More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6141 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6489  aldehyde dehydrogenase  74.23 
 
 		 482 aa  652    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  85.55 
 
 		 477 aa  759    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  86.49 
 
 		 477 aa  767    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1119  aldehyde dehydrogenase  74.94 
 
 		 479 aa  645    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65747 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6141  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 446 aa  912    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  74.18 
 
 		 481 aa  660    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  98.58 
 
 		 498 aa  851    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  85.55 
 
 		 477 aa  756    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  85.55 
 
 		 477 aa  758    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  81.6 
 
 		 479 aa  708    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  80.29 
 
 		 475 aa  722    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  85.07 
 
 		 477 aa  754    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1732  Aldehyde Dehydrogenase  69.86 
 
 		 478 aa  615  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0174509  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3422  aldehyde dehydrogenase  71.36 
 
 		 479 aa  615  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  67.54 
 
 		 479 aa  598  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  67.61 
 
 		 485 aa  599  1e-170  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  67.37 
 
 		 485 aa  597  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2844  aldehyde dehydrogenase  68.08 
 
 		 482 aa  597  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281069  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  68.04 
 
 		 480 aa  593  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1598  aldehyde dehydrogenase  68.88 
 
 		 479 aa  590  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  64.97 
 
 		 480 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2664  aldehyde dehydrogenase  66.43 
 
 		 480 aa  579  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0452  aldehyde dehydrogenase  65.16 
 
 		 480 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0247  aldehyde dehydrogenase  67.37 
 
 		 482 aa  572  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1025  aldehyde dehydrogenase  64.92 
 
 		 480 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  64.04 
 
 		 480 aa  570  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  64.18 
 
 		 477 aa  554  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  63.92 
 
 		 482 aa  541  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2694  aldehyde dehydrogenase family protein  60.43 
 
 		 480 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  60.43 
 
 		 480 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  60.77 
 
 		 480 aa  537  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  60.72 
 
 		 478 aa  528  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  59.34 
 
 		 476 aa  525  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1043  Aldehyde Dehydrogenase  58.45 
 
 		 483 aa  515  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  56.19 
 
 		 483 aa  496  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3017  aldehyde dehydrogenase  59.47 
 
 		 478 aa  488  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1054  aldehyde dehydrogenase  65.25 
 
 		 441 aa  488  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05501  hypothetical protein  53.83 
 
 		 486 aa  485  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  55.02 
 
 		 486 aa  488  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2128  aldehyde dehydrogenase  51.84 
 
 		 486 aa  481  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0517784  hitchhiker  0.00570201 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1815  aldehyde dehydrogenase  55.53 
 
 		 491 aa  482  1e-135  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0877  aldehyde dehydrogenase  52.87 
 
 		 487 aa  479  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3381  aldehyde dehydrogenase  53.94 
 
 		 482 aa  475  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.464458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2256  aldehyde dehydrogenase  55.97 
 
 		 478 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134767  hitchhiker  0.000000459097 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1240  aldehyde dehydrogenase  51.68 
 
 		 484 aa  463  1e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208234 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0813  aldehyde dehydrogenase  51.82 
 
 		 482 aa  457  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3959  Aldehyde Dehydrogenase  51.96 
 
 		 482 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.424065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  48.7 
 
 		 474 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  47.47 
 
 		 482 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  44.2 
 
 		 493 aa  356  5e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  44.92 
 
 		 479 aa  352  1e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  44.47 
 
 		 483 aa  349  6e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  41.59 
 
 		 496 aa  348  9e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  44.55 
 
 		 500 aa  348  1e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  43.18 
 
 		 485 aa  348  2e-94  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  43.72 
 
 		 505 aa  346  4e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  43.51 
 
 		 503 aa  345  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  43.23 
 
 		 485 aa  345  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  43.75 
 
 		 497 aa  345  1e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  43.61 
 
 		 516 aa  344  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  41.06 
 
 		 498 aa  342  5.999999999999999e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  44.86 
 
 		 483 aa  342  7e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  43.86 
 
 		 496 aa  339  5.9999999999999996e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  45.11 
 
 		 488 aa  339  7e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  44.23 
 
 		 496 aa  338  9e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3632  aldehyde dehydrogenase family protein  42.62 
 
 		 482 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  43.13 
 
 		 498 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  43.4 
 
 		 482 aa  333  2e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  42.31 
 
 		 481 aa  333  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  43.13 
 
 		 493 aa  333  4e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  41.12 
 
 		 478 aa  332  7.000000000000001e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  42.65 
 
 		 498 aa  331  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4351  aldehyde dehydrogenase  42.86 
 
 		 491 aa  330  3e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  39.76 
 
 		 499 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  42.18 
 
 		 493 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  39.55 
 
 		 494 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  39.61 
 
 		 484 aa  316  5e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1076  aldehyde dehydrogenase  44.63 
 
 		 505 aa  316  5e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.992962  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3306  Aldehyde Dehydrogenase  43.51 
 
 		 497 aa  313  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  39.78 
 
 		 491 aa  311  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0846  aldehyde dehydrogenase  40.24 
 
 		 493 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  37.19 
 
 		 490 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3572  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.91 
 
 		 506 aa  302  9e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.22 
 
 		 479 aa  302  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  39.81 
 
 		 496 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  40 
 
 		 479 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4047  Aldehyde Dehydrogenase  42.03 
 
 		 468 aa  298  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5059  betaine aldehyde dehydrogenase  39.57 
 
 		 489 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0560116 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.88 
 
 		 483 aa  292  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  38.57 
 
 		 497 aa  292  7e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  40.73 
 
 		 480 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  38.95 
 
 		 490 aa  291  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.5 
 
 		 498 aa  290  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0965  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  37.33 
 
 		 507 aa  290  4e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2568  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.62 
 
 		 486 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.951924  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1591  betaine aldehyde dehydrogenase  39.09 
 
 		 489 aa  289  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0855  betaine aldehyde dehydrogenase  39.71 
 
 		 483 aa  289  8e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1161  5-carboxy-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  40.51 
 
 		 504 aa  288  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.72 
 
 		 483 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.2 
 
 		 479 aa  288  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>