More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3632 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4351  aldehyde dehydrogenase  75.88 
 
 		 491 aa  747    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  79.87 
 
 		 481 aa  770    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  72.38 
 
 		 485 aa  709    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3632  aldehyde dehydrogenase family protein  100 
 
 		 482 aa  988    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  45.61 
 
 		 503 aa  421  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  43.61 
 
 		 505 aa  418  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  45.62 
 
 		 498 aa  412  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  44.77 
 
 		 497 aa  412  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  45.32 
 
 		 483 aa  401  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  43.75 
 
 		 496 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1328  aldehyde dehydrogenase  46.95 
 
 		 483 aa  395  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.447584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  42.8 
 
 		 498 aa  389  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4281  aldehyde dehydrogenase  45.19 
 
 		 481 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000626871  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  41.29 
 
 		 479 aa  383  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  44.25 
 
 		 485 aa  382  1e-105  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  42.53 
 
 		 483 aa  384  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  41.29 
 
 		 478 aa  381  1e-104  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  40.25 
 
 		 500 aa  379  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.86 
 
 		 480 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  43.19 
 
 		 477 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  40.96 
 
 		 493 aa  378  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  40.13 
 
 		 498 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  43.36 
 
 		 479 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  43.61 
 
 		 477 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  42.62 
 
 		 479 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  40.79 
 
 		 499 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  42.98 
 
 		 477 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  42.77 
 
 		 477 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  43.07 
 
 		 498 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1119  aldehyde dehydrogenase  43.31 
 
 		 479 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65747 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  43.33 
 
 		 482 aa  367  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  42.83 
 
 		 483 aa  365  1e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  42.56 
 
 		 477 aa  365  1e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  40.42 
 
 		 480 aa  363  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  42.83 
 
 		 516 aa  362  6e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2844  aldehyde dehydrogenase  42.38 
 
 		 482 aa  362  8e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281069  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  41.51 
 
 		 475 aa  362  9e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  41.12 
 
 		 481 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  41.2 
 
 		 496 aa  360  4e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  41.18 
 
 		 493 aa  358  8e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  39.83 
 
 		 476 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2664  aldehyde dehydrogenase  42.05 
 
 		 480 aa  357  2.9999999999999997e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3422  aldehyde dehydrogenase  41.63 
 
 		 479 aa  356  5e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  39.79 
 
 		 480 aa  356  5e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  41.58 
 
 		 482 aa  355  8.999999999999999e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  40.08 
 
 		 496 aa  353  2.9999999999999997e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  40.47 
 
 		 482 aa  353  5e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1598  aldehyde dehydrogenase  40.54 
 
 		 479 aa  351  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6489  aldehyde dehydrogenase  41.41 
 
 		 482 aa  351  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2694  aldehyde dehydrogenase family protein  40.29 
 
 		 480 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  40.29 
 
 		 480 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  41.47 
 
 		 485 aa  349  6e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0452  aldehyde dehydrogenase  41.13 
 
 		 480 aa  349  6e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  41.47 
 
 		 485 aa  348  1e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1025  aldehyde dehydrogenase  40.92 
 
 		 480 aa  348  1e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1815  aldehyde dehydrogenase  39.5 
 
 		 491 aa  348  1e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1043  Aldehyde Dehydrogenase  40.96 
 
 		 483 aa  346  5e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  42.76 
 
 		 474 aa  346  7e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0247  aldehyde dehydrogenase  42.17 
 
 		 482 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  37.94 
 
 		 480 aa  343  2.9999999999999997e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1732  Aldehyde Dehydrogenase  41.46 
 
 		 478 aa  344  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0174509  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3381  aldehyde dehydrogenase  39.83 
 
 		 482 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.464458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.18 
 
 		 477 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  40.42 
 
 		 493 aa  341  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  39.41 
 
 		 484 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6141  aldehyde dehydrogenase  42.55 
 
 		 446 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2128  aldehyde dehydrogenase  38.45 
 
 		 486 aa  337  2.9999999999999997e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0517784  hitchhiker  0.00570201 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0482  betaine aldehyde dehydrogenase  41.26 
 
 		 490 aa  335  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70950  betaine aldehyde dehydrogenase  40 
 
 		 490 aa  333  6e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.934353 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  37.82 
 
 		 486 aa  332  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6158  betaine aldehyde dehydrogenase  39.79 
 
 		 490 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  42.17 
 
 		 496 aa  331  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05501  hypothetical protein  37.61 
 
 		 486 aa  331  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4047  Aldehyde Dehydrogenase  42.17 
 
 		 468 aa  331  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  41 
 
 		 489 aa  329  7e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  39.5 
 
 		 478 aa  328  1.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  40.79 
 
 		 489 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2916  betaine aldehyde dehydrogenase  40.63 
 
 		 490 aa  327  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  38.75 
 
 		 480 aa  326  7e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0965  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  39.13 
 
 		 507 aa  325  9e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2256  aldehyde dehydrogenase  40.5 
 
 		 478 aa  324  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134767  hitchhiker  0.000000459097 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0877  aldehyde dehydrogenase  36.34 
 
 		 487 aa  322  9.999999999999999e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  37.99 
 
 		 494 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  37.89 
 
 		 484 aa  320  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  37.78 
 
 		 494 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  38.92 
 
 		 488 aa  320  5e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2645  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.87 
 
 		 481 aa  320  5e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237988  normal  0.24266 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63844  mitochondrial aldehyde dehydrogenase  39.71 
 
 		 501 aa  319  7e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.704992  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  37.99 
 
 		 494 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2555  betaine aldehyde dehydrogenase  39.58 
 
 		 490 aa  319  7.999999999999999e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0789453  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  38.92 
 
 		 488 aa  318  2e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1591  betaine aldehyde dehydrogenase  39.54 
 
 		 489 aa  317  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1240  aldehyde dehydrogenase  37.74 
 
 		 484 aa  317  3e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208234 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  37.99 
 
 		 494 aa  317  4e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  37.99 
 
 		 494 aa  317  4e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  37.99 
 
 		 494 aa  317  4e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  37.78 
 
 		 494 aa  316  5e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  37.78 
 
 		 494 aa  316  5e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5059  betaine aldehyde dehydrogenase  39.79 
 
 		 489 aa  316  7e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0560116 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.74 
 
 		 498 aa  315  8e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>