More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0226 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0226  vanillin dehydrogenase oxidoreductase protein  100 
 
 		 484 aa  957    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000243231  normal  0.062724 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4869  aldehyde dehydrogenase  73.28 
 
 		 483 aa  672    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0491848  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4023  Aldehyde Dehydrogenase  71.49 
 
 		 483 aa  656    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000030517  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2943  vanillin dehydrogenase  68.39 
 
 		 482 aa  622  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2727  aldehyde dehydrogenase  68.18 
 
 		 482 aa  624  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0704115  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5464  aldehyde dehydrogenase  71.49 
 
 		 482 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.326314 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4594  aldehyde dehydrogenase  71.28 
 
 		 482 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140144 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0277  aldehyde dehydrogenase  69.1 
 
 		 482 aa  615  1e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170386  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5635  aldehyde dehydrogenase  71.07 
 
 		 482 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.517917  decreased coverage  0.00150641 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14240  vanillin:NAD+ oxidoreductase  66.32 
 
 		 482 aa  609  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4915  aldehyde dehydrogenase  70.87 
 
 		 482 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.71002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0051  aldehyde dehydrogenase  71.07 
 
 		 482 aa  609  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0422241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5224  aldehyde dehydrogenase  71.07 
 
 		 482 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812751  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3357  vanillin dehydrogenase  68.8 
 
 		 482 aa  589  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.829356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3211  aldehyde dehydrogenase  71.28 
 
 		 483 aa  589  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.161018  normal  0.0254396 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2401  aldehyde dehydrogenase  68.6 
 
 		 482 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4802  Aldehyde Dehydrogenase  60.95 
 
 		 498 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217691  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5053  vanillin: NAD oxidoreductase  61.36 
 
 		 482 aa  579  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2494  aldehyde dehydrogenase  65.34 
 
 		 483 aa  574  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0600724  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2048  aldehyde dehydrogenase  69.21 
 
 		 482 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.522648  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4795  Aldehyde Dehydrogenase  63.75 
 
 		 481 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0338248 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4884  Aldehyde Dehydrogenase  63.12 
 
 		 481 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0367  aldehyde dehydrogenase family protein  59.92 
 
 		 481 aa  568  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1668  aldehyde dehydrogenase  63.79 
 
 		 466 aa  565  1e-160  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1022  aldehyde dehydrogenase  64.33 
 
 		 483 aa  564  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.504795  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6158  aldehyde dehydrogenase  61.59 
 
 		 483 aa  557  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1133  aldehyde dehydrogenase  64.58 
 
 		 486 aa  556  1e-157  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.809245  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3305  aldehyde dehydrogenase  60.12 
 
 		 482 aa  555  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5094  aldehyde dehydrogenase  58.88 
 
 		 483 aa  556  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.982796  normal  0.0694645 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4891  Aldehyde Dehydrogenase  60.54 
 
 		 488 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364964  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0610  aldehyde dehydrogenase  60.33 
 
 		 480 aa  546  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3835  aldehyde dehydrogenase  63.64 
 
 		 483 aa  545  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0715  aldehyde dehydrogenase  63.22 
 
 		 483 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.210112 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1083  aldehyde dehydrogenase  62.34 
 
 		 466 aa  535  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1801  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  68.8 
 
 		 521 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2582  aldehyde dehydrogenase  63.88 
 
 		 483 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0246842  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5913  aldehyde dehydrogenase  64.05 
 
 		 483 aa  533  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0836  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  68.8 
 
 		 521 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1971  aldehyde dehydrogenase  63.88 
 
 		 483 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.662558  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0630  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  68.8 
 
 		 482 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.740666  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2362  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  68.8 
 
 		 482 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474232  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1068  vanillin dehydrogenase  68.6 
 
 		 521 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2606  aldehyde dehydrogenase  63.26 
 
 		 483 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2630  aldehyde dehydrogenase  63.22 
 
 		 483 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172845  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1998  Aldehyde Dehydrogenase  64.93 
 
 		 494 aa  524  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0804  aldehyde dehydrogenase  53.51 
 
 		 483 aa  523  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2501  aldehyde dehydrogenase  62.81 
 
 		 483 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3481  aldehyde dehydrogenase  63.69 
 
 		 484 aa  523  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2481  aldehyde dehydrogenase family protein  65.5 
 
 		 483 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.695702  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0347  aldehyde dehydrogenase family protein  65.5 
 
 		 483 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439159  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0888  putative vanillin dehydrogenase  65.5 
 
 		 483 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359253  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1049  aldehyde dehydrogenase family protein  65.5 
 
 		 483 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0891  putative vanillin dehydrogenase  65.5 
 
 		 483 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391484  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0094  aldehyde dehydrogenase family protein  65.5 
 
 		 483 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.068435  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0706  aldehyde dehydrogenase family protein  65.5 
 
 		 483 aa  518  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18514  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0646  aldehyde dehydrogenase family protein  65.5 
 
 		 483 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00158045  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0180  aldehyde dehydrogenase  54.75 
 
 		 483 aa  516  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2827  aldehyde dehydrogenase  63.67 
 
 		 483 aa  514  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.771758  normal  0.36056 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3479  aldehyde dehydrogenase  60.69 
 
 		 481 aa  499  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0877693  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5046  aldehyde dehydrogenase  54.94 
 
 		 479 aa  497  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0408609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1839  Aldehyde Dehydrogenase  63.64 
 
 		 483 aa  489  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.613277  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5054  vanillin: NAD oxidoreductase  53.83 
 
 		 508 aa  483  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.619044  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2482  aldehyde dehydrogenase  49.59 
 
 		 483 aa  483  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0457  aldehyde dehydrogenase  53.73 
 
 		 489 aa  479  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3895  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.68 
 
 		 480 aa  412  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 		 480 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04050  cytoplasmic aldehyde dehydrogenase (Eurofung)  46.93 
 
 		 482 aa  393  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.310167  normal  0.390831 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0912  Aldehyde Dehydrogenase  41.37 
 
 		 483 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2329  Aldehyde Dehydrogenase  49.58 
 
 		 486 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3876  aldehyde dehydrogenase  42.77 
 
 		 479 aa  366  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01541  aldehyde dehydrogenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05520)  39.96 
 
 		 484 aa  343  2.9999999999999997e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.804956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1015  aldehyde dehydrogenase  39 
 
 		 496 aa  337  2.9999999999999997e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1350  putative aldehyde dehydrogenase  38.8 
 
 		 496 aa  336  5.999999999999999e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0749  Aldehyde Dehydrogenase  41.32 
 
 		 485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1695  aldehyde dehydrogenase  41.1 
 
 		 510 aa  327  3e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1894  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.92 
 
 		 497 aa  325  9e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0153798  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64740  putative aldehyde dehydrogenase  40.75 
 
 		 489 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6305  aldehyde dehydrogenase  44.61 
 
 		 492 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.128394 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1057  Aldehyde Dehydrogenase  39 
 
 		 491 aa  320  5e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6120  aldehyde dehydrogenase  44.33 
 
 		 489 aa  320  5e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6518  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  44.54 
 
 		 489 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1311  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  44.54 
 
 		 489 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5334  vanillin: NAD oxidoreductase  41.24 
 
 		 510 aa  316  5e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2155  Aldehyde Dehydrogenase  39.78 
 
 		 503 aa  315  9.999999999999999e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.697441  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5622  putative aldehyde dehydrogenase  40.33 
 
 		 489 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2307  Aldehyde Dehydrogenase  37.91 
 
 		 486 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0302  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  41.53 
 
 		 490 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.333466 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5579  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  44.71 
 
 		 492 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  38.02 
 
 		 490 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2625  Aldehyde Dehydrogenase  40.7 
 
 		 486 aa  307  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0348  aldehyde dehydrogenase  39.63 
 
 		 490 aa  306  7e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.4 
 
 		 489 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5953  vanillin: NAD oxidoreductase  40.62 
 
 		 493 aa  305  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804682  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  39.5 
 
 		 488 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03080  aldehyde dehydrogenase, putative  36.66 
 
 		 519 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.611345  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.22 
 
 		 489 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3760  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.54 
 
 		 491 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.4 
 
 		 489 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.19 
 
 		 489 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3244  aldehyde dehydrogenase  42.03 
 
 		 489 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>