More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1054 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_1054  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
441 aa  902    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395537  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  76 
 
 
478 aa  567  1e-160  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  67.43 
 
 
480 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  66.86 
 
 
480 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1732  Aldehyde Dehydrogenase  64.69 
 
 
478 aa  488  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0174509  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  66.1 
 
 
477 aa  491  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6141  aldehyde dehydrogenase  65.25 
 
 
446 aa  488  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  64.89 
 
 
481 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  65.82 
 
 
498 aa  491  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1598  aldehyde dehydrogenase  65.44 
 
 
479 aa  486  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  65.82 
 
 
477 aa  488  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  66.86 
 
 
480 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  65.92 
 
 
485 aa  481  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  64.41 
 
 
477 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  63.84 
 
 
477 aa  483  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  65.64 
 
 
485 aa  479  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2844  aldehyde dehydrogenase  64.53 
 
 
482 aa  480  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281069  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  66.29 
 
 
477 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  63.46 
 
 
477 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6489  aldehyde dehydrogenase  63.66 
 
 
482 aa  475  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  62.68 
 
 
479 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  63.28 
 
 
479 aa  474  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0452  aldehyde dehydrogenase  63.82 
 
 
480 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3422  aldehyde dehydrogenase  65.27 
 
 
479 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228587  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2664  aldehyde dehydrogenase  63.97 
 
 
480 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  64.77 
 
 
480 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1025  aldehyde dehydrogenase  63.53 
 
 
480 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  62.99 
 
 
475 aa  467  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1119  aldehyde dehydrogenase  64.15 
 
 
479 aa  466  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2694  aldehyde dehydrogenase family protein  64.77 
 
 
480 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0247  aldehyde dehydrogenase  63.97 
 
 
482 aa  459  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  61.93 
 
 
482 aa  442  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  58.52 
 
 
486 aa  436  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  59.38 
 
 
476 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1240  aldehyde dehydrogenase  57.58 
 
 
484 aa  433  1e-120  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.208234 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05501  hypothetical protein  58.52 
 
 
486 aa  433  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1043  Aldehyde Dehydrogenase  61.02 
 
 
483 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2128  aldehyde dehydrogenase  56.53 
 
 
486 aa  429  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0517784  hitchhiker  0.00570201 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0877  aldehyde dehydrogenase  57.1 
 
 
487 aa  427  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  58.81 
 
 
483 aa  425  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1815  aldehyde dehydrogenase  57.63 
 
 
491 aa  424  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3381  aldehyde dehydrogenase  58.69 
 
 
482 aa  425  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.464458  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  56.41 
 
 
480 aa  417  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3017  aldehyde dehydrogenase  60.11 
 
 
478 aa  413  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0813  aldehyde dehydrogenase  55.52 
 
 
482 aa  408  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2256  aldehyde dehydrogenase  53.67 
 
 
478 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134767  hitchhiker  0.000000459097 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  50.71 
 
 
482 aa  345  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  48.82 
 
 
493 aa  335  7e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  49.27 
 
 
479 aa  330  3e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  50.44 
 
 
483 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3959  Aldehyde Dehydrogenase  49.86 
 
 
482 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.424065  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  49.86 
 
 
474 aa  315  9.999999999999999e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  46.49 
 
 
498 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  49.58 
 
 
488 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  47.09 
 
 
500 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  48.1 
 
 
516 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  47.09 
 
 
482 aa  311  1e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  48.1 
 
 
483 aa  307  3e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  44.44 
 
 
499 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  44.35 
 
 
478 aa  301  2e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  44.74 
 
 
497 aa  299  6e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  44.02 
 
 
493 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  44.15 
 
 
503 aa  296  4e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  43.27 
 
 
505 aa  296  4e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  45.77 
 
 
496 aa  296  5e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1076  aldehyde dehydrogenase  48.17 
 
 
505 aa  296  6e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.992962  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  43.6 
 
 
481 aa  292  9e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  44.48 
 
 
498 aa  292  9e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  44.31 
 
 
493 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  45.32 
 
 
498 aa  290  4e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  41.82 
 
 
496 aa  290  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4351  aldehyde dehydrogenase  43.3 
 
 
491 aa  289  8e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  42.17 
 
 
485 aa  289  9e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1054  Aldehyde Dehydrogenase  43.55 
 
 
513 aa  288  9e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3632  aldehyde dehydrogenase family protein  41.88 
 
 
482 aa  288  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  40.79 
 
 
496 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  43.53 
 
 
490 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0965  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  42.47 
 
 
507 aa  286  5e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  43.02 
 
 
485 aa  285  1.0000000000000001e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3306  Aldehyde Dehydrogenase  47.44 
 
 
497 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3572  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.03 
 
 
506 aa  284  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.61 
 
 
508 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  44.86 
 
 
483 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  42.82 
 
 
484 aa  279  8e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  43.31 
 
 
501 aa  278  1e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  42.29 
 
 
510 aa  278  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  42.65 
 
 
510 aa  277  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.41 
 
 
498 aa  276  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0846  aldehyde dehydrogenase  44.8 
 
 
493 aa  276  6e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  43.14 
 
 
491 aa  275  8e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  43.84 
 
 
512 aa  275  9e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  43.3 
 
 
483 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1006  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.19 
 
 
491 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.179638  normal  0.457717 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1942  aldehyde dehydrogenase family protein  46.04 
 
 
496 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2260  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.3 
 
 
484 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  43.84 
 
 
510 aa  273  4.0000000000000004e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  43.55 
 
 
517 aa  272  7e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0642  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  46.04 
 
 
496 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2026  aldehyde dehydrogenase family protein  46.04 
 
 
496 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0734  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  46.04 
 
 
528 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0834633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>