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0452  aldehyde dehydrogenase  42.48 
 
 
480 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1815  aldehyde dehydrogenase  39.78 
 
 
491 aa  321  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  40.74 
 
 
479 aa  321  1.9999999999999998e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  41.34 
 
 
480 aa  320  5e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  41.34 
 
 
488 aa  319  7.999999999999999e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  41.48 
 
 
481 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  41.7 
 
 
479 aa  318  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6489  aldehyde dehydrogenase  42.61 
 
 
482 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3422  aldehyde dehydrogenase  41.61 
 
 
479 aa  311  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228587  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1598  aldehyde dehydrogenase  41.76 
 
 
479 aa  311  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0247  aldehyde dehydrogenase  42.7 
 
 
482 aa  310  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1043  Aldehyde Dehydrogenase  42.64 
 
 
483 aa  309  5.9999999999999995e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1732  Aldehyde Dehydrogenase  42.2 
 
 
478 aa  307  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0174509  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2844  aldehyde dehydrogenase  41.36 
 
 
482 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281069  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  41.43 
 
 
474 aa  306  3e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  41.76 
 
 
475 aa  307  3e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  39.61 
 
 
483 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1119  aldehyde dehydrogenase  42.05 
 
 
479 aa  305  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65747 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1240  aldehyde dehydrogenase  41.01 
 
 
484 aa  303  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.208234 
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  40.22 
 
 
477 aa  303  5.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  39.78 
 
 
479 aa  303  6.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  39.78 
 
 
477 aa  302  7.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2664  aldehyde dehydrogenase  41.18 
 
 
480 aa  302  9e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  37.63 
 
 
499 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  37.2 
 
 
503 aa  302  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  38.26 
 
 
480 aa  301  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3017  aldehyde dehydrogenase  41.7 
 
 
478 aa  301  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  40 
 
 
477 aa  300  3e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  36.7 
 
 
497 aa  300  4e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.27 
 
 
477 aa  300  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  38.02 
 
 
486 aa  299  7e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05501  hypothetical protein  38.24 
 
 
486 aa  298  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  36.68 
 
 
478 aa  298  2e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2128  aldehyde dehydrogenase  36.92 
 
 
486 aa  296  7e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0517784  hitchhiker  0.00570201 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  37.26 
 
 
498 aa  295  8e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  39.65 
 
 
478 aa  296  8e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  38.49 
 
 
493 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  36.72 
 
 
505 aa  295  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3381  aldehyde dehydrogenase  39.52 
 
 
482 aa  294  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.464458  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  39.34 
 
 
498 aa  293  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  38.68 
 
 
476 aa  293  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  38.86 
 
 
477 aa  292  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  36.32 
 
 
500 aa  292  7e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  38.84 
 
 
498 aa  292  8e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  38.61 
 
 
496 aa  291  1e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  38.04 
 
 
496 aa  291  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  38.86 
 
 
477 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4047  Aldehyde Dehydrogenase  40.52 
 
 
468 aa  290  4e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  38.3 
 
 
496 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0877  aldehyde dehydrogenase  37.14 
 
 
487 aa  289  7e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  38.65 
 
 
480 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  37.96 
 
 
493 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2694  aldehyde dehydrogenase family protein  38.65 
 
 
480 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  39.44 
 
 
482 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  37.93 
 
 
516 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0813  aldehyde dehydrogenase  36.7 
 
 
482 aa  280  4e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  36.97 
 
 
493 aa  278  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07430  hypothetical protein  35.89 
 
 
481 aa  278  1e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.782737  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2295  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  37.63 
 
 
491 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  39.22 
 
 
485 aa  277  3e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6141  aldehyde dehydrogenase  39.62 
 
 
446 aa  276  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1966  Aldehyde Dehydrogenase  37.5 
 
 
478 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.57596 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2256  aldehyde dehydrogenase  41.36 
 
 
478 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134767  hitchhiker  0.000000459097 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  37.01 
 
 
481 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  37.31 
 
 
501 aa  273  5.000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1054  aldehyde dehydrogenase  44.97 
 
 
441 aa  270  4e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395537  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  36.64 
 
 
498 aa  269  8e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0539  Betaine-aldehyde dehydrogenase  38.59 
 
 
478 aa  268  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.809876  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3047  Aldehyde Dehydrogenase  35.62 
 
 
508 aa  266  5e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  35.84 
 
 
485 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  36.8 
 
 
494 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  32.97 
 
 
485 aa  264  2e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000365  betaine aldehyde dehydrogenase  34.55 
 
 
486 aa  264  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5826  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  34.26 
 
 
485 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26319  normal  0.439131 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3306  Aldehyde Dehydrogenase  38.81 
 
 
497 aa  263  4e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0237  Betaine-aldehyde dehydrogenase  38.28 
 
 
493 aa  263  4e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1807  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  39.43 
 
 
468 aa  263  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02060  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  35.67 
 
 
495 aa  262  6.999999999999999e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  36.61 
 
 
497 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2125  Aldehyde Dehydrogenase  37.39 
 
 
488 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  35.5 
 
 
492 aa  261  2e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1333  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  36.88 
 
 
505 aa  260  3e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.285916  normal  0.0481185 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.76 
 
 
483 aa  260  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  35.28 
 
 
488 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  35.79 
 
 
498 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  35.28 
 
 
488 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>