More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4351 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  77.66 
 
 		 481 aa  754    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4351  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 491 aa  1005    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  70.87 
 
 		 485 aa  692    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3632  aldehyde dehydrogenase family protein  75.88 
 
 		 482 aa  744    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  43.72 
 
 		 505 aa  412  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  46.95 
 
 		 483 aa  409  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  44.98 
 
 		 483 aa  400  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  45.53 
 
 		 498 aa  399  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  44.56 
 
 		 503 aa  398  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1328  aldehyde dehydrogenase  47.06 
 
 		 483 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  45.07 
 
 		 496 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  44.35 
 
 		 497 aa  394  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  42.29 
 
 		 479 aa  381  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  42.05 
 
 		 498 aa  375  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  41.23 
 
 		 478 aa  377  1e-103  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4281  aldehyde dehydrogenase  45.89 
 
 		 481 aa  375  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000626871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  40.76 
 
 		 499 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  42.23 
 
 		 485 aa  363  3e-99  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  39.16 
 
 		 498 aa  363  4e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.39 
 
 		 480 aa  363  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  42.38 
 
 		 482 aa  362  6e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  39.41 
 
 		 500 aa  362  9e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  42.89 
 
 		 477 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  40.97 
 
 		 480 aa  359  6e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  41.86 
 
 		 493 aa  359  6e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  42.92 
 
 		 479 aa  358  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  42.47 
 
 		 477 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  42.35 
 
 		 496 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1119  aldehyde dehydrogenase  43.84 
 
 		 479 aa  355  8.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65747 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  42.83 
 
 		 498 aa  354  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  40.76 
 
 		 480 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  43.66 
 
 		 482 aa  353  4e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  42.05 
 
 		 477 aa  352  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2844  aldehyde dehydrogenase  43.01 
 
 		 482 aa  351  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281069  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  42.11 
 
 		 477 aa  350  4e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2694  aldehyde dehydrogenase family protein  41.2 
 
 		 480 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  41.37 
 
 		 479 aa  348  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  41.2 
 
 		 480 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  41.63 
 
 		 475 aa  347  3e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  41.89 
 
 		 477 aa  346  5e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  42.47 
 
 		 516 aa  344  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  42.55 
 
 		 476 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  43.47 
 
 		 474 aa  343  5.999999999999999e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  40.89 
 
 		 482 aa  341  2e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2664  aldehyde dehydrogenase  42.14 
 
 		 480 aa  340  4e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3422  aldehyde dehydrogenase  41.58 
 
 		 479 aa  339  5.9999999999999996e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  40.25 
 
 		 496 aa  339  7e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  40 
 
 		 483 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  40.21 
 
 		 481 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1598  aldehyde dehydrogenase  40.84 
 
 		 479 aa  336  5e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3381  aldehyde dehydrogenase  39.29 
 
 		 482 aa  336  5e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.464458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  41.3 
 
 		 485 aa  336  5.999999999999999e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  41.3 
 
 		 485 aa  335  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1732  Aldehyde Dehydrogenase  41.51 
 
 		 478 aa  334  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0174509  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0452  aldehyde dehydrogenase  41.26 
 
 		 480 aa  334  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2128  aldehyde dehydrogenase  38.24 
 
 		 486 aa  334  2e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0517784  hitchhiker  0.00570201 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1025  aldehyde dehydrogenase  41.05 
 
 		 480 aa  333  4e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1815  aldehyde dehydrogenase  38.45 
 
 		 491 aa  333  4e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  41.18 
 
 		 478 aa  333  5e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6141  aldehyde dehydrogenase  42.86 
 
 		 446 aa  330  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05501  hypothetical protein  38.24 
 
 		 486 aa  331  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  37.95 
 
 		 484 aa  330  4e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  37.63 
 
 		 480 aa  330  5.0000000000000004e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  40.97 
 
 		 489 aa  326  5e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.5 
 
 		 477 aa  326  5e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0247  aldehyde dehydrogenase  41.74 
 
 		 482 aa  326  6e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  37.82 
 
 		 486 aa  325  8.000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6489  aldehyde dehydrogenase  41.16 
 
 		 482 aa  325  9e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4047  Aldehyde Dehydrogenase  42.83 
 
 		 468 aa  325  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0877  aldehyde dehydrogenase  36.97 
 
 		 487 aa  325  1e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  40.76 
 
 		 489 aa  325  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1076  aldehyde dehydrogenase  43.33 
 
 		 505 aa  323  6e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.992962  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  39.37 
 
 		 493 aa  322  8e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  39.04 
 
 		 480 aa  321  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0482  betaine aldehyde dehydrogenase  39.37 
 
 		 490 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1043  Aldehyde Dehydrogenase  40.21 
 
 		 483 aa  320  5e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2916  betaine aldehyde dehydrogenase  39.37 
 
 		 490 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2555  betaine aldehyde dehydrogenase  39.37 
 
 		 490 aa  318  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0789453  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6158  betaine aldehyde dehydrogenase  38.95 
 
 		 490 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70950  betaine aldehyde dehydrogenase  38.95 
 
 		 490 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.934353 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  40.71 
 
 		 496 aa  316  7e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  41.21 
 
 		 488 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3309  betaine aldehyde dehydrogenase  38.53 
 
 		 489 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1561  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.23 
 
 		 503 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1240  aldehyde dehydrogenase  37.32 
 
 		 484 aa  312  9e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208234 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1591  betaine aldehyde dehydrogenase  39.5 
 
 		 489 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.32 
 
 		 498 aa  311  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  40.68 
 
 		 510 aa  311  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0813  aldehyde dehydrogenase  38.03 
 
 		 482 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  38.66 
 
 		 493 aa  310  5e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  38.3 
 
 		 488 aa  309  6.999999999999999e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  39.42 
 
 		 485 aa  309  6.999999999999999e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  37.53 
 
 		 494 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  38.1 
 
 		 488 aa  308  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3306  Aldehyde Dehydrogenase  43.23 
 
 		 497 aa  306  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5059  betaine aldehyde dehydrogenase  39.29 
 
 		 489 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0560116 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  37.32 
 
 		 494 aa  306  7e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  38.92 
 
 		 482 aa  305  8.000000000000001e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.96 
 
 		 508 aa  305  9.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0554  betaine aldehyde dehydrogenase  40.97 
 
 		 489 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>