More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0302 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2977  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  67.14 
 
 
491 aa  664    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6305  aldehyde dehydrogenase  77.1 
 
 
492 aa  750    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.128394 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3244  aldehyde dehydrogenase  71.43 
 
 
489 aa  687    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0302  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  100 
 
 
490 aa  986    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.333466 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6120  aldehyde dehydrogenase  78.01 
 
 
489 aa  748    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1311  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  77.8 
 
 
489 aa  743    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3490  Aldehyde Dehydrogenase  75 
 
 
488 aa  720    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.836011  normal  0.347598 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5579  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  76.89 
 
 
492 aa  738    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623419  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6518  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  77.8 
 
 
489 aa  743    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05194  putative benzaldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  54.67 
 
 
492 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0026447  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2734  aldehyde dehydrogenase  54.97 
 
 
493 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.350439 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2950  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  56 
 
 
493 aa  502  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.241533  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0506  aldehyde dehydrogenase  51.66 
 
 
486 aa  494  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0128  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  54.53 
 
 
484 aa  487  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2192  Aldehyde Dehydrogenase  52.89 
 
 
486 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4885  Aldehyde Dehydrogenase  55.11 
 
 
487 aa  465  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4519  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  53.56 
 
 
491 aa  464  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6645  benzaldehyde dehydrogenase  52.62 
 
 
490 aa  460  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.166166 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4913  aldehyde dehydrogenase  49.17 
 
 
491 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2506  aldehyde dehydrogenase  50.83 
 
 
483 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317548  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20250  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  52.07 
 
 
486 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.177841  normal  0.892194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2625  Aldehyde Dehydrogenase  46.51 
 
 
486 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268652  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  42.89 
 
 
480 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1015  aldehyde dehydrogenase  39.63 
 
 
496 aa  367  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1057  Aldehyde Dehydrogenase  42.32 
 
 
491 aa  363  4e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2155  Aldehyde Dehydrogenase  41.94 
 
 
503 aa  362  1e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.697441  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1350  putative aldehyde dehydrogenase  39.05 
 
 
496 aa  361  2e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2307  Aldehyde Dehydrogenase  41.37 
 
 
486 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0356  Aldehyde Dehydrogenase  43.24 
 
 
503 aa  353  4e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0808  Aldehyde Dehydrogenase  39.83 
 
 
486 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1894  betaine-aldehyde dehydrogenase  42 
 
 
497 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0153798  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3760  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.36 
 
 
491 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2918  Aldehyde Dehydrogenase  38.8 
 
 
497 aa  341  2e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64740  putative aldehyde dehydrogenase  41.34 
 
 
489 aa  340  4e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257516  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0348  aldehyde dehydrogenase  42.77 
 
 
490 aa  339  8e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0525  Aldehyde Dehydrogenase  40.12 
 
 
490 aa  335  7.999999999999999e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5622  putative aldehyde dehydrogenase  40.92 
 
 
489 aa  334  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0749  Aldehyde Dehydrogenase  41.68 
 
 
485 aa  334  3e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1695  aldehyde dehydrogenase  41.67 
 
 
510 aa  332  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5953  vanillin: NAD oxidoreductase  40.16 
 
 
493 aa  331  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804682  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5334  vanillin: NAD oxidoreductase  40.34 
 
 
510 aa  327  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3876  aldehyde dehydrogenase  40.31 
 
 
479 aa  317  3e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0912  Aldehyde Dehydrogenase  37.79 
 
 
483 aa  316  5e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3895  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 
480 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1668  aldehyde dehydrogenase  42.28 
 
 
466 aa  306  4.0000000000000004e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4795  Aldehyde Dehydrogenase  42.23 
 
 
481 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0338248 
 
 
-
 
NC_004310  BR0367  aldehyde dehydrogenase family protein  40.76 
 
 
481 aa  303  5.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  40.38 
 
 
496 aa  302  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0263  Aldehyde Dehydrogenase  40.72 
 
 
494 aa  297  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.605117 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4884  Aldehyde Dehydrogenase  40.6 
 
 
481 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0226  vanillin dehydrogenase oxidoreductase protein  42.82 
 
 
484 aa  296  7e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000243231  normal  0.062724 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0457  aldehyde dehydrogenase  42.37 
 
 
489 aa  295  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4869  aldehyde dehydrogenase  41.51 
 
 
483 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0491848  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5053  vanillin: NAD oxidoreductase  41.3 
 
 
482 aa  294  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4802  Aldehyde Dehydrogenase  40.7 
 
 
498 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217691  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2943  vanillin dehydrogenase  41.11 
 
 
482 aa  292  8e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  37.07 
 
 
499 aa  290  6e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14240  vanillin:NAD+ oxidoreductase  42.89 
 
 
482 aa  289  8e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0277  aldehyde dehydrogenase  41.49 
 
 
482 aa  289  8e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170386  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4023  Aldehyde Dehydrogenase  40.37 
 
 
483 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000030517  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2727  aldehyde dehydrogenase  40.43 
 
 
482 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0704115  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1083  aldehyde dehydrogenase  42.86 
 
 
466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2402  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.07 
 
 
490 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  35.36 
 
 
505 aa  282  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  35.87 
 
 
493 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4891  Aldehyde Dehydrogenase  40.93 
 
 
488 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364964  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  36.02 
 
 
493 aa  280  4e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3305  aldehyde dehydrogenase  39.95 
 
 
482 aa  280  4e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  39.02 
 
 
498 aa  279  7e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1133  aldehyde dehydrogenase  41.44 
 
 
486 aa  278  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.809245  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  35.17 
 
 
477 aa  277  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0180  aldehyde dehydrogenase  38.54 
 
 
483 aa  277  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225137  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.27 
 
 
486 aa  276  9e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5054  vanillin: NAD oxidoreductase  38.46 
 
 
508 aa  274  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.619044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5094  aldehyde dehydrogenase  38.48 
 
 
483 aa  274  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.982796  normal  0.0694645 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6158  aldehyde dehydrogenase  40.05 
 
 
483 aa  274  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112468  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  35.08 
 
 
498 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3479  aldehyde dehydrogenase  41.26 
 
 
481 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0877693  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5033  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.27 
 
 
507 aa  272  9e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.489638  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4738  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.27 
 
 
507 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4650  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.27 
 
 
507 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  38.59 
 
 
516 aa  271  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5464  aldehyde dehydrogenase  38.46 
 
 
482 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.326314 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  34.81 
 
 
493 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  34.52 
 
 
503 aa  270  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2482  aldehyde dehydrogenase  37.12 
 
 
483 aa  269  7e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  36.89 
 
 
496 aa  269  7e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  37.04 
 
 
488 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1623  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.63 
 
 
499 aa  269  8.999999999999999e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207083  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.15 
 
 
481 aa  268  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  36.44 
 
 
506 aa  269  1e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  34.52 
 
 
497 aa  269  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.61 
 
 
487 aa  268  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5100  Aldehyde Dehydrogenase  38.83 
 
 
480 aa  269  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482433  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3263  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.83 
 
 
489 aa  268  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.132134 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.83 
 
 
488 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1022  aldehyde dehydrogenase  40.33 
 
 
483 aa  267  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.504795  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2329  Aldehyde Dehydrogenase  39.7 
 
 
486 aa  267  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3829  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.9 
 
 
482 aa  267  4e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2105  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.09 
 
 
455 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0684833  normal  0.0301817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>