More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0495 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
482 aa  975    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  63.03 
 
 
479 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2844  aldehyde dehydrogenase  63.88 
 
 
482 aa  610  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281069  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  62.45 
 
 
480 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  63.67 
 
 
485 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  61.47 
 
 
480 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  63.47 
 
 
485 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  61.01 
 
 
481 aa  600  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0452  aldehyde dehydrogenase  62.42 
 
 
480 aa  599  1e-170  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1732  Aldehyde Dehydrogenase  63.5 
 
 
478 aa  597  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0174509  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1025  aldehyde dehydrogenase  62 
 
 
480 aa  597  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6489  aldehyde dehydrogenase  62.74 
 
 
482 aa  597  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  60.63 
 
 
480 aa  596  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1119  aldehyde dehydrogenase  64.42 
 
 
479 aa  597  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65747 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2664  aldehyde dehydrogenase  63.58 
 
 
480 aa  596  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3422  aldehyde dehydrogenase  63.37 
 
 
479 aa  594  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228587  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1598  aldehyde dehydrogenase  61.3 
 
 
479 aa  591  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  61.23 
 
 
477 aa  581  1.0000000000000001e-165  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  62.08 
 
 
498 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  62.03 
 
 
475 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  61.02 
 
 
477 aa  578  1e-164  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  60.13 
 
 
476 aa  578  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  62.16 
 
 
477 aa  579  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  59.96 
 
 
477 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  61.02 
 
 
477 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2694  aldehyde dehydrogenase family protein  59.17 
 
 
480 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  59.17 
 
 
480 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  59.12 
 
 
479 aa  570  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  60.17 
 
 
477 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0247  aldehyde dehydrogenase  63.45 
 
 
482 aa  559  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  55.23 
 
 
480 aa  557  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  59.57 
 
 
478 aa  555  1e-157  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6141  aldehyde dehydrogenase  63.92 
 
 
446 aa  542  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1043  Aldehyde Dehydrogenase  56.48 
 
 
483 aa  531  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1815  aldehyde dehydrogenase  53.09 
 
 
491 aa  528  1e-149  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  55.63 
 
 
483 aa  523  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  52.75 
 
 
486 aa  518  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05501  hypothetical protein  52.97 
 
 
486 aa  519  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0877  aldehyde dehydrogenase  51.48 
 
 
487 aa  510  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2128  aldehyde dehydrogenase  50.64 
 
 
486 aa  504  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0517784  hitchhiker  0.00570201 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3017  aldehyde dehydrogenase  57.45 
 
 
478 aa  503  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2256  aldehyde dehydrogenase  56.21 
 
 
478 aa  501  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134767  hitchhiker  0.000000459097 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1240  aldehyde dehydrogenase  51.06 
 
 
484 aa  496  1e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.208234 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0813  aldehyde dehydrogenase  50.21 
 
 
482 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3381  aldehyde dehydrogenase  51.57 
 
 
482 aa  494  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.464458  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3959  Aldehyde Dehydrogenase  53.49 
 
 
482 aa  458  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.424065  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1054  aldehyde dehydrogenase  61.93 
 
 
441 aa  442  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395537  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  45.49 
 
 
493 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  47.9 
 
 
482 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  42.77 
 
 
505 aa  393  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  45.42 
 
 
498 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  45.72 
 
 
483 aa  389  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  43.4 
 
 
503 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  42.95 
 
 
499 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  49.34 
 
 
474 aa  384  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  43.4 
 
 
497 aa  385  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  43.34 
 
 
479 aa  384  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  42.95 
 
 
498 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  41.79 
 
 
478 aa  377  1e-103  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  43.12 
 
 
500 aa  378  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  46.32 
 
 
493 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3632  aldehyde dehydrogenase family protein  43.33 
 
 
482 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  44.42 
 
 
493 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  43.24 
 
 
516 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  46.62 
 
 
488 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  45.28 
 
 
483 aa  370  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  43.37 
 
 
481 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  40.08 
 
 
496 aa  361  2e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4351  aldehyde dehydrogenase  43.66 
 
 
491 aa  360  3e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  44.42 
 
 
496 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  41.46 
 
 
490 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  41.93 
 
 
485 aa  356  5e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  42.95 
 
 
482 aa  354  2e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  42.59 
 
 
498 aa  353  5e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  40.46 
 
 
484 aa  351  2e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  41.81 
 
 
496 aa  350  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  41.19 
 
 
496 aa  345  8e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  41.3 
 
 
485 aa  340  2.9999999999999998e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0338  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  45.17 
 
 
513 aa  336  5.999999999999999e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  40.97 
 
 
490 aa  335  9e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.88 
 
 
479 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2257  aldehyde dehydrogenase  45 
 
 
457 aa  334  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.955322  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  39.92 
 
 
510 aa  333  4e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5059  betaine aldehyde dehydrogenase  41.18 
 
 
489 aa  333  5e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0560116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1328  aldehyde dehydrogenase  43.1 
 
 
483 aa  332  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447584  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2311  betaine aldehyde dehydrogenase  41.75 
 
 
483 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.3 
 
 
498 aa  330  3e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  39.29 
 
 
490 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1591  betaine aldehyde dehydrogenase  41.39 
 
 
489 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4323  aldehyde dehydrogenase  40.71 
 
 
503 aa  329  6e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3940  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  39.5 
 
 
498 aa  329  8e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.90589  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  40.29 
 
 
501 aa  328  9e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  39.58 
 
 
506 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2117  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  39.71 
 
 
498 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.591091 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4441  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  40.69 
 
 
505 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.411822 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  36.91 
 
 
497 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  39.75 
 
 
493 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2311  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  41.3 
 
 
506 aa  324  2e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  40.42 
 
 
497 aa  324  3e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0855  betaine aldehyde dehydrogenase  42.92 
 
 
483 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>