More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0395 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0395  betaine-aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
475 aa  967    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  48.73 
 
 
480 aa  456  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  46.2 
 
 
484 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  44.03 
 
 
482 aa  430  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.44 
 
 
482 aa  431  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  44.03 
 
 
482 aa  430  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  44.23 
 
 
482 aa  429  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  44.03 
 
 
482 aa  430  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  44.03 
 
 
482 aa  430  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  44.03 
 
 
482 aa  428  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.82 
 
 
482 aa  427  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0380  Aldehyde Dehydrogenase  45.17 
 
 
485 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.49 
 
 
483 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.4 
 
 
480 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.4 
 
 
480 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.19 
 
 
482 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.19 
 
 
480 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.19 
 
 
482 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.13 
 
 
480 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.19 
 
 
482 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.19 
 
 
482 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.92 
 
 
480 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  44.86 
 
 
491 aa  413  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0912  Aldehyde Dehydrogenase  45.36 
 
 
483 aa  413  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0440933  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.34 
 
 
484 aa  412  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  44.75 
 
 
483 aa  415  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.71 
 
 
480 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.71 
 
 
480 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.28 
 
 
486 aa  411  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.4 
 
 
479 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.65 
 
 
483 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.86 
 
 
484 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.21 
 
 
483 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.4 
 
 
496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.19 
 
 
489 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  43.58 
 
 
483 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.97 
 
 
500 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.81 
 
 
483 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.19 
 
 
493 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  43.58 
 
 
483 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  43.58 
 
 
483 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  43.58 
 
 
483 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  43.37 
 
 
483 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.44 
 
 
493 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  43.58 
 
 
483 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4676  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.71 
 
 
491 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.928046  normal  0.0486127 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.01 
 
 
483 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.65 
 
 
485 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.77 
 
 
483 aa  399  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  42.68 
 
 
482 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  43.58 
 
 
483 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.65 
 
 
485 aa  399  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  43.37 
 
 
483 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.71 
 
 
484 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.36 
 
 
479 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  43.16 
 
 
483 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.14 
 
 
489 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.93 
 
 
489 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3273  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.81 
 
 
492 aa  397  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.91 
 
 
486 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.6 
 
 
484 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.93 
 
 
489 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.07 
 
 
492 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1640  succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.97 
 
 
483 aa  394  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  43.25 
 
 
489 aa  395  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.04 
 
 
489 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.6 
 
 
485 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.23 
 
 
484 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.25 
 
 
489 aa  395  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.25 
 
 
489 aa  395  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.25 
 
 
489 aa  395  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.86 
 
 
492 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.23 
 
 
489 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.25 
 
 
489 aa  395  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1275  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.97 
 
 
483 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.65 
 
 
493 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.72 
 
 
489 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1755  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.37 
 
 
497 aa  393  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.72 
 
 
489 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.72 
 
 
489 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5050  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.07 
 
 
485 aa  391  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.603107 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0735  Aldehyde Dehydrogenase  45.45 
 
 
490 aa  390  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0429832  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.18 
 
 
486 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  41.85 
 
 
509 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  42.49 
 
 
489 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.51 
 
 
482 aa  391  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.86 
 
 
493 aa  391  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1588  succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.76 
 
 
483 aa  390  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.985863  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.56 
 
 
488 aa  389  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.72 
 
 
490 aa  391  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2402  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.31 
 
 
490 aa  391  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.34 
 
 
482 aa  389  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.61 
 
 
482 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1275  succinate-semialdehyde dehydrogenase  42.35 
 
 
482 aa  387  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.5 
 
 
503 aa  388  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6772  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.82 
 
 
502 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2637  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  42.56 
 
 
480 aa  385  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.602715  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3263  succinate semialdehyde dehydrogenase  45.74 
 
 
489 aa  385  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.132134 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.88 
 
 
482 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.5 
 
 
503 aa  388  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>