More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2727 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3357  vanillin dehydrogenase  85.06 
 
 		 482 aa  739    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.829356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14240  vanillin:NAD+ oxidoreductase  79.46 
 
 		 482 aa  742    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2943  vanillin dehydrogenase  93.57 
 
 		 482 aa  866    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2048  aldehyde dehydrogenase  84.44 
 
 		 482 aa  713    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.522648  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2727  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 482 aa  967    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0704115  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4869  aldehyde dehydrogenase  70.92 
 
 		 483 aa  661    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0491848  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2401  aldehyde dehydrogenase  84.85 
 
 		 482 aa  737    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4023  Aldehyde Dehydrogenase  69.77 
 
 		 483 aa  654    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000030517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3211  aldehyde dehydrogenase  72.46 
 
 		 483 aa  610  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.161018  normal  0.0254396 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0277  aldehyde dehydrogenase  65.56 
 
 		 482 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170386  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4594  aldehyde dehydrogenase  66.05 
 
 		 482 aa  594  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140144 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5464  aldehyde dehydrogenase  66.46 
 
 		 482 aa  596  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.326314 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5635  aldehyde dehydrogenase  66.05 
 
 		 482 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.517917  decreased coverage  0.00150641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5224  aldehyde dehydrogenase  66.05 
 
 		 482 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812751  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0226  vanillin dehydrogenase oxidoreductase protein  68.18 
 
 		 484 aa  589  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000243231  normal  0.062724 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0051  aldehyde dehydrogenase  65.84 
 
 		 482 aa  587  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0422241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4915  aldehyde dehydrogenase  65.84 
 
 		 482 aa  588  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.71002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5053  vanillin: NAD oxidoreductase  61.9 
 
 		 482 aa  578  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4802  Aldehyde Dehydrogenase  61.04 
 
 		 498 aa  579  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217691  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2494  aldehyde dehydrogenase  64.44 
 
 		 483 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0600724  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4884  Aldehyde Dehydrogenase  60.17 
 
 		 481 aa  566  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5094  aldehyde dehydrogenase  59.42 
 
 		 483 aa  563  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.982796  normal  0.0694645 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0610  aldehyde dehydrogenase  61.9 
 
 		 480 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3835  aldehyde dehydrogenase  63.35 
 
 		 483 aa  558  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4795  Aldehyde Dehydrogenase  59.96 
 
 		 481 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0338248 
 
 
-
 
NC_004310  BR0367  aldehyde dehydrogenase family protein  57.56 
 
 		 481 aa  552  1e-156  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1022  aldehyde dehydrogenase  61.28 
 
 		 483 aa  551  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.504795  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0715  aldehyde dehydrogenase  62.94 
 
 		 483 aa  545  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.210112 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6158  aldehyde dehydrogenase  58.18 
 
 		 483 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4891  Aldehyde Dehydrogenase  59.5 
 
 		 488 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364964  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0836  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  66.25 
 
 		 521 aa  537  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0630  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  66.25 
 
 		 482 aa  537  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.740666  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2362  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  66.25 
 
 		 482 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474232  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5913  aldehyde dehydrogenase  63.98 
 
 		 483 aa  535  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1068  vanillin dehydrogenase  66.05 
 
 		 521 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1801  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  66.25 
 
 		 521 aa  537  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2606  aldehyde dehydrogenase  63.56 
 
 		 483 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2501  aldehyde dehydrogenase  63.77 
 
 		 483 aa  531  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1668  aldehyde dehydrogenase  57.33 
 
 		 466 aa  530  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1971  aldehyde dehydrogenase  63.35 
 
 		 483 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.662558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2582  aldehyde dehydrogenase  63.35 
 
 		 483 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0246842  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2630  aldehyde dehydrogenase  63.15 
 
 		 483 aa  528  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172845  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1133  aldehyde dehydrogenase  58.96 
 
 		 486 aa  517  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.809245  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1998  Aldehyde Dehydrogenase  61.88 
 
 		 494 aa  514  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3305  aldehyde dehydrogenase  55.28 
 
 		 482 aa  513  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0180  aldehyde dehydrogenase  52.38 
 
 		 483 aa  511  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0706  aldehyde dehydrogenase family protein  63.15 
 
 		 483 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18514  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0888  putative vanillin dehydrogenase  62.32 
 
 		 483 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.359253  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2481  aldehyde dehydrogenase family protein  62.32 
 
 		 483 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.695702  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0891  putative vanillin dehydrogenase  62.32 
 
 		 483 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391484  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0347  aldehyde dehydrogenase family protein  62.32 
 
 		 483 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439159  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0094  aldehyde dehydrogenase family protein  62.32 
 
 		 483 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.068435  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1049  aldehyde dehydrogenase family protein  62.32 
 
 		 483 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0646  aldehyde dehydrogenase family protein  62.32 
 
 		 483 aa  504  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00158045  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2827  aldehyde dehydrogenase  59.42 
 
 		 483 aa  502  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.771758  normal  0.36056 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3479  aldehyde dehydrogenase  58.28 
 
 		 481 aa  504  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0877693  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1083  aldehyde dehydrogenase  56.13 
 
 		 466 aa  501  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1839  Aldehyde Dehydrogenase  62.94 
 
 		 483 aa  501  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.613277  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5054  vanillin: NAD oxidoreductase  55 
 
 		 508 aa  498  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.619044  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0804  aldehyde dehydrogenase  50.31 
 
 		 483 aa  497  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2482  aldehyde dehydrogenase  48.45 
 
 		 483 aa  473  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0457  aldehyde dehydrogenase  52.81 
 
 		 489 aa  471  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3481  aldehyde dehydrogenase  56.28 
 
 		 484 aa  469  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5046  aldehyde dehydrogenase  51.94 
 
 		 479 aa  468  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0408609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  41.41 
 
 		 480 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0912  Aldehyde Dehydrogenase  41.88 
 
 		 483 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3895  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.53 
 
 		 480 aa  375  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04050  cytoplasmic aldehyde dehydrogenase (Eurofung)  43.33 
 
 		 482 aa  363  3e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.310167  normal  0.390831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2329  Aldehyde Dehydrogenase  47.71 
 
 		 486 aa  357  2.9999999999999997e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3876  aldehyde dehydrogenase  39.5 
 
 		 479 aa  345  7e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01541  aldehyde dehydrogenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05520)  39.67 
 
 		 484 aa  340  2e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.804956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1057  Aldehyde Dehydrogenase  39.67 
 
 		 491 aa  324  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1350  putative aldehyde dehydrogenase  36.12 
 
 		 496 aa  323  3e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1015  aldehyde dehydrogenase  36.12 
 
 		 496 aa  320  3.9999999999999996e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1695  aldehyde dehydrogenase  38.2 
 
 		 510 aa  311  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5334  vanillin: NAD oxidoreductase  38.22 
 
 		 510 aa  309  6.999999999999999e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1894  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.84 
 
 		 497 aa  303  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0153798  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3244  aldehyde dehydrogenase  43.75 
 
 		 489 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64740  putative aldehyde dehydrogenase  36.51 
 
 		 489 aa  300  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2307  Aldehyde Dehydrogenase  35.7 
 
 		 486 aa  297  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.74 
 
 		 498 aa  296  5e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3760  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.67 
 
 		 491 aa  296  8e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0749  Aldehyde Dehydrogenase  37.09 
 
 		 485 aa  295  1e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0808  Aldehyde Dehydrogenase  35 
 
 		 486 aa  293  5e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5622  putative aldehyde dehydrogenase  36.31 
 
 		 489 aa  292  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5953  vanillin: NAD oxidoreductase  38.59 
 
 		 493 aa  293  7e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804682  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0348  aldehyde dehydrogenase  37.61 
 
 		 490 aa  291  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  37.24 
 
 		 480 aa  291  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6518  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  40.69 
 
 		 489 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1311  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  40.69 
 
 		 489 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0302  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  40.6 
 
 		 490 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.333466 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6120  aldehyde dehydrogenase  40.48 
 
 		 489 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6305  aldehyde dehydrogenase  40.99 
 
 		 492 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.128394 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  35.26 
 
 		 490 aa  286  7e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.17 
 
 		 487 aa  286  8e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03080  aldehyde dehydrogenase, putative  36.2 
 
 		 519 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.611345  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3676  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.75 
 
 		 484 aa  285  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2155  Aldehyde Dehydrogenase  36.12 
 
 		 503 aa  285  2.0000000000000002e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.697441  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5826  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  36.38 
 
 		 485 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26319  normal  0.439131 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0128  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  40.61 
 
 		 484 aa  283  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>