More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1896 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1896  succinic semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
525 aa  1022    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  hitchhiker  0.00000854117 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0627  aldehyde dehydrogenase  53.24 
 
 
518 aa  491  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  51.27 
 
 
533 aa  483  1e-135  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1175  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.23 
 
 
521 aa  481  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872678  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  50 
 
 
521 aa  475  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1018  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.78 
 
 
550 aa  474  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0148351 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0115  Aldehyde Dehydrogenase  50 
 
 
516 aa  462  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3633  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.7 
 
 
540 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  49.58 
 
 
531 aa  457  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2921  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.98 
 
 
534 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000177812  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2456  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.75 
 
 
541 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31424  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2590  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.91 
 
 
525 aa  442  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11748  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.83 
 
 
518 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1582  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.43 
 
 
551 aa  434  1e-120  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0334627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4685  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.96 
 
 
538 aa  432  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28560  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  57.33 
 
 
540 aa  432  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352925  normal  0.067406 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2579  Aldehyde Dehydrogenase  56.57 
 
 
547 aa  430  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16978  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24720  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.5 
 
 
537 aa  424  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4004  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.94 
 
 
519 aa  410  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0137  Aldehyde Dehydrogenase  47.71 
 
 
517 aa  409  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0690  Aldehyde Dehydrogenase  55.39 
 
 
534 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.492042  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1995  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.06 
 
 
517 aa  406  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1328  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.58 
 
 
526 aa  400  9.999999999999999e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.5626 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  39.15 
 
 
522 aa  312  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  40.77 
 
 
510 aa  297  4e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  35.81 
 
 
505 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0771  aldehyde dehydrogenase  38.88 
 
 
512 aa  274  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179564  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  35.71 
 
 
484 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  38.63 
 
 
494 aa  268  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  38.36 
 
 
504 aa  267  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  38.51 
 
 
493 aa  267  4e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0626  aldehyde dehydrogenase  38.84 
 
 
505 aa  263  8e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  36.65 
 
 
496 aa  263  8e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0604  aldehyde dehydrogenase  38.84 
 
 
505 aa  263  8e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229199  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0613  aldehyde dehydrogenase  38.84 
 
 
505 aa  263  8e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3159  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.57 
 
 
484 aa  261  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.81 
 
 
489 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0132  aldehyde dehydrogenase  39.52 
 
 
509 aa  258  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129014  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.07 
 
 
503 aa  258  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.23 
 
 
486 aa  257  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.95 
 
 
489 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.95 
 
 
489 aa  256  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.95 
 
 
489 aa  256  8e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  37.42 
 
 
461 aa  256  8e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.95 
 
 
489 aa  256  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.86 
 
 
503 aa  256  9e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.73 
 
 
489 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.24 
 
 
500 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.73 
 
 
493 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  35.26 
 
 
493 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.24 
 
 
500 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.47 
 
 
479 aa  253  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0503  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  35.32 
 
 
476 aa  253  9.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.51 
 
 
489 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  33.84 
 
 
509 aa  252  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  33.62 
 
 
490 aa  252  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  38.2 
 
 
496 aa  251  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0028  succinate-semialdehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  38.74 
 
 
497 aa  252  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.55 
 
 
484 aa  249  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4451  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.62 
 
 
493 aa  250  6e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.03 
 
 
489 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  37.01 
 
 
489 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1307  betaine-aldehyde dehydrogenase  35.79 
 
 
476 aa  248  2e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.424355  normal  0.0731768 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0395  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.64 
 
 
475 aa  248  2e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.48 
 
 
486 aa  247  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000530591  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.03 
 
 
489 aa  248  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.03 
 
 
489 aa  248  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.03 
 
 
489 aa  248  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.03 
 
 
489 aa  248  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.62 
 
 
486 aa  247  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.03 
 
 
489 aa  248  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.45 
 
 
479 aa  247  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  35.53 
 
 
473 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1113  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.14 
 
 
496 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.016361  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.2 
 
 
482 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4560  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.38 
 
 
496 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.288864  hitchhiker  0.00438962 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4503  aldehyde dehydrogenase  39.61 
 
 
484 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  37 
 
 
496 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6049  aldehyde dehydrogenase  37.86 
 
 
490 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.719916 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7067  Aldehyde Dehydrogenase  36.14 
 
 
496 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6346  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  37.86 
 
 
490 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  36.76 
 
 
510 aa  246  6.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5259  aldehyde dehydrogenase  35.53 
 
 
487 aa  246  8e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0183  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.36 
 
 
499 aa  246  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352909  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5599  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.53 
 
 
496 aa  246  8e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0279735  normal  0.51588 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0422  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  34.42 
 
 
489 aa  246  9e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0486  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.42 
 
 
489 aa  246  9e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.77 
 
 
482 aa  246  9e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  36.81 
 
 
489 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1202  Aldehyde Dehydrogenase  38.61 
 
 
487 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0940218  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2346  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.01 
 
 
495 aa  245  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.259477  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3165  Betaine-aldehyde dehydrogenase  37.22 
 
 
492 aa  246  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1883  betaine aldehyde dehydrogenase  35.33 
 
 
485 aa  246  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4095  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.53 
 
 
496 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  34.62 
 
 
489 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1485  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.77 
 
 
490 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.464618  hitchhiker  0.00159215 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  33.99 
 
 
482 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1951  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.05 
 
 
489 aa  245  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2192  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.88 
 
 
501 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4701  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.29 
 
 
496 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00415207  normal  0.173855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>