More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_28560 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_28560  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
540 aa  1061    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352925  normal  0.067406 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0690  Aldehyde Dehydrogenase  64.96 
 
 
534 aa  579  1e-164  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  52.71 
 
 
533 aa  516  1.0000000000000001e-145  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2579  Aldehyde Dehydrogenase  55.79 
 
 
547 aa  511  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16978  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3633  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.47 
 
 
540 aa  489  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2590  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.1 
 
 
525 aa  482  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  50.88 
 
 
521 aa  479  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1175  succinic semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 
521 aa  477  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872678  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4685  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.68 
 
 
538 aa  471  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1018  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.5 
 
 
550 aa  472  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0148351 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0627  aldehyde dehydrogenase  50.5 
 
 
518 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2921  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.07 
 
 
534 aa  464  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000177812  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0115  Aldehyde Dehydrogenase  51.38 
 
 
516 aa  456  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11748  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.9 
 
 
518 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1582  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.7 
 
 
551 aa  451  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0334627 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24720  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.49 
 
 
537 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2456  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.17 
 
 
541 aa  442  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31424  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  49.06 
 
 
531 aa  437  1e-121  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0137  Aldehyde Dehydrogenase  51.24 
 
 
517 aa  430  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1328  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.17 
 
 
526 aa  413  1e-114  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.5626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1995  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.32 
 
 
517 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4004  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.62 
 
 
519 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1896  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.99 
 
 
525 aa  383  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  hitchhiker  0.00000854117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  43.6 
 
 
522 aa  350  3e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  43.56 
 
 
510 aa  343  2.9999999999999997e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0626  aldehyde dehydrogenase  40.57 
 
 
505 aa  297  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0604  aldehyde dehydrogenase  40.57 
 
 
505 aa  297  3e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229199  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0613  aldehyde dehydrogenase  40.57 
 
 
505 aa  297  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0771  aldehyde dehydrogenase  40.39 
 
 
512 aa  288  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179564  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  41.51 
 
 
496 aa  287  4e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0132  aldehyde dehydrogenase  39.74 
 
 
509 aa  282  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129014  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  36.34 
 
 
493 aa  280  6e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  38.77 
 
 
485 aa  280  6e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  37.96 
 
 
496 aa  276  9e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  39.61 
 
 
494 aa  275  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1307  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.48 
 
 
476 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.424355  normal  0.0731768 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  37.85 
 
 
504 aa  269  8e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1951  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.69 
 
 
489 aa  266  5e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  35.26 
 
 
484 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1856  aldehyde dehydrogenase  38.57 
 
 
505 aa  265  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267986  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  36.93 
 
 
505 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2346  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.19 
 
 
495 aa  265  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.259477  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  36.21 
 
 
493 aa  264  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.22 
 
 
496 aa  263  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  34.55 
 
 
488 aa  263  4.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  36.32 
 
 
491 aa  263  8e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1053  aldehyde dehydrogenase  39.87 
 
 
505 aa  263  8e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  35.03 
 
 
498 aa  262  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35 
 
 
483 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.03 
 
 
488 aa  261  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  37.61 
 
 
488 aa  261  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0308  hypothetical protein  34.33 
 
 
488 aa  260  4e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35 
 
 
483 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0646  succinate semialdehyde dehydrogenase  39.04 
 
 
459 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  38.01 
 
 
510 aa  259  7e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.72 
 
 
495 aa  259  7e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1471  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.03 
 
 
490 aa  259  9e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00283478  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  37.58 
 
 
510 aa  258  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6109  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.19 
 
 
490 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.949426 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0566  Aldehyde Dehydrogenase  36.44 
 
 
476 aa  258  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.359165  normal  0.116957 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  39.63 
 
 
512 aa  257  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  37.82 
 
 
488 aa  257  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  39.16 
 
 
517 aa  257  4e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.87 
 
 
486 aa  257  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.66 
 
 
486 aa  257  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  34.79 
 
 
500 aa  256  6e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.82 
 
 
488 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.91 
 
 
484 aa  256  6e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.89 
 
 
500 aa  256  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.82 
 
 
488 aa  256  8e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38020  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  42.54 
 
 
499 aa  256  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.76 
 
 
486 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30180  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.3 
 
 
487 aa  255  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.559382  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.07 
 
 
483 aa  255  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1603  Aldehyde Dehydrogenase  37.04 
 
 
499 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.595509 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  33.26 
 
 
490 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  35.32 
 
 
499 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6346  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  38.19 
 
 
490 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  35.85 
 
 
490 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1799  Aldehyde Dehydrogenase  39.7 
 
 
452 aa  255  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4913  aldehyde dehydrogenase  40.13 
 
 
491 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  33.48 
 
 
509 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  34.49 
 
 
479 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6049  aldehyde dehydrogenase  38.1 
 
 
490 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.719916 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2081  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.72 
 
 
498 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.345453 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.57 
 
 
480 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4196  Aldehyde Dehydrogenase  37.47 
 
 
483 aa  254  3e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.115052  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  37.25 
 
 
493 aa  254  3e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3822  Aldehyde Dehydrogenase  37.44 
 
 
498 aa  254  4.0000000000000004e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.21672  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.82 
 
 
483 aa  253  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  38.4 
 
 
488 aa  253  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3036  aldehyde dehydrogenase  35.46 
 
 
488 aa  253  7e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.35 
 
 
480 aa  253  7e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.35 
 
 
480 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2192  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.16 
 
 
501 aa  253  9.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  36.03 
 
 
480 aa  252  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.6 
 
 
489 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.62 
 
 
484 aa  252  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.6 
 
 
489 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.6 
 
 
489 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>