More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6305 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3490  Aldehyde Dehydrogenase  75.47 
 
 
488 aa  708    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.836011  normal  0.347598 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6120  aldehyde dehydrogenase  93.7 
 
 
489 aa  895    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2977  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  65.98 
 
 
491 aa  649    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3244  aldehyde dehydrogenase  72.05 
 
 
489 aa  675    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0302  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  77.1 
 
 
490 aa  745    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.333466 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6518  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  94.11 
 
 
489 aa  895    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6305  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
492 aa  977    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.128394 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1311  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  94.11 
 
 
489 aa  895    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5579  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  97.56 
 
 
492 aa  905    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623419  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05194  putative benzaldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  57.44 
 
 
492 aa  523  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0026447  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2734  aldehyde dehydrogenase  57.93 
 
 
493 aa  521  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.350439 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2950  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  58.65 
 
 
493 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.241533  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0506  aldehyde dehydrogenase  52.8 
 
 
486 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0128  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  55.31 
 
 
484 aa  484  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2192  Aldehyde Dehydrogenase  53.81 
 
 
486 aa  466  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4885  Aldehyde Dehydrogenase  54.85 
 
 
487 aa  462  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6645  benzaldehyde dehydrogenase  53.47 
 
 
490 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.166166 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4519  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  53.77 
 
 
491 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4913  aldehyde dehydrogenase  50 
 
 
491 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2506  aldehyde dehydrogenase  52.49 
 
 
483 aa  432  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317548  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20250  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  51.69 
 
 
486 aa  385  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.177841  normal  0.892194 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  44.09 
 
 
480 aa  375  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2625  Aldehyde Dehydrogenase  45.3 
 
 
486 aa  371  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268652  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1057  Aldehyde Dehydrogenase  42.57 
 
 
491 aa  363  3e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2155  Aldehyde Dehydrogenase  42.97 
 
 
503 aa  359  6e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.697441  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2307  Aldehyde Dehydrogenase  40.54 
 
 
486 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0808  Aldehyde Dehydrogenase  39.79 
 
 
486 aa  350  5e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1015  aldehyde dehydrogenase  41.18 
 
 
496 aa  347  3e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1350  putative aldehyde dehydrogenase  41.18 
 
 
496 aa  346  4e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0348  aldehyde dehydrogenase  43.61 
 
 
490 aa  345  7e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64740  putative aldehyde dehydrogenase  44.18 
 
 
489 aa  345  8e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257516  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0356  Aldehyde Dehydrogenase  43.45 
 
 
503 aa  344  2e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3760  betaine-aldehyde dehydrogenase  43.16 
 
 
491 aa  343  4e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5622  putative aldehyde dehydrogenase  43.53 
 
 
489 aa  339  7e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0749  Aldehyde Dehydrogenase  42.53 
 
 
485 aa  337  2.9999999999999997e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2918  Aldehyde Dehydrogenase  39.88 
 
 
497 aa  330  4e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1894  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.37 
 
 
497 aa  324  2e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0153798  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0525  Aldehyde Dehydrogenase  40.61 
 
 
490 aa  324  3e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1695  aldehyde dehydrogenase  41.98 
 
 
510 aa  322  7e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0912  Aldehyde Dehydrogenase  37.74 
 
 
483 aa  316  5e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5953  vanillin: NAD oxidoreductase  39.38 
 
 
493 aa  313  5.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804682  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3895  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.82 
 
 
480 aa  311  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0457  aldehyde dehydrogenase  41.42 
 
 
489 aa  305  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5334  vanillin: NAD oxidoreductase  38.61 
 
 
510 aa  302  8.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0226  vanillin dehydrogenase oxidoreductase protein  45.18 
 
 
484 aa  300  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000243231  normal  0.062724 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1668  aldehyde dehydrogenase  42.06 
 
 
466 aa  299  8e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0263  Aldehyde Dehydrogenase  42.17 
 
 
494 aa  299  8e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.605117 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3876  aldehyde dehydrogenase  39.51 
 
 
479 aa  296  4e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4795  Aldehyde Dehydrogenase  41.84 
 
 
481 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0338248 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5053  vanillin: NAD oxidoreductase  43.87 
 
 
482 aa  294  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4802  Aldehyde Dehydrogenase  41.53 
 
 
498 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217691  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14240  vanillin:NAD+ oxidoreductase  44.32 
 
 
482 aa  292  9e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4023  Aldehyde Dehydrogenase  41.97 
 
 
483 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000030517  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0367  aldehyde dehydrogenase family protein  40.3 
 
 
481 aa  291  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4884  Aldehyde Dehydrogenase  40.51 
 
 
481 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  38.27 
 
 
496 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  39.28 
 
 
496 aa  289  6e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  36.36 
 
 
493 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4869  aldehyde dehydrogenase  43.66 
 
 
483 aa  288  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0491848  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.43 
 
 
481 aa  286  4e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2943  vanillin dehydrogenase  42.33 
 
 
482 aa  286  5e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0180  aldehyde dehydrogenase  40.51 
 
 
483 aa  286  5.999999999999999e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225137  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5054  vanillin: NAD oxidoreductase  39.81 
 
 
508 aa  283  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.619044  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6158  aldehyde dehydrogenase  41.35 
 
 
483 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112468  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2402  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.38 
 
 
490 aa  282  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  36.58 
 
 
493 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3305  aldehyde dehydrogenase  41.2 
 
 
482 aa  280  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4891  Aldehyde Dehydrogenase  39.8 
 
 
488 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364964  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1635  aldehyde dehydrogenase  42.14 
 
 
464 aa  279  7e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.766709  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0277  aldehyde dehydrogenase  41.76 
 
 
482 aa  279  7e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170386  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2727  aldehyde dehydrogenase  41.08 
 
 
482 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0704115  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1083  aldehyde dehydrogenase  42.3 
 
 
466 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5100  Aldehyde Dehydrogenase  39.47 
 
 
480 aa  278  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482433  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  35.23 
 
 
499 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2482  aldehyde dehydrogenase  37.63 
 
 
483 aa  277  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4594  aldehyde dehydrogenase  42.49 
 
 
482 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140144 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  36.38 
 
 
506 aa  276  5e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1133  aldehyde dehydrogenase  41.9 
 
 
486 aa  276  6e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.809245  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2494  aldehyde dehydrogenase  40.41 
 
 
483 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0600724  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1022  aldehyde dehydrogenase  41.3 
 
 
483 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.504795  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.17 
 
 
500 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  37.55 
 
 
490 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  39.56 
 
 
516 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.93 
 
 
482 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.3 
 
 
484 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.93 
 
 
482 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2105  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.32 
 
 
455 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0684833  normal  0.0301817 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.93 
 
 
482 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.93 
 
 
482 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5464  aldehyde dehydrogenase  42.27 
 
 
482 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.326314 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3479  aldehyde dehydrogenase  41.99 
 
 
481 aa  272  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0877693  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2042  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.32 
 
 
455 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.57203 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2059  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.32 
 
 
455 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.807209  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.02 
 
 
488 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5094  aldehyde dehydrogenase  40 
 
 
483 aa  271  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.982796  normal  0.0694645 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.23 
 
 
488 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  38.59 
 
 
487 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1966  Aldehyde Dehydrogenase  36.65 
 
 
478 aa  269  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.57596 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.85 
 
 
486 aa  269  7e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5635  aldehyde dehydrogenase  42.49 
 
 
482 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.517917  decreased coverage  0.00150641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>