More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1582 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1582  succinic semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
551 aa  1084    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0334627 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  60.81 
 
 
531 aa  649    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1328  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.03 
 
 
526 aa  494  9.999999999999999e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.5626 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  50.5 
 
 
533 aa  484  1e-135  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3633  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.15 
 
 
540 aa  475  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2456  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.88 
 
 
541 aa  466  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31424  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  46.82 
 
 
521 aa  463  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0115  Aldehyde Dehydrogenase  52.18 
 
 
516 aa  461  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2590  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.51 
 
 
525 aa  456  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11748  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.62 
 
 
518 aa  456  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1018  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.3 
 
 
550 aa  454  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0148351 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0627  aldehyde dehydrogenase  52.31 
 
 
518 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1175  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.51 
 
 
521 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872678  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4685  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.69 
 
 
538 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28560  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  54.7 
 
 
540 aa  432  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352925  normal  0.067406 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2921  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
534 aa  430  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000177812  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0137  Aldehyde Dehydrogenase  49.13 
 
 
517 aa  416  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1995  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.61 
 
 
517 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4004  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.51 
 
 
519 aa  410  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24720  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.2 
 
 
537 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0690  Aldehyde Dehydrogenase  53.14 
 
 
534 aa  395  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2579  Aldehyde Dehydrogenase  51.65 
 
 
547 aa  389  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16978  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1896  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.43 
 
 
525 aa  376  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  hitchhiker  0.00000854117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  46.27 
 
 
510 aa  375  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  44.84 
 
 
522 aa  362  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0626  aldehyde dehydrogenase  43.04 
 
 
505 aa  330  6e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0613  aldehyde dehydrogenase  43.04 
 
 
505 aa  330  6e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0604  aldehyde dehydrogenase  43.04 
 
 
505 aa  330  6e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229199  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0771  aldehyde dehydrogenase  42.37 
 
 
512 aa  318  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179564  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0132  aldehyde dehydrogenase  42.86 
 
 
509 aa  318  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129014  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  40.17 
 
 
494 aa  302  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  38.16 
 
 
493 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  37.37 
 
 
484 aa  298  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.53 
 
 
482 aa  297  4e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  41.68 
 
 
461 aa  296  5e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.62 
 
 
485 aa  296  9e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.18 
 
 
500 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.32 
 
 
486 aa  294  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.31 
 
 
482 aa  295  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.1 
 
 
482 aa  294  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.18 
 
 
500 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.1 
 
 
482 aa  294  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.04 
 
 
482 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5050  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.3 
 
 
485 aa  294  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.603107 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.04 
 
 
482 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.04 
 
 
482 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.04 
 
 
482 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  37.1 
 
 
482 aa  293  6e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  37.1 
 
 
482 aa  293  6e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.1 
 
 
482 aa  293  6e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  37.98 
 
 
490 aa  293  7e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.61 
 
 
483 aa  293  8e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.89 
 
 
482 aa  291  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0818  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.1 
 
 
488 aa  291  2e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.9 
 
 
483 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0808  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.1 
 
 
488 aa  290  4e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.232727 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.33 
 
 
496 aa  290  4e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.85 
 
 
482 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4999  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.32 
 
 
495 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416466  normal  0.785793 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.61 
 
 
480 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.21 
 
 
488 aa  288  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.66 
 
 
479 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.81 
 
 
482 aa  288  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0255  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.2 
 
 
497 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666888  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  38.11 
 
 
493 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  37.74 
 
 
480 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  38.38 
 
 
483 aa  287  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.83 
 
 
483 aa  287  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.83 
 
 
483 aa  287  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.37 
 
 
480 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4591  Betaine-aldehyde dehydrogenase  36.93 
 
 
486 aa  286  5e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  35.39 
 
 
494 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.37 
 
 
480 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.1 
 
 
484 aa  286  7e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  37.74 
 
 
505 aa  286  8e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.04 
 
 
490 aa  286  9e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.37 
 
 
480 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0732  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.8 
 
 
501 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207318  normal  0.0607885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  39.27 
 
 
510 aa  286  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.47 
 
 
483 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.62 
 
 
479 aa  284  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.1 
 
 
480 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.37 
 
 
480 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  40.38 
 
 
485 aa  284  3.0000000000000004e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4323  aldehyde dehydrogenase  37.47 
 
 
503 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  35.18 
 
 
494 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2232  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.13 
 
 
490 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.179886  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3036  aldehyde dehydrogenase  37.77 
 
 
488 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2295  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  37.82 
 
 
491 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0465  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.17 
 
 
497 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  38.74 
 
 
504 aa  283  7.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3760  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.48 
 
 
491 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.4 
 
 
479 aa  282  9e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.58 
 
 
493 aa  282  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2533  aldehyde dehydrogenase  38.71 
 
 
468 aa  282  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4306  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.93 
 
 
485 aa  282  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.93 
 
 
490 aa  282  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.9 
 
 
485 aa  281  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  37.17 
 
 
510 aa  281  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0028  succinate-semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  38.79 
 
 
497 aa  281  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>