More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3895 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3895  betaine-aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 480 aa  992    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  55.42 
 
 		 480 aa  538  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3876  aldehyde dehydrogenase  44.28 
 
 		 479 aa  416  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0912  Aldehyde Dehydrogenase  43.66 
 
 		 483 aa  415  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1015  aldehyde dehydrogenase  42.35 
 
 		 496 aa  390  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1350  putative aldehyde dehydrogenase  42.35 
 
 		 496 aa  386  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1894  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.77 
 
 		 497 aa  382  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0153798  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0367  aldehyde dehydrogenase family protein  40.99 
 
 		 481 aa  382  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0804  aldehyde dehydrogenase  40.17 
 
 		 483 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4884  Aldehyde Dehydrogenase  42.47 
 
 		 481 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5053  vanillin: NAD oxidoreductase  41.61 
 
 		 482 aa  378  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3760  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.14 
 
 		 491 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0226  vanillin dehydrogenase oxidoreductase protein  44.68 
 
 		 484 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000243231  normal  0.062724 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4795  Aldehyde Dehydrogenase  42.05 
 
 		 481 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0338248 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0348  aldehyde dehydrogenase  42.04 
 
 		 490 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3305  aldehyde dehydrogenase  41.34 
 
 		 482 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4869  aldehyde dehydrogenase  41.41 
 
 		 483 aa  362  6e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0491848  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4802  Aldehyde Dehydrogenase  39.96 
 
 		 498 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217691  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14240  vanillin:NAD+ oxidoreductase  41.41 
 
 		 482 aa  358  9.999999999999999e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2482  aldehyde dehydrogenase  39.67 
 
 		 483 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1668  aldehyde dehydrogenase  42.17 
 
 		 466 aa  357  2.9999999999999997e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64740  putative aldehyde dehydrogenase  40.76 
 
 		 489 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5622  putative aldehyde dehydrogenase  40.72 
 
 		 489 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0457  aldehyde dehydrogenase  41.4 
 
 		 489 aa  355  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2307  Aldehyde Dehydrogenase  39.96 
 
 		 486 aa  352  8e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0277  aldehyde dehydrogenase  42.05 
 
 		 482 aa  352  8.999999999999999e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5094  aldehyde dehydrogenase  38.91 
 
 		 483 aa  352  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.982796  normal  0.0694645 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2943  vanillin dehydrogenase  41.15 
 
 		 482 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5046  aldehyde dehydrogenase  41.35 
 
 		 479 aa  350  3e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0408609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2727  aldehyde dehydrogenase  40.53 
 
 		 482 aa  350  4e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0704115  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2494  aldehyde dehydrogenase  41.2 
 
 		 483 aa  348  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0600724  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0749  Aldehyde Dehydrogenase  40.84 
 
 		 485 aa  348  2e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0180  aldehyde dehydrogenase  39.04 
 
 		 483 aa  345  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3835  aldehyde dehydrogenase  40.79 
 
 		 483 aa  345  1e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6158  aldehyde dehydrogenase  37.89 
 
 		 483 aa  344  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1083  aldehyde dehydrogenase  41.9 
 
 		 466 aa  342  1e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4023  Aldehyde Dehydrogenase  39.75 
 
 		 483 aa  341  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000030517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5334  vanillin: NAD oxidoreductase  40.51 
 
 		 510 aa  340  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  40.08 
 
 		 490 aa  339  7e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1022  aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 		 483 aa  338  9.999999999999999e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.504795  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1695  aldehyde dehydrogenase  39.5 
 
 		 510 aa  338  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0610  aldehyde dehydrogenase  38.92 
 
 		 480 aa  338  9.999999999999999e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1133  aldehyde dehydrogenase  41 
 
 		 486 aa  338  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.809245  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.61 
 
 		 483 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2155  Aldehyde Dehydrogenase  39.83 
 
 		 503 aa  335  1e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.697441  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  37.32 
 
 		 493 aa  335  1e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4891  Aldehyde Dehydrogenase  38.46 
 
 		 488 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364964  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.6 
 
 		 481 aa  333  5e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.03 
 
 		 480 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1057  Aldehyde Dehydrogenase  38.75 
 
 		 491 aa  331  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.25 
 
 		 484 aa  331  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  37.76 
 
 		 510 aa  330  5.0000000000000004e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3479  aldehyde dehydrogenase  42.16 
 
 		 481 aa  329  6e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0877693  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0808  Aldehyde Dehydrogenase  37.71 
 
 		 486 aa  329  9e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2918  Aldehyde Dehydrogenase  37.61 
 
 		 497 aa  327  4.0000000000000003e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.18 
 
 		 480 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.53 
 
 		 483 aa  326  5e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.18 
 
 		 480 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.18 
 
 		 480 aa  326  7e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.25 
 
 		 483 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  36.95 
 
 		 483 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.55 
 
 		 483 aa  325  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.55 
 
 		 483 aa  324  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3357  vanillin dehydrogenase  39.34 
 
 		 482 aa  324  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.829356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.92 
 
 		 490 aa  323  4e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2048  aldehyde dehydrogenase  40.58 
 
 		 482 aa  323  6e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.522648  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.51 
 
 		 483 aa  323  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1998  Aldehyde Dehydrogenase  41.49 
 
 		 494 aa  322  7e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  38.35 
 
 		 477 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  36.74 
 
 		 483 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  36.74 
 
 		 483 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  36.74 
 
 		 483 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  36.74 
 
 		 483 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.6 
 
 		 482 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5464  aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 		 482 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.326314 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5913  aldehyde dehydrogenase  40.99 
 
 		 483 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.6 
 
 		 482 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.61 
 
 		 483 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.6 
 
 		 482 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2827  aldehyde dehydrogenase  39.34 
 
 		 483 aa  320  3e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.771758  normal  0.36056 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.6 
 
 		 482 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5054  vanillin: NAD oxidoreductase  38.28 
 
 		 508 aa  319  6e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.619044  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2401  aldehyde dehydrogenase  39.13 
 
 		 482 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2501  aldehyde dehydrogenase  40.37 
 
 		 483 aa  319  7e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  36.71 
 
 		 483 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4594  aldehyde dehydrogenase  39.75 
 
 		 482 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2329  Aldehyde Dehydrogenase  41.25 
 
 		 486 aa  318  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3676  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.29 
 
 		 484 aa  318  1e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3481  aldehyde dehydrogenase  41.94 
 
 		 484 aa  318  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.11 
 
 		 480 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.6 
 
 		 482 aa  317  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.02 
 
 		 488 aa  317  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  37.66 
 
 		 482 aa  318  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.05 
 
 		 490 aa  317  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.6 
 
 		 482 aa  317  3e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  36.38 
 
 		 482 aa  317  4e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.27 
 
 		 480 aa  317  4e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  36.38 
 
 		 482 aa  317  4e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.38 
 
 		 482 aa  317  4e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2630  aldehyde dehydrogenase  40.37 
 
 		 483 aa  317  4e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>