More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4249 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2590  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.2 
 
 
525 aa  646    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
521 aa  1060    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0627  aldehyde dehydrogenase  68.98 
 
 
518 aa  703    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1175  succinic semialdehyde dehydrogenase  68.07 
 
 
521 aa  722    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872678  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2921  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.67 
 
 
534 aa  551  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000177812  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  53.2 
 
 
533 aa  548  1e-155  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1018  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.8 
 
 
550 aa  532  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0148351 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3633  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.23 
 
 
540 aa  531  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2456  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.88 
 
 
541 aa  522  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31424  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24720  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.07 
 
 
537 aa  509  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4685  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.57 
 
 
538 aa  501  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11748  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.75 
 
 
518 aa  490  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0115  Aldehyde Dehydrogenase  52.65 
 
 
516 aa  482  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  47.95 
 
 
531 aa  482  1e-135  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4004  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.9 
 
 
519 aa  468  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1582  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.82 
 
 
551 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0334627 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0137  Aldehyde Dehydrogenase  51.05 
 
 
517 aa  449  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1328  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.58 
 
 
526 aa  436  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.5626 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28560  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  52.87 
 
 
540 aa  436  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352925  normal  0.067406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1995  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.97 
 
 
517 aa  436  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2579  Aldehyde Dehydrogenase  50.83 
 
 
547 aa  427  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16978  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0690  Aldehyde Dehydrogenase  51.65 
 
 
534 aa  424  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1896  succinic semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 
525 aa  396  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  hitchhiker  0.00000854117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  41.86 
 
 
510 aa  357  2.9999999999999997e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  39.55 
 
 
522 aa  323  5e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  38.82 
 
 
505 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0771  aldehyde dehydrogenase  40.95 
 
 
512 aa  306  6e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179564  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0613  aldehyde dehydrogenase  40.04 
 
 
505 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0604  aldehyde dehydrogenase  40.04 
 
 
505 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229199  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0626  aldehyde dehydrogenase  40.04 
 
 
505 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0132  aldehyde dehydrogenase  39.41 
 
 
509 aa  292  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129014  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.53 
 
 
485 aa  292  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.69 
 
 
479 aa  288  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.01 
 
 
484 aa  284  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.87 
 
 
500 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.79 
 
 
492 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.87 
 
 
500 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2720  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.48 
 
 
496 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133505  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.35 
 
 
508 aa  283  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  38.49 
 
 
493 aa  283  7.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  35.92 
 
 
493 aa  282  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3036  aldehyde dehydrogenase  37.5 
 
 
488 aa  282  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  36.25 
 
 
480 aa  280  3e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  35.98 
 
 
484 aa  280  4e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1015  aldehyde dehydrogenase  34.85 
 
 
496 aa  280  5e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.6 
 
 
503 aa  280  5e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  34.48 
 
 
496 aa  280  6e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  36.6 
 
 
494 aa  280  6e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2307  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.05 
 
 
484 aa  279  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.841119  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4323  aldehyde dehydrogenase  37.82 
 
 
503 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0486  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.42 
 
 
489 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0422  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.42 
 
 
489 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.58 
 
 
486 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.38 
 
 
503 aa  277  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  36.33 
 
 
494 aa  277  3e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.39 
 
 
488 aa  277  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  37.12 
 
 
485 aa  277  4e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2918  Aldehyde Dehydrogenase  37.17 
 
 
497 aa  276  5e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  36.09 
 
 
490 aa  276  5e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36.17 
 
 
494 aa  276  5e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1350  putative aldehyde dehydrogenase  34.42 
 
 
496 aa  276  6e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  36.63 
 
 
490 aa  276  9e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  36.44 
 
 
494 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.44 
 
 
484 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0818  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.81 
 
 
488 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.373516  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5593  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.54 
 
 
484 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0808  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.81 
 
 
488 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.232727 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  35.96 
 
 
494 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  35.4 
 
 
482 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  36.56 
 
 
494 aa  275  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.79 
 
 
486 aa  274  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.59 
 
 
483 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  37.06 
 
 
483 aa  274  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  35.94 
 
 
494 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  35.94 
 
 
494 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  35.94 
 
 
494 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  35.94 
 
 
494 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  36.44 
 
 
494 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3176  aldehyde dehydrogenase  34.24 
 
 
490 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139941  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  35.94 
 
 
494 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  36.4 
 
 
504 aa  273  5.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.7 
 
 
482 aa  273  6e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.45 
 
 
489 aa  273  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0395  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.05 
 
 
475 aa  273  6e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  33.7 
 
 
482 aa  273  7e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.7 
 
 
482 aa  273  7e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  33.7 
 
 
482 aa  273  7e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.4 
 
 
484 aa  273  8.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.65 
 
 
480 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.08 
 
 
483 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1759  aldehyde dehydrogenase B  34.19 
 
 
486 aa  272  8.000000000000001e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.33 
 
 
479 aa  272  8.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.48 
 
 
482 aa  273  8.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03829  succinate-semialdehyde dehydrogenase (Eurofung)  34.82 
 
 
531 aa  272  9e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.77 
 
 
482 aa  272  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.76 
 
 
480 aa  272  9e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.77 
 
 
482 aa  272  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.55 
 
 
482 aa  272  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  35.04 
 
 
497 aa  272  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1497  succinate-semialdehyde dehydrogenase [NADP+] (ssdh)  33.91 
 
 
477 aa  272  1e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.442426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>