More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4477 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1119  aldehyde dehydrogenase  72.23 
 
 		 479 aa  678    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65747 
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  85.32 
 
 		 477 aa  835    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6141  aldehyde dehydrogenase  96.77 
 
 		 446 aa  854    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  65.47 
 
 		 480 aa  644    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  84.91 
 
 		 477 aa  830    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  83.23 
 
 		 477 aa  817    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  73.22 
 
 		 481 aa  725    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1598  aldehyde dehydrogenase  67.3 
 
 		 479 aa  642    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  66.53 
 
 		 479 aa  645    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  66.25 
 
 		 485 aa  635    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  66.67 
 
 		 485 aa  638    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 498 aa  1014    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2844  aldehyde dehydrogenase  66.39 
 
 		 482 aa  643    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281069  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3422  aldehyde dehydrogenase  69.1 
 
 		 479 aa  657    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  83.86 
 
 		 477 aa  818    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  65.26 
 
 		 480 aa  645    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  86.37 
 
 		 477 aa  846    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  80.67 
 
 		 479 aa  768    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  78.11 
 
 		 475 aa  767    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6489  aldehyde dehydrogenase  73.26 
 
 		 482 aa  699    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1732  Aldehyde Dehydrogenase  67.36 
 
 		 478 aa  642    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0174509  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  64.42 
 
 		 480 aa  634  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0452  aldehyde dehydrogenase  63.45 
 
 		 480 aa  616  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1025  aldehyde dehydrogenase  63.24 
 
 		 480 aa  615  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2664  aldehyde dehydrogenase  63.96 
 
 		 480 aa  613  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0247  aldehyde dehydrogenase  65.98 
 
 		 482 aa  610  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  61.3 
 
 		 477 aa  586  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  58.44 
 
 		 480 aa  581  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2694  aldehyde dehydrogenase family protein  59.32 
 
 		 480 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  59.32 
 
 		 480 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  62.08 
 
 		 482 aa  569  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  57.81 
 
 		 476 aa  567  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  57.32 
 
 		 478 aa  558  1e-158  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1043  Aldehyde Dehydrogenase  57.08 
 
 		 483 aa  551  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  54.49 
 
 		 486 aa  536  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  55.06 
 
 		 483 aa  536  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05501  hypothetical protein  54.06 
 
 		 486 aa  528  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1815  aldehyde dehydrogenase  53.78 
 
 		 491 aa  528  1e-149  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2128  aldehyde dehydrogenase  52.07 
 
 		 486 aa  525  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0517784  hitchhiker  0.00570201 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3381  aldehyde dehydrogenase  52.94 
 
 		 482 aa  521  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.464458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0877  aldehyde dehydrogenase  51.04 
 
 		 487 aa  518  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2256  aldehyde dehydrogenase  54.43 
 
 		 478 aa  504  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134767  hitchhiker  0.000000459097 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1240  aldehyde dehydrogenase  51.06 
 
 		 484 aa  499  1e-140  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208234 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0813  aldehyde dehydrogenase  50 
 
 		 482 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1054  aldehyde dehydrogenase  65.82 
 
 		 441 aa  491  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3017  aldehyde dehydrogenase  59.47 
 
 		 478 aa  488  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3959  Aldehyde Dehydrogenase  49.47 
 
 		 482 aa  435  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.424065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  45.85 
 
 		 482 aa  401  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 		 505 aa  385  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  41.08 
 
 		 496 aa  383  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  43.97 
 
 		 479 aa  379  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  40 
 
 		 498 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  43.33 
 
 		 500 aa  379  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  43.89 
 
 		 485 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  42.26 
 
 		 503 aa  379  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  42.98 
 
 		 493 aa  377  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  43.79 
 
 		 485 aa  378  1e-103  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  42.26 
 
 		 497 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  46.58 
 
 		 474 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  42.44 
 
 		 496 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  43.19 
 
 		 483 aa  365  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  42.95 
 
 		 496 aa  365  1e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  44.31 
 
 		 483 aa  365  1e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  43.31 
 
 		 516 aa  363  3e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3632  aldehyde dehydrogenase family protein  43.07 
 
 		 482 aa  362  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  38.61 
 
 		 499 aa  359  5e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  42.92 
 
 		 498 aa  359  8e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  42.14 
 
 		 498 aa  358  9.999999999999999e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  39.67 
 
 		 478 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  42.71 
 
 		 481 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  44.94 
 
 		 488 aa  356  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  42.68 
 
 		 482 aa  352  1e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4351  aldehyde dehydrogenase  42.83 
 
 		 491 aa  350  3e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  40.97 
 
 		 493 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  38.41 
 
 		 484 aa  342  8e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  41.56 
 
 		 493 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  40.54 
 
 		 494 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  37.35 
 
 		 490 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3306  Aldehyde Dehydrogenase  42.29 
 
 		 497 aa  325  1e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.2 
 
 		 483 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1076  aldehyde dehydrogenase  43.71 
 
 		 505 aa  325  1e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.992962  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  39.04 
 
 		 491 aa  324  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.9 
 
 		 479 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.38 
 
 		 479 aa  318  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.92 
 
 		 483 aa  316  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  39.66 
 
 		 480 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3572  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.11 
 
 		 506 aa  313  2.9999999999999996e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  38.62 
 
 		 496 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0846  aldehyde dehydrogenase  40.67 
 
 		 493 aa  313  4.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.43 
 
 		 496 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  37.76 
 
 		 497 aa  311  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  37.76 
 
 		 490 aa  311  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  37.68 
 
 		 490 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5826  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  39.66 
 
 		 485 aa  310  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26319  normal  0.439131 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4047  Aldehyde Dehydrogenase  40.66 
 
 		 468 aa  309  5.9999999999999995e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.05 
 
 		 498 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2568  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.08 
 
 		 486 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.951924  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.31 
 
 		 479 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.76 
 
 		 488 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4281  aldehyde dehydrogenase  41.03 
 
 		 481 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000626871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>