More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2482 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0804  aldehyde dehydrogenase  68.67 
 
 
483 aa  694    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2482  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
483 aa  994    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0180  aldehyde dehydrogenase  61.7 
 
 
483 aa  624  1e-177  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225137  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0367  aldehyde dehydrogenase family protein  54.08 
 
 
481 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4884  Aldehyde Dehydrogenase  52.17 
 
 
481 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4795  Aldehyde Dehydrogenase  52.59 
 
 
481 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0338248 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5053  vanillin: NAD oxidoreductase  52.79 
 
 
482 aa  501  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4802  Aldehyde Dehydrogenase  49.58 
 
 
498 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217691  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3305  aldehyde dehydrogenase  51.4 
 
 
482 aa  491  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1022  aldehyde dehydrogenase  51.24 
 
 
483 aa  485  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.504795  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14240  vanillin:NAD+ oxidoreductase  50.52 
 
 
482 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4891  Aldehyde Dehydrogenase  50.83 
 
 
488 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364964  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5094  aldehyde dehydrogenase  49.07 
 
 
483 aa  478  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.982796  normal  0.0694645 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6158  aldehyde dehydrogenase  51.03 
 
 
483 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112468  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4023  Aldehyde Dehydrogenase  51.04 
 
 
483 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000030517  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0610  aldehyde dehydrogenase  49.17 
 
 
480 aa  473  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3835  aldehyde dehydrogenase  53.02 
 
 
483 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0277  aldehyde dehydrogenase  51.51 
 
 
482 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170386  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1668  aldehyde dehydrogenase  50.32 
 
 
466 aa  468  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4869  aldehyde dehydrogenase  50.22 
 
 
483 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0491848  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2943  vanillin dehydrogenase  49.07 
 
 
482 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2727  aldehyde dehydrogenase  48.45 
 
 
482 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0704115  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1998  Aldehyde Dehydrogenase  53.44 
 
 
494 aa  458  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2494  aldehyde dehydrogenase  51.28 
 
 
483 aa  457  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0600724  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0715  aldehyde dehydrogenase  51.45 
 
 
483 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.210112 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2827  aldehyde dehydrogenase  51.57 
 
 
483 aa  449  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.771758  normal  0.36056 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2582  aldehyde dehydrogenase  52.08 
 
 
483 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0246842  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1133  aldehyde dehydrogenase  50.21 
 
 
486 aa  447  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.809245  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5913  aldehyde dehydrogenase  53.4 
 
 
483 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303901  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1971  aldehyde dehydrogenase  52.08 
 
 
483 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.662558  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2606  aldehyde dehydrogenase  51.88 
 
 
483 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5046  aldehyde dehydrogenase  46.98 
 
 
479 aa  442  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0408609  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3479  aldehyde dehydrogenase  47.97 
 
 
481 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0877693  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0226  vanillin dehydrogenase oxidoreductase protein  52.59 
 
 
484 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000243231  normal  0.062724 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3481  aldehyde dehydrogenase  51.77 
 
 
484 aa  441  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1083  aldehyde dehydrogenase  49.36 
 
 
466 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0094  aldehyde dehydrogenase family protein  53.66 
 
 
483 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.068435  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2501  aldehyde dehydrogenase  51.03 
 
 
483 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3357  vanillin dehydrogenase  49.28 
 
 
482 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.829356  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0347  aldehyde dehydrogenase family protein  53.66 
 
 
483 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439159  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1049  aldehyde dehydrogenase family protein  53.66 
 
 
483 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0891  putative vanillin dehydrogenase  53.66 
 
 
483 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391484  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2401  aldehyde dehydrogenase  49.07 
 
 
482 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2481  aldehyde dehydrogenase family protein  53.66 
 
 
483 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.695702  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0888  putative vanillin dehydrogenase  53.66 
 
 
483 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359253  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2630  aldehyde dehydrogenase  51.03 
 
 
483 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172845  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0646  aldehyde dehydrogenase family protein  53.66 
 
 
483 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00158045  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0051  aldehyde dehydrogenase  48.96 
 
 
482 aa  432  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0422241  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5464  aldehyde dehydrogenase  47.92 
 
 
482 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.326314 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0706  aldehyde dehydrogenase family protein  52.8 
 
 
483 aa  428  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18514  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2048  aldehyde dehydrogenase  49.9 
 
 
482 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.522648  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4594  aldehyde dehydrogenase  47.71 
 
 
482 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140144 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4915  aldehyde dehydrogenase  47.5 
 
 
482 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.71002  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5635  aldehyde dehydrogenase  47.92 
 
 
482 aa  425  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.517917  decreased coverage  0.00150641 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5054  vanillin: NAD oxidoreductase  45.11 
 
 
508 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.619044  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5224  aldehyde dehydrogenase  47.92 
 
 
482 aa  425  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812751  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3211  aldehyde dehydrogenase  50 
 
 
483 aa  420  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.161018  normal  0.0254396 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0457  aldehyde dehydrogenase  44.19 
 
 
489 aa  417  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1839  Aldehyde Dehydrogenase  50.64 
 
 
483 aa  416  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.613277  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0912  Aldehyde Dehydrogenase  41.79 
 
 
483 aa  412  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1801  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  48.12 
 
 
521 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1068  vanillin dehydrogenase  48.12 
 
 
521 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0630  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  48.12 
 
 
482 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.740666  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2362  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  48.12 
 
 
482 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474232  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0836  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  48.12 
 
 
521 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  40.42 
 
 
480 aa  366  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3895  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.67 
 
 
480 aa  366  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1015  aldehyde dehydrogenase  38.25 
 
 
496 aa  343  4e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1350  putative aldehyde dehydrogenase  38.05 
 
 
496 aa  341  2e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1894  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.47 
 
 
497 aa  335  1e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0153798  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04050  cytoplasmic aldehyde dehydrogenase (Eurofung)  41.01 
 
 
482 aa  334  2e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.310167  normal  0.390831 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3876  aldehyde dehydrogenase  38.51 
 
 
479 aa  329  6e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1695  aldehyde dehydrogenase  38.96 
 
 
510 aa  320  3e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2329  Aldehyde Dehydrogenase  39.75 
 
 
486 aa  317  4e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3760  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.63 
 
 
491 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2307  Aldehyde Dehydrogenase  35.95 
 
 
486 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0348  aldehyde dehydrogenase  37.39 
 
 
490 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  36.95 
 
 
480 aa  309  6.999999999999999e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5622  putative aldehyde dehydrogenase  38.2 
 
 
489 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0749  Aldehyde Dehydrogenase  38.38 
 
 
485 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5953  vanillin: NAD oxidoreductase  37.84 
 
 
493 aa  304  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804682  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  35.56 
 
 
482 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1057  Aldehyde Dehydrogenase  36.93 
 
 
491 aa  304  3.0000000000000004e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64740  putative aldehyde dehydrogenase  37.55 
 
 
489 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257516  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  37.5 
 
 
490 aa  300  4e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2155  Aldehyde Dehydrogenase  34.38 
 
 
503 aa  298  1e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.697441  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2291  succinate semialdehyde dehydrogenase  34.88 
 
 
485 aa  298  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01541  aldehyde dehydrogenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05520)  36.77 
 
 
484 aa  298  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.804956  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  36.48 
 
 
482 aa  296  5e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5334  vanillin: NAD oxidoreductase  37 
 
 
510 aa  294  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  36.26 
 
 
482 aa  293  6e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3244  aldehyde dehydrogenase  39.28 
 
 
489 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1755  succinate semialdehyde dehydrogenase  33.75 
 
 
497 aa  290  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.17 
 
 
482 aa  289  7e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  35.83 
 
 
490 aa  289  7e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.46 
 
 
479 aa  288  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  33.75 
 
 
482 aa  286  4e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.96 
 
 
482 aa  286  4e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.75 
 
 
482 aa  286  4e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.75 
 
 
482 aa  286  4e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>