More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5953 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011988  Avi_5953  vanillin: NAD oxidoreductase  100 
 
 
493 aa  1002    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804682  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5334  vanillin: NAD oxidoreductase  59 
 
 
510 aa  577  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1015  aldehyde dehydrogenase  55.58 
 
 
496 aa  555  1e-157  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1695  aldehyde dehydrogenase  58.18 
 
 
510 aa  555  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1350  putative aldehyde dehydrogenase  54.81 
 
 
496 aa  553  1e-156  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1894  betaine-aldehyde dehydrogenase  56.69 
 
 
497 aa  549  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0153798  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64740  putative aldehyde dehydrogenase  56.07 
 
 
489 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257516  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5622  putative aldehyde dehydrogenase  55.44 
 
 
489 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0348  aldehyde dehydrogenase  57.44 
 
 
490 aa  538  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3760  betaine-aldehyde dehydrogenase  55.65 
 
 
491 aa  528  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0263  Aldehyde Dehydrogenase  50.4 
 
 
494 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.605117 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0808  Aldehyde Dehydrogenase  46.2 
 
 
486 aa  448  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2307  Aldehyde Dehydrogenase  47.43 
 
 
486 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1057  Aldehyde Dehydrogenase  47.75 
 
 
491 aa  441  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0749  Aldehyde Dehydrogenase  47.81 
 
 
485 aa  424  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2918  Aldehyde Dehydrogenase  42 
 
 
497 aa  388  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2155  Aldehyde Dehydrogenase  40.54 
 
 
503 aa  379  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.697441  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0912  Aldehyde Dehydrogenase  41.88 
 
 
483 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0525  Aldehyde Dehydrogenase  43.87 
 
 
490 aa  370  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0356  Aldehyde Dehydrogenase  41.16 
 
 
503 aa  358  9.999999999999999e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  38.99 
 
 
480 aa  342  7e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3244  aldehyde dehydrogenase  41.32 
 
 
489 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0302  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  40.16 
 
 
490 aa  323  6e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.333466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3895  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.16 
 
 
480 aa  318  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3876  aldehyde dehydrogenase  38.64 
 
 
479 aa  315  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6305  aldehyde dehydrogenase  39.38 
 
 
492 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.128394 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4519  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  37.81 
 
 
491 aa  309  8e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_003296  RS05194  putative benzaldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  40.29 
 
 
492 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0026447  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1311  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  39.46 
 
 
489 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6518  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  39.46 
 
 
489 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0804  aldehyde dehydrogenase  38.41 
 
 
483 aa  307  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2977  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  36.77 
 
 
491 aa  307  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6120  aldehyde dehydrogenase  39.46 
 
 
489 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0180  aldehyde dehydrogenase  38.53 
 
 
483 aa  304  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225137  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  38.57 
 
 
510 aa  304  3.0000000000000004e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5579  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  39.54 
 
 
492 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623419  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  37.69 
 
 
480 aa  302  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3490  Aldehyde Dehydrogenase  38.07 
 
 
488 aa  301  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.836011  normal  0.347598 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2482  aldehyde dehydrogenase  37.84 
 
 
483 aa  300  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14240  vanillin:NAD+ oxidoreductase  39.83 
 
 
482 aa  299  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  37.67 
 
 
493 aa  298  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0457  aldehyde dehydrogenase  37.84 
 
 
489 aa  296  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4913  aldehyde dehydrogenase  38.82 
 
 
491 aa  295  9e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4795  Aldehyde Dehydrogenase  41.16 
 
 
481 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0338248 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4884  Aldehyde Dehydrogenase  40.7 
 
 
481 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2625  Aldehyde Dehydrogenase  35.45 
 
 
486 aa  293  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268652  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  38.41 
 
 
496 aa  293  6e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4869  aldehyde dehydrogenase  39.87 
 
 
483 aa  293  6e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0491848  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5053  vanillin: NAD oxidoreductase  38.04 
 
 
482 aa  292  7e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  35.89 
 
 
500 aa  291  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4802  Aldehyde Dehydrogenase  39.52 
 
 
498 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217691  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5094  aldehyde dehydrogenase  39.23 
 
 
483 aa  291  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.982796  normal  0.0694645 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.29 
 
 
483 aa  290  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.5 
 
 
484 aa  290  4e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.34 
 
 
486 aa  290  5.0000000000000004e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4023  Aldehyde Dehydrogenase  40.05 
 
 
483 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000030517  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.76 
 
 
487 aa  290  6e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1668  aldehyde dehydrogenase  39.44 
 
 
466 aa  288  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2734  aldehyde dehydrogenase  39.25 
 
 
493 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.350439 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2950  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  38.83 
 
 
493 aa  286  7e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.241533  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0277  aldehyde dehydrogenase  39.87 
 
 
482 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170386  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3305  aldehyde dehydrogenase  37.92 
 
 
482 aa  283  6.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1083  aldehyde dehydrogenase  39.07 
 
 
466 aa  283  7.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  36.4 
 
 
505 aa  282  9e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2402  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.96 
 
 
490 aa  281  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.47 
 
 
486 aa  281  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.68 
 
 
484 aa  281  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0506  aldehyde dehydrogenase  35.95 
 
 
486 aa  280  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6158  aldehyde dehydrogenase  36.89 
 
 
483 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112468  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  34.64 
 
 
496 aa  280  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0128  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  39.86 
 
 
484 aa  280  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4885  Aldehyde Dehydrogenase  39.87 
 
 
487 aa  280  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0048  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.83 
 
 
488 aa  280  4e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.21 
 
 
509 aa  280  6e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5826  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  36.21 
 
 
485 aa  280  6e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26319  normal  0.439131 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5046  aldehyde dehydrogenase  37.58 
 
 
479 aa  279  9e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0408609  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.22 
 
 
479 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.22 
 
 
479 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1054  Aldehyde Dehydrogenase  36.83 
 
 
513 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1997  Aldehyde Dehydrogenase  35.31 
 
 
480 aa  278  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  34.65 
 
 
482 aa  278  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5054  vanillin: NAD oxidoreductase  38.89 
 
 
508 aa  278  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.619044  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.34 
 
 
493 aa  278  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  38.06 
 
 
490 aa  277  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6021  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.5 
 
 
486 aa  277  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0367  aldehyde dehydrogenase family protein  36.57 
 
 
481 aa  277  3e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2943  vanillin dehydrogenase  39 
 
 
482 aa  277  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.19 
 
 
485 aa  277  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  34.89 
 
 
489 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1487  Aldehyde Dehydrogenase  36.17 
 
 
479 aa  277  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3479  aldehyde dehydrogenase  40.39 
 
 
481 aa  276  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0877693  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  34.89 
 
 
489 aa  275  9e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000365  betaine aldehyde dehydrogenase  34.43 
 
 
486 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  35.89 
 
 
498 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.7 
 
 
484 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  34.34 
 
 
482 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  34.65 
 
 
482 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.69 
 
 
483 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.19 
 
 
500 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2752  Aldehyde Dehydrogenase  36.6 
 
 
475 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>