More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1018 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1018  succinic semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
550 aa  1118    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0148351 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  53.8 
 
 
521 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1175  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.17 
 
 
521 aa  546  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872678  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2590  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.62 
 
 
525 aa  537  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0627  aldehyde dehydrogenase  53.79 
 
 
518 aa  530  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3633  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.55 
 
 
540 aa  530  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2921  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.92 
 
 
534 aa  528  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000177812  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2456  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.88 
 
 
541 aa  514  1e-144  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31424  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  51.76 
 
 
533 aa  509  1e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4685  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.37 
 
 
538 aa  505  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24720  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.6 
 
 
537 aa  480  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  48.22 
 
 
531 aa  480  1e-134  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1582  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.3 
 
 
551 aa  477  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0334627 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11748  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.1 
 
 
518 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28560  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  52.93 
 
 
540 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352925  normal  0.067406 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0115  Aldehyde Dehydrogenase  51.88 
 
 
516 aa  446  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0137  Aldehyde Dehydrogenase  51.42 
 
 
517 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1995  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.93 
 
 
517 aa  422  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4004  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.55 
 
 
519 aa  425  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0690  Aldehyde Dehydrogenase  51.24 
 
 
534 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1896  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.59 
 
 
525 aa  416  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  hitchhiker  0.00000854117 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2579  Aldehyde Dehydrogenase  46.33 
 
 
547 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16978  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1328  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.38 
 
 
526 aa  398  1e-109  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.5626 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  42.64 
 
 
510 aa  337  5e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  38.25 
 
 
522 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  38.24 
 
 
484 aa  296  8e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0422  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.58 
 
 
489 aa  294  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0486  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.58 
 
 
489 aa  294  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0604  aldehyde dehydrogenase  38.74 
 
 
505 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229199  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0613  aldehyde dehydrogenase  38.74 
 
 
505 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.43 
 
 
479 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0626  aldehyde dehydrogenase  38.74 
 
 
505 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  39 
 
 
494 aa  289  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  38.1 
 
 
504 aa  287  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0771  aldehyde dehydrogenase  39.3 
 
 
512 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179564  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.65 
 
 
486 aa  285  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.68 
 
 
493 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.16 
 
 
479 aa  284  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3676  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.96 
 
 
484 aa  284  3.0000000000000004e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.94 
 
 
479 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.01 
 
 
496 aa  281  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.83 
 
 
483 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  35.96 
 
 
505 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  38.2 
 
 
493 aa  277  3e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4277  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.65 
 
 
491 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  38.88 
 
 
483 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  36.42 
 
 
490 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  38.04 
 
 
483 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1883  betaine aldehyde dehydrogenase  37.78 
 
 
485 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2524  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.8 
 
 
509 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.70277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1276  aldehyde dehydrogenase  36.29 
 
 
497 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.420346  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.11 
 
 
508 aa  274  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  34.87 
 
 
494 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4323  aldehyde dehydrogenase  37.45 
 
 
503 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.52 
 
 
479 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  34.94 
 
 
490 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.83 
 
 
488 aa  273  7e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  37.69 
 
 
496 aa  273  8.000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  34.87 
 
 
494 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2290  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.21 
 
 
503 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  36.21 
 
 
490 aa  273  8.000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2568  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.5 
 
 
486 aa  272  9e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.951924  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0132  aldehyde dehydrogenase  38.43 
 
 
509 aa  272  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129014  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.39 
 
 
487 aa  271  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5050  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.66 
 
 
485 aa  271  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.603107 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  37.31 
 
 
485 aa  270  5e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3685  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.77 
 
 
495 aa  270  5e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4676  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.25 
 
 
491 aa  270  5.9999999999999995e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.0486127 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  38.41 
 
 
483 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0768  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.36 
 
 
492 aa  269  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823565  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  33.53 
 
 
494 aa  268  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4999  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  37.07 
 
 
495 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416466  normal  0.785793 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.38 
 
 
483 aa  268  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  36.67 
 
 
489 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  33.53 
 
 
494 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3036  aldehyde dehydrogenase  37.1 
 
 
488 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1485  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.31 
 
 
490 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.464618  hitchhiker  0.00159215 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0563  betaine aldehyde dehydrogenase  35.9 
 
 
487 aa  267  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.886348  normal  0.578799 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  36.89 
 
 
489 aa  267  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  35.79 
 
 
493 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  34.07 
 
 
494 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  34.77 
 
 
485 aa  266  5.999999999999999e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2307  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.98 
 
 
484 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.841119  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  34.07 
 
 
494 aa  266  7e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.92 
 
 
503 aa  266  7e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.72 
 
 
483 aa  266  7e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  34.07 
 
 
494 aa  266  7e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.34 
 
 
500 aa  266  8e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  33.53 
 
 
494 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2295  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  35.87 
 
 
491 aa  266  8.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  36.67 
 
 
493 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4591  Betaine-aldehyde dehydrogenase  35.9 
 
 
486 aa  266  8.999999999999999e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03829  succinate-semialdehyde dehydrogenase (Eurofung)  35.07 
 
 
531 aa  265  1e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1307  betaine-aldehyde dehydrogenase  35.34 
 
 
476 aa  265  1e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.424355  normal  0.0731768 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  33.87 
 
 
494 aa  265  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  38.33 
 
 
482 aa  266  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.53 
 
 
493 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  34.07 
 
 
494 aa  265  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0265  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.5 
 
 
484 aa  265  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.72 
 
 
503 aa  264  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>