More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3244 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6305  aldehyde dehydrogenase  72.05 
 
 		 492 aa  684    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.128394 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2977  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  66.6 
 
 		 491 aa  659    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3244  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 489 aa  982    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0302  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  71.43 
 
 		 490 aa  685    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.333466 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1311  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  72.88 
 
 		 489 aa  683    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6120  aldehyde dehydrogenase  72.88 
 
 		 489 aa  682    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5579  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  72.19 
 
 		 492 aa  673    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6518  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  72.88 
 
 		 489 aa  683    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3490  Aldehyde Dehydrogenase  71.16 
 
 		 488 aa  664    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.836011  normal  0.347598 
 
 
-
 
NC_003296  RS05194  putative benzaldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  56.2 
 
 		 492 aa  508  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0026447  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2950  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  56.6 
 
 		 493 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.241533  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2734  aldehyde dehydrogenase  55.05 
 
 		 493 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.350439 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0506  aldehyde dehydrogenase  51.86 
 
 		 486 aa  485  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0128  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  55.58 
 
 		 484 aa  474  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6645  benzaldehyde dehydrogenase  54.43 
 
 		 490 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.166166 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2192  Aldehyde Dehydrogenase  52.89 
 
 		 486 aa  466  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4885  Aldehyde Dehydrogenase  54.02 
 
 		 487 aa  460  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4519  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  51.12 
 
 		 491 aa  451  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4913  aldehyde dehydrogenase  48.88 
 
 		 491 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2506  aldehyde dehydrogenase  50.1 
 
 		 483 aa  424  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317548  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20250  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  51.85 
 
 		 486 aa  398  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.177841  normal  0.892194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2625  Aldehyde Dehydrogenase  47.66 
 
 		 486 aa  388  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1057  Aldehyde Dehydrogenase  43.15 
 
 		 491 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1350  putative aldehyde dehydrogenase  40.5 
 
 		 496 aa  369  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  43.31 
 
 		 480 aa  368  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1015  aldehyde dehydrogenase  40.5 
 
 		 496 aa  368  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2155  Aldehyde Dehydrogenase  41.27 
 
 		 503 aa  365  1e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.697441  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0808  Aldehyde Dehydrogenase  40.12 
 
 		 486 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1894  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.86 
 
 		 497 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0153798  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2307  Aldehyde Dehydrogenase  40.37 
 
 		 486 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5622  putative aldehyde dehydrogenase  42.67 
 
 		 489 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0348  aldehyde dehydrogenase  44.4 
 
 		 490 aa  354  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64740  putative aldehyde dehydrogenase  42.67 
 
 		 489 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0356  Aldehyde Dehydrogenase  41.27 
 
 		 503 aa  350  3e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0525  Aldehyde Dehydrogenase  42.18 
 
 		 490 aa  350  4e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2918  Aldehyde Dehydrogenase  40.21 
 
 		 497 aa  349  7e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5953  vanillin: NAD oxidoreductase  41.32 
 
 		 493 aa  344  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804682  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0749  Aldehyde Dehydrogenase  41.74 
 
 		 485 aa  341  2e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1695  aldehyde dehydrogenase  43.91 
 
 		 510 aa  341  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3760  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.17 
 
 		 491 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5334  vanillin: NAD oxidoreductase  39.71 
 
 		 510 aa  329  5.0000000000000004e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0912  Aldehyde Dehydrogenase  38.7 
 
 		 483 aa  327  3e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3876  aldehyde dehydrogenase  42.3 
 
 		 479 aa  324  3e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  40.95 
 
 		 496 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0367  aldehyde dehydrogenase family protein  43.75 
 
 		 481 aa  311  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3895  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.95 
 
 		 480 aa  311  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4795  Aldehyde Dehydrogenase  42.23 
 
 		 481 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0338248 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5053  vanillin: NAD oxidoreductase  43.02 
 
 		 482 aa  309  6.999999999999999e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  37.98 
 
 		 505 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1668  aldehyde dehydrogenase  42.22 
 
 		 466 aa  307  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4884  Aldehyde Dehydrogenase  41.2 
 
 		 481 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2727  aldehyde dehydrogenase  43.75 
 
 		 482 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0704115  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2943  vanillin dehydrogenase  43.29 
 
 		 482 aa  302  9e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14240  vanillin:NAD+ oxidoreductase  43.62 
 
 		 482 aa  300  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4869  aldehyde dehydrogenase  42.25 
 
 		 483 aa  300  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0491848  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0277  aldehyde dehydrogenase  42.73 
 
 		 482 aa  298  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170386  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0457  aldehyde dehydrogenase  40.12 
 
 		 489 aa  296  5e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4023  Aldehyde Dehydrogenase  41.2 
 
 		 483 aa  296  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000030517  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0226  vanillin dehydrogenase oxidoreductase protein  44 
 
 		 484 aa  295  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000243231  normal  0.062724 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0263  Aldehyde Dehydrogenase  40.22 
 
 		 494 aa  293  7e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.605117 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3479  aldehyde dehydrogenase  44.36 
 
 		 481 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0877693  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4802  Aldehyde Dehydrogenase  40.56 
 
 		 498 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217691  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  38.41 
 
 		 496 aa  291  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2482  aldehyde dehydrogenase  38.74 
 
 		 483 aa  291  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3305  aldehyde dehydrogenase  40.88 
 
 		 482 aa  290  6e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.57 
 
 		 500 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.28 
 
 		 487 aa  287  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1083  aldehyde dehydrogenase  41.6 
 
 		 466 aa  287  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.16 
 
 		 500 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  38.02 
 
 		 485 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6158  aldehyde dehydrogenase  40.85 
 
 		 483 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  35.24 
 
 		 493 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0804  aldehyde dehydrogenase  40.63 
 
 		 483 aa  283  5.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1133  aldehyde dehydrogenase  41.44 
 
 		 486 aa  283  6.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.809245  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  36.85 
 
 		 498 aa  283  7.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  34.97 
 
 		 503 aa  282  8.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  35.9 
 
 		 493 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.27 
 
 		 486 aa  282  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  36.73 
 
 		 493 aa  281  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  37.5 
 
 		 516 aa  281  1e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5464  aldehyde dehydrogenase  43.16 
 
 		 482 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.326314 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  35.06 
 
 		 497 aa  280  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0180  aldehyde dehydrogenase  37.85 
 
 		 483 aa  280  4e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2402  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.15 
 
 		 490 aa  280  6e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.16 
 
 		 479 aa  277  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0028  succinate-semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  37.55 
 
 		 497 aa  276  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  34.4 
 
 		 500 aa  276  4e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1966  Aldehyde Dehydrogenase  37.56 
 
 		 478 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.57596 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  36.04 
 
 		 490 aa  276  7e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  34.26 
 
 		 499 aa  276  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3357  vanillin dehydrogenase  43.69 
 
 		 482 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.829356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0051  aldehyde dehydrogenase  42.63 
 
 		 482 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0422241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  36.11 
 
 		 488 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4891  Aldehyde Dehydrogenase  40.56 
 
 		 488 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364964  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5094  aldehyde dehydrogenase  38.88 
 
 		 483 aa  273  4.0000000000000004e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.982796  normal  0.0694645 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  35.36 
 
 		 498 aa  273  5.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2494  aldehyde dehydrogenase  40.88 
 
 		 483 aa  273  5.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0600724  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4915  aldehyde dehydrogenase  42.69 
 
 		 482 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.71002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5100  Aldehyde Dehydrogenase  38.81 
 
 		 480 aa  273  6e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482433  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1022  aldehyde dehydrogenase  41.9 
 
 		 483 aa  273  7e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.504795  normal  0.634786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>