More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3760 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1350  putative aldehyde dehydrogenase  62.14 
 
 		 496 aa  648    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0348  aldehyde dehydrogenase  68.18 
 
 		 490 aa  667    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1015  aldehyde dehydrogenase  62.14 
 
 		 496 aa  647    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3760  betaine-aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 491 aa  999    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5622  putative aldehyde dehydrogenase  65.64 
 
 		 489 aa  674    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64740  putative aldehyde dehydrogenase  66.67 
 
 		 489 aa  683    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1894  betaine-aldehyde dehydrogenase  65.9 
 
 		 497 aa  647    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0153798  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1695  aldehyde dehydrogenase  58.26 
 
 		 510 aa  585  1e-166  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309119 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5334  vanillin: NAD oxidoreductase  57.65 
 
 		 510 aa  554  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5953  vanillin: NAD oxidoreductase  55.65 
 
 		 493 aa  531  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804682  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1057  Aldehyde Dehydrogenase  51.24 
 
 		 491 aa  487  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0749  Aldehyde Dehydrogenase  49.16 
 
 		 485 aa  475  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0808  Aldehyde Dehydrogenase  47.36 
 
 		 486 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0263  Aldehyde Dehydrogenase  50.1 
 
 		 494 aa  464  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.605117 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2307  Aldehyde Dehydrogenase  47.94 
 
 		 486 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2918  Aldehyde Dehydrogenase  44.93 
 
 		 497 aa  426  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0525  Aldehyde Dehydrogenase  45.33 
 
 		 490 aa  408  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0912  Aldehyde Dehydrogenase  43.54 
 
 		 483 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  44.65 
 
 		 480 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2155  Aldehyde Dehydrogenase  42.77 
 
 		 503 aa  399  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.697441  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3895  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.56 
 
 		 480 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0356  Aldehyde Dehydrogenase  43.19 
 
 		 503 aa  375  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2977  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  43.84 
 
 		 491 aa  353  4e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4519  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  43.6 
 
 		 491 aa  353  5e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6305  aldehyde dehydrogenase  43.79 
 
 		 492 aa  345  7e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.128394 
 
 
-
 
NC_003296  RS05194  putative benzaldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  43.03 
 
 		 492 aa  344  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0026447  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3244  aldehyde dehydrogenase  44.27 
 
 		 489 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6518  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  42.98 
 
 		 489 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1311  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  42.98 
 
 		 489 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6120  aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 		 489 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3490  Aldehyde Dehydrogenase  42.47 
 
 		 488 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.836011  normal  0.347598 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0302  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  41.98 
 
 		 490 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.333466 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5579  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  44.21 
 
 		 492 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0180  aldehyde dehydrogenase  37.47 
 
 		 483 aa  326  6e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.225137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1668  aldehyde dehydrogenase  40.04 
 
 		 466 aa  324  2e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4885  Aldehyde Dehydrogenase  42.27 
 
 		 487 aa  322  8e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4802  Aldehyde Dehydrogenase  38.54 
 
 		 498 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217691  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2506  aldehyde dehydrogenase  40.92 
 
 		 483 aa  318  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317548  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0367  aldehyde dehydrogenase family protein  38.41 
 
 		 481 aa  317  3e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0128  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  42.12 
 
 		 484 aa  316  7e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0804  aldehyde dehydrogenase  38 
 
 		 483 aa  315  8e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4795  Aldehyde Dehydrogenase  40.37 
 
 		 481 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0338248 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4884  Aldehyde Dehydrogenase  40.04 
 
 		 481 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2482  aldehyde dehydrogenase  37.63 
 
 		 483 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2625  Aldehyde Dehydrogenase  39.54 
 
 		 486 aa  311  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6645  benzaldehyde dehydrogenase  40.93 
 
 		 490 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.166166 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  37.71 
 
 		 496 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0457  aldehyde dehydrogenase  37.97 
 
 		 489 aa  308  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  37.9 
 
 		 493 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5053  vanillin: NAD oxidoreductase  36.98 
 
 		 482 aa  308  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1133  aldehyde dehydrogenase  38.56 
 
 		 486 aa  306  4.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.809245  hitchhiker  0.000145932 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4891  Aldehyde Dehydrogenase  38.96 
 
 		 488 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364964  normal  0.705807 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0506  aldehyde dehydrogenase  38.62 
 
 		 486 aa  304  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2734  aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 		 493 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.350439 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4913  aldehyde dehydrogenase  39.58 
 
 		 491 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2950  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  39.96 
 
 		 493 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.241533  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2752  Aldehyde Dehydrogenase  39.14 
 
 		 475 aa  302  9e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  39.63 
 
 		 490 aa  301  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2192  Aldehyde Dehydrogenase  40.67 
 
 		 486 aa  302  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1083  aldehyde dehydrogenase  38.17 
 
 		 466 aa  301  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  38.57 
 
 		 510 aa  301  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  36.57 
 
 		 496 aa  298  1e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4869  aldehyde dehydrogenase  37.08 
 
 		 483 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0491848  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5094  aldehyde dehydrogenase  36.65 
 
 		 483 aa  298  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.982796  normal  0.0694645 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3305  aldehyde dehydrogenase  37.08 
 
 		 482 aa  298  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1487  Aldehyde Dehydrogenase  37.68 
 
 		 479 aa  297  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0610  aldehyde dehydrogenase  37.6 
 
 		 480 aa  296  4e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4023  Aldehyde Dehydrogenase  37.58 
 
 		 483 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000030517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1578  aldehyde dehydrogenase  35.71 
 
 		 475 aa  293  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000814705  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0277  aldehyde dehydrogenase  40.23 
 
 		 482 aa  293  5e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170386  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3479  aldehyde dehydrogenase  39.66 
 
 		 481 aa  290  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0877693  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3876  aldehyde dehydrogenase  35.96 
 
 		 479 aa  290  3e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  37.18 
 
 		 482 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5464  aldehyde dehydrogenase  39.71 
 
 		 482 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.326314 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14240  vanillin:NAD+ oxidoreductase  36.67 
 
 		 482 aa  288  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  35.33 
 
 		 510 aa  288  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4594  aldehyde dehydrogenase  39.5 
 
 		 482 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140144 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5635  aldehyde dehydrogenase  39.5 
 
 		 482 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.517917  decreased coverage  0.00150641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5224  aldehyde dehydrogenase  39.5 
 
 		 482 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812751  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  34.04 
 
 		 490 aa  286  8e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  36.81 
 
 		 493 aa  285  9e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1582  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.9 
 
 		 551 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0334627 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2494  aldehyde dehydrogenase  37.79 
 
 		 483 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0600724  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  38.05 
 
 		 480 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  34.86 
 
 		 483 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0051  aldehyde dehydrogenase  39.71 
 
 		 482 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0422241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  37.45 
 
 		 480 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  32.57 
 
 		 500 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  36.98 
 
 		 508 aa  283  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  34.73 
 
 		 497 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1309  aldehyde dehydrogenase  35.59 
 
 		 477 aa  283  6.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.472659  normal  0.0179284 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2727  aldehyde dehydrogenase  36.67 
 
 		 482 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0704115  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5046  aldehyde dehydrogenase  36.23 
 
 		 479 aa  282  9e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0408609  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.75 
 
 		 480 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20250  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  43.91 
 
 		 486 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.177841  normal  0.892194 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.54 
 
 		 480 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.54 
 
 		 480 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1022  aldehyde dehydrogenase  37.01 
 
 		 483 aa  280  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.504795  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  34.8 
 
 		 482 aa  280  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2943  vanillin dehydrogenase  36.25 
 
 		 482 aa  280  5e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>