More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4004 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1995  succinic semialdehyde dehydrogenase  63.44 
 
 
517 aa  663    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4004  succinic semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
519 aa  1068    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  45.9 
 
 
521 aa  488  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1175  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.92 
 
 
521 aa  473  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872678  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0627  aldehyde dehydrogenase  49.31 
 
 
518 aa  472  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2590  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.77 
 
 
525 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2921  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.45 
 
 
534 aa  463  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000177812  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3633  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.75 
 
 
540 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  44.33 
 
 
531 aa  441  9.999999999999999e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  46.23 
 
 
533 aa  434  1e-120  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11748  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.13 
 
 
518 aa  434  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4685  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.05 
 
 
538 aa  435  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0115  Aldehyde Dehydrogenase  48.01 
 
 
516 aa  426  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2456  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.63 
 
 
541 aa  427  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31424  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1582  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.51 
 
 
551 aa  419  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0334627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1018  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.55 
 
 
550 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0148351 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0137  Aldehyde Dehydrogenase  43.97 
 
 
517 aa  402  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1328  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.94 
 
 
526 aa  390  1e-107  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.5626 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24720  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.42 
 
 
537 aa  391  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28560  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  46.23 
 
 
540 aa  381  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352925  normal  0.067406 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1896  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.94 
 
 
525 aa  355  1e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  hitchhiker  0.00000854117 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2579  Aldehyde Dehydrogenase  45.84 
 
 
547 aa  355  2e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16978  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0690  Aldehyde Dehydrogenase  42.91 
 
 
534 aa  353  5.9999999999999994e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  41.58 
 
 
510 aa  322  9.999999999999999e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0613  aldehyde dehydrogenase  38.07 
 
 
505 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0604  aldehyde dehydrogenase  38.07 
 
 
505 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229199  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0626  aldehyde dehydrogenase  38.07 
 
 
505 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0771  aldehyde dehydrogenase  37.2 
 
 
512 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179564  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0132  aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 
509 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129014  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  39.39 
 
 
522 aa  295  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.28 
 
 
493 aa  286  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.6 
 
 
486 aa  273  5.000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.54 
 
 
489 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.54 
 
 
489 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.54 
 
 
489 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.11 
 
 
489 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.33 
 
 
479 aa  267  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  36.25 
 
 
484 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.9 
 
 
489 aa  266  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.11 
 
 
489 aa  266  7e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3193  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.04 
 
 
480 aa  266  8e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.9 
 
 
489 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.12 
 
 
479 aa  265  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.68 
 
 
482 aa  265  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.69 
 
 
492 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3263  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.92 
 
 
489 aa  263  8e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.132134 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.28 
 
 
484 aa  262  8.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3676  succinate semialdehyde dehydrogenase  34.32 
 
 
484 aa  262  8.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.96 
 
 
483 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.71 
 
 
496 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.7 
 
 
489 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.01 
 
 
483 aa  261  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.7 
 
 
489 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.7 
 
 
489 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.7 
 
 
489 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.7 
 
 
489 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.7 
 
 
489 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  34.83 
 
 
482 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.53 
 
 
480 aa  259  7e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1578  aldehyde dehydrogenase  32.63 
 
 
475 aa  259  7e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000814705  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  35.82 
 
 
497 aa  259  8e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  35.03 
 
 
505 aa  259  9e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.53 
 
 
483 aa  259  9e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.48 
 
 
489 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8160  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  33.95 
 
 
494 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.407408  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  34.41 
 
 
509 aa  258  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.79 
 
 
479 aa  257  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.52 
 
 
493 aa  257  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2493  succinate semialdehyde dehydrogenase  34.55 
 
 
490 aa  257  4e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4025  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.83 
 
 
493 aa  257  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.577209  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  36.9 
 
 
510 aa  256  6e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0213  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.81 
 
 
492 aa  256  8e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal  0.906241 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  35.32 
 
 
494 aa  256  9e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  36.09 
 
 
491 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4676  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.48 
 
 
491 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.0486127 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.75 
 
 
500 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  35.95 
 
 
499 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2295  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  35.03 
 
 
491 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.1 
 
 
484 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  34.4 
 
 
480 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  35.11 
 
 
494 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1015  aldehyde dehydrogenase  32.9 
 
 
496 aa  255  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  36.15 
 
 
461 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  34.84 
 
 
480 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2887  NADP(+) dependentsuccinate-semialdehyde dehydrogenase  37.9 
 
 
492 aa  254  3e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00129207  normal  0.447595 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4591  Betaine-aldehyde dehydrogenase  34.45 
 
 
486 aa  254  3e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  33.83 
 
 
486 aa  254  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.48 
 
 
486 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.48 
 
 
484 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.35 
 
 
486 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.09 
 
 
483 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.19 
 
 
482 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  34.89 
 
 
494 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2257  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.23 
 
 
490 aa  253  6e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.142739  normal  0.131796 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.97 
 
 
482 aa  253  7e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  34.89 
 
 
494 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.81 
 
 
500 aa  253  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  34.89 
 
 
494 aa  253  8.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.33 
 
 
488 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0048  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.97 
 
 
488 aa  252  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>