More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05194 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS05194  putative benzaldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  100 
 
 
492 aa  979    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0026447  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0128  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  73.2 
 
 
484 aa  661    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0506  aldehyde dehydrogenase  59.05 
 
 
486 aa  599  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2950  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  61.94 
 
 
493 aa  580  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.241533  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2734  aldehyde dehydrogenase  61.94 
 
 
493 aa  580  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.350439 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6305  aldehyde dehydrogenase  57.44 
 
 
492 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.128394 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5579  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  58.25 
 
 
492 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623419  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6518  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  56.82 
 
 
489 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6120  aldehyde dehydrogenase  56.82 
 
 
489 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1311  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  56.82 
 
 
489 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0302  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  54.67 
 
 
490 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.333466 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3244  aldehyde dehydrogenase  56.2 
 
 
489 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2977  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  54.71 
 
 
491 aa  511  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3490  Aldehyde Dehydrogenase  55.28 
 
 
488 aa  507  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.836011  normal  0.347598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6645  benzaldehyde dehydrogenase  55.74 
 
 
490 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.166166 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4519  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  53 
 
 
491 aa  448  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2192  Aldehyde Dehydrogenase  52.16 
 
 
486 aa  437  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2506  aldehyde dehydrogenase  51.65 
 
 
483 aa  430  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317548  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4885  Aldehyde Dehydrogenase  51.63 
 
 
487 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4913  aldehyde dehydrogenase  48.02 
 
 
491 aa  418  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20250  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  52.16 
 
 
486 aa  376  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.177841  normal  0.892194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2625  Aldehyde Dehydrogenase  45.62 
 
 
486 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268652  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 
480 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0348  aldehyde dehydrogenase  44.44 
 
 
490 aa  359  6e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2155  Aldehyde Dehydrogenase  42.06 
 
 
503 aa  357  2.9999999999999997e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.697441  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64740  putative aldehyde dehydrogenase  42.28 
 
 
489 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257516  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0356  Aldehyde Dehydrogenase  42.74 
 
 
503 aa  351  2e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2918  Aldehyde Dehydrogenase  41.29 
 
 
497 aa  348  1e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5622  putative aldehyde dehydrogenase  42.07 
 
 
489 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3760  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.03 
 
 
491 aa  347  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1057  Aldehyde Dehydrogenase  40.12 
 
 
491 aa  347  3e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2307  Aldehyde Dehydrogenase  39.21 
 
 
486 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1894  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.5 
 
 
497 aa  344  2e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0153798  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1015  aldehyde dehydrogenase  39.7 
 
 
496 aa  343  4e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0912  Aldehyde Dehydrogenase  40.5 
 
 
483 aa  343  5e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1350  putative aldehyde dehydrogenase  39.48 
 
 
496 aa  342  8e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0808  Aldehyde Dehydrogenase  36.9 
 
 
486 aa  336  7e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0525  Aldehyde Dehydrogenase  40.79 
 
 
490 aa  322  9.999999999999999e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0749  Aldehyde Dehydrogenase  39.55 
 
 
485 aa  320  3e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5953  vanillin: NAD oxidoreductase  40.29 
 
 
493 aa  320  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804682  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  38.66 
 
 
493 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  37.63 
 
 
490 aa  311  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  41.02 
 
 
488 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.22 
 
 
488 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.61 
 
 
488 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0457  aldehyde dehydrogenase  40.46 
 
 
489 aa  309  8e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  41.11 
 
 
496 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  39.87 
 
 
496 aa  307  3e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  41.43 
 
 
488 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.41 
 
 
488 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1695  aldehyde dehydrogenase  38.76 
 
 
510 aa  303  4.0000000000000003e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3895  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.48 
 
 
480 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0367  aldehyde dehydrogenase family protein  38.67 
 
 
481 aa  301  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  38.4 
 
 
493 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  35.92 
 
 
493 aa  302  1e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  39.2 
 
 
516 aa  301  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0180  aldehyde dehydrogenase  39.61 
 
 
483 aa  301  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225137  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  35.43 
 
 
498 aa  298  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  36.04 
 
 
497 aa  297  3e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5334  vanillin: NAD oxidoreductase  39.54 
 
 
510 aa  295  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  35.62 
 
 
503 aa  295  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3876  aldehyde dehydrogenase  38.68 
 
 
479 aa  295  2e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  39.18 
 
 
488 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  34.8 
 
 
499 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  38.08 
 
 
498 aa  293  5e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4884  Aldehyde Dehydrogenase  39.58 
 
 
481 aa  293  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4795  Aldehyde Dehydrogenase  40.69 
 
 
481 aa  292  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0338248 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14240  vanillin:NAD+ oxidoreductase  42.71 
 
 
482 aa  292  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5053  vanillin: NAD oxidoreductase  39.38 
 
 
482 aa  291  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  34.24 
 
 
500 aa  291  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  37.94 
 
 
482 aa  290  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.82 
 
 
496 aa  288  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  39.39 
 
 
488 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2943  vanillin dehydrogenase  41.67 
 
 
482 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2402  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.66 
 
 
490 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0804  aldehyde dehydrogenase  36.52 
 
 
483 aa  282  9e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  37.83 
 
 
497 aa  281  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4802  Aldehyde Dehydrogenase  39.06 
 
 
498 aa  281  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217691  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6158  aldehyde dehydrogenase  41.12 
 
 
483 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112468  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  37.82 
 
 
473 aa  280  5e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.24 
 
 
487 aa  280  5e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.23 
 
 
479 aa  279  7e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1668  aldehyde dehydrogenase  38.44 
 
 
466 aa  279  7e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  38.22 
 
 
483 aa  279  8e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30180  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.76 
 
 
487 aa  278  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.559382  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.62 
 
 
486 aa  278  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  36.8 
 
 
510 aa  278  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.43 
 
 
484 aa  278  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  36.84 
 
 
490 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  35.01 
 
 
477 aa  277  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  35.51 
 
 
494 aa  276  5e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2727  aldehyde dehydrogenase  40.83 
 
 
482 aa  276  5e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0704115  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.66 
 
 
481 aa  276  6e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  37.91 
 
 
483 aa  276  7e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0958  Betaine-aldehyde dehydrogenase  37.91 
 
 
498 aa  276  7e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.448446  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5094  aldehyde dehydrogenase  38.18 
 
 
483 aa  276  8e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.982796  normal  0.0694645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0207  aldehyde dehydrogenase  37.34 
 
 
491 aa  276  9e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  35.98 
 
 
489 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0227  aldehyde dehydrogenase  37.34 
 
 
491 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.596332  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0217  aldehyde dehydrogenase  37.34 
 
 
491 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>