More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0180 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0804  aldehyde dehydrogenase  69.29 
 
 
483 aa  690    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0180  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
483 aa  978    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225137  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2482  aldehyde dehydrogenase  61.7 
 
 
483 aa  610  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4795  Aldehyde Dehydrogenase  58.39 
 
 
481 aa  551  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0338248 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4884  Aldehyde Dehydrogenase  58.18 
 
 
481 aa  552  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0367  aldehyde dehydrogenase family protein  55.35 
 
 
481 aa  530  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5053  vanillin: NAD oxidoreductase  54.09 
 
 
482 aa  519  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4802  Aldehyde Dehydrogenase  53.03 
 
 
498 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217691  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0610  aldehyde dehydrogenase  54.96 
 
 
480 aa  513  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2494  aldehyde dehydrogenase  56.82 
 
 
483 aa  513  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0600724  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3305  aldehyde dehydrogenase  53.1 
 
 
482 aa  508  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4023  Aldehyde Dehydrogenase  55.81 
 
 
483 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000030517  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4869  aldehyde dehydrogenase  54.68 
 
 
483 aa  501  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0491848  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1133  aldehyde dehydrogenase  58.04 
 
 
486 aa  503  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.809245  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1022  aldehyde dehydrogenase  54.91 
 
 
483 aa  501  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.504795  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5094  aldehyde dehydrogenase  53.42 
 
 
483 aa  498  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.982796  normal  0.0694645 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4891  Aldehyde Dehydrogenase  53.86 
 
 
488 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364964  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6158  aldehyde dehydrogenase  52.89 
 
 
483 aa  497  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112468  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14240  vanillin:NAD+ oxidoreductase  53.21 
 
 
482 aa  493  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3835  aldehyde dehydrogenase  55.56 
 
 
483 aa  487  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2827  aldehyde dehydrogenase  57.2 
 
 
483 aa  487  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.771758  normal  0.36056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2727  aldehyde dehydrogenase  52.38 
 
 
482 aa  487  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0704115  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2943  vanillin dehydrogenase  52.8 
 
 
482 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0277  aldehyde dehydrogenase  53.21 
 
 
482 aa  482  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170386  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1668  aldehyde dehydrogenase  51.4 
 
 
466 aa  476  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0715  aldehyde dehydrogenase  55.37 
 
 
483 aa  473  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.210112 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0226  vanillin dehydrogenase oxidoreductase protein  54.75 
 
 
484 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000243231  normal  0.062724 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2501  aldehyde dehydrogenase  55.99 
 
 
483 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1083  aldehyde dehydrogenase  52.16 
 
 
466 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3357  vanillin dehydrogenase  52.8 
 
 
482 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.829356  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3479  aldehyde dehydrogenase  52.94 
 
 
481 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0877693  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2630  aldehyde dehydrogenase  55.79 
 
 
483 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172845  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2401  aldehyde dehydrogenase  52.59 
 
 
482 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5913  aldehyde dehydrogenase  55.79 
 
 
483 aa  458  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303901  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4594  aldehyde dehydrogenase  53.67 
 
 
482 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140144 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0706  aldehyde dehydrogenase family protein  57.41 
 
 
483 aa  455  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18514  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1998  Aldehyde Dehydrogenase  55.97 
 
 
494 aa  455  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3481  aldehyde dehydrogenase  54.77 
 
 
484 aa  457  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2048  aldehyde dehydrogenase  53.21 
 
 
482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.522648  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0646  aldehyde dehydrogenase family protein  57.2 
 
 
483 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00158045  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0347  aldehyde dehydrogenase family protein  57.2 
 
 
483 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439159  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2481  aldehyde dehydrogenase family protein  57.2 
 
 
483 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.695702  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1049  aldehyde dehydrogenase family protein  57.2 
 
 
483 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0094  aldehyde dehydrogenase family protein  57.2 
 
 
483 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.068435  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0888  putative vanillin dehydrogenase  57.2 
 
 
483 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0891  putative vanillin dehydrogenase  57.2 
 
 
483 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391484  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5464  aldehyde dehydrogenase  53.67 
 
 
482 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.326314 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2582  aldehyde dehydrogenase  54.75 
 
 
483 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0246842  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0051  aldehyde dehydrogenase  54.09 
 
 
482 aa  451  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0422241  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5635  aldehyde dehydrogenase  53.04 
 
 
482 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.517917  decreased coverage  0.00150641 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2606  aldehyde dehydrogenase  54.96 
 
 
483 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1971  aldehyde dehydrogenase  54.75 
 
 
483 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.662558  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5224  aldehyde dehydrogenase  53.04 
 
 
482 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812751  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4915  aldehyde dehydrogenase  53.25 
 
 
482 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.71002  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0457  aldehyde dehydrogenase  50.21 
 
 
489 aa  445  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3211  aldehyde dehydrogenase  53.53 
 
 
483 aa  443  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.161018  normal  0.0254396 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1839  Aldehyde Dehydrogenase  55.19 
 
 
483 aa  436  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.613277  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5046  aldehyde dehydrogenase  47 
 
 
479 aa  437  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0408609  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5054  vanillin: NAD oxidoreductase  47.18 
 
 
508 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.619044  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1801  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  53.62 
 
 
521 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0630  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  53.62 
 
 
482 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.740666  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2362  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  53.62 
 
 
482 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474232  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0836  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  53.62 
 
 
521 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1068  vanillin dehydrogenase  53.4 
 
 
521 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0912  Aldehyde Dehydrogenase  41.25 
 
 
483 aa  389  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  40.87 
 
 
480 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04050  cytoplasmic aldehyde dehydrogenase (Eurofung)  42.41 
 
 
482 aa  348  1e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.310167  normal  0.390831 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3895  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.04 
 
 
480 aa  345  1e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3876  aldehyde dehydrogenase  40.89 
 
 
479 aa  341  1e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2329  Aldehyde Dehydrogenase  43.87 
 
 
486 aa  336  5.999999999999999e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1350  putative aldehyde dehydrogenase  37.47 
 
 
496 aa  332  1e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1015  aldehyde dehydrogenase  37.27 
 
 
496 aa  332  1e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2307  Aldehyde Dehydrogenase  38.41 
 
 
486 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01541  aldehyde dehydrogenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05520)  37.39 
 
 
484 aa  319  7.999999999999999e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.804956  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1894  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.1 
 
 
497 aa  316  7e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0153798  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3760  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.47 
 
 
491 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1695  aldehyde dehydrogenase  38.83 
 
 
510 aa  304  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2155  Aldehyde Dehydrogenase  36.25 
 
 
503 aa  298  1e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.697441  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5953  vanillin: NAD oxidoreductase  38.53 
 
 
493 aa  298  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804682  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0348  aldehyde dehydrogenase  38.74 
 
 
490 aa  297  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0749  Aldehyde Dehydrogenase  37.83 
 
 
485 aa  296  5e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1057  Aldehyde Dehydrogenase  36.46 
 
 
491 aa  294  3e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0356  Aldehyde Dehydrogenase  36.38 
 
 
503 aa  292  1e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0808  Aldehyde Dehydrogenase  33.61 
 
 
486 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05194  putative benzaldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  39.61 
 
 
492 aa  289  8e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0026447  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  37.04 
 
 
490 aa  289  8e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64740  putative aldehyde dehydrogenase  37.92 
 
 
489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257516  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  36.12 
 
 
480 aa  285  2.0000000000000002e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6645  benzaldehyde dehydrogenase  39.06 
 
 
490 aa  283  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.166166 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3171  aldehyde dehydrogenase  36.25 
 
 
502 aa  282  8.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.86 
 
 
503 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1755  succinate semialdehyde dehydrogenase  34.8 
 
 
497 aa  281  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0506  aldehyde dehydrogenase  36.88 
 
 
486 aa  280  4e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.76 
 
 
498 aa  280  5e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.66 
 
 
503 aa  280  5e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6305  aldehyde dehydrogenase  41.31 
 
 
492 aa  280  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.128394 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1006  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.1 
 
 
491 aa  279  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.179638  normal  0.457717 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5622  putative aldehyde dehydrogenase  37.47 
 
 
489 aa  279  8e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2977  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  38.48 
 
 
491 aa  279  9e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5334  vanillin: NAD oxidoreductase  36.76 
 
 
510 aa  279  9e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>