More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS0312 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  98.14 
 
 
483 aa  973    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  100 
 
 
483 aa  988    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  100 
 
 
483 aa  988    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  99.59 
 
 
483 aa  985    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  99.17 
 
 
483 aa  982    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  97.72 
 
 
483 aa  971    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  98.55 
 
 
483 aa  973    Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  97.1 
 
 
483 aa  965    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  100 
 
 
483 aa  988    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  91.1 
 
 
483 aa  912    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  95.03 
 
 
483 aa  942    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  56.96 
 
 
480 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  56.75 
 
 
480 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  57.38 
 
 
480 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  56.75 
 
 
480 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.6 
 
 
482 aa  568  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  56.75 
 
 
480 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  56.54 
 
 
480 aa  571  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  56.75 
 
 
480 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  56.96 
 
 
482 aa  565  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  56.96 
 
 
482 aa  565  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  56.96 
 
 
482 aa  565  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  56.81 
 
 
482 aa  566  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  56.81 
 
 
482 aa  566  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  56.96 
 
 
482 aa  565  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  57.51 
 
 
483 aa  567  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  56.39 
 
 
482 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.24 
 
 
493 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.09 
 
 
493 aa  558  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.81 
 
 
486 aa  561  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  56.12 
 
 
482 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  56.45 
 
 
483 aa  559  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.81 
 
 
484 aa  559  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.45 
 
 
492 aa  558  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  56.03 
 
 
483 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  55.91 
 
 
482 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  55.91 
 
 
482 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.07 
 
 
482 aa  557  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  55.91 
 
 
482 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.17 
 
 
482 aa  556  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  55.81 
 
 
483 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.81 
 
 
482 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  58.09 
 
 
500 aa  552  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.6 
 
 
482 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.33 
 
 
482 aa  552  1e-156  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.51 
 
 
493 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.03 
 
 
509 aa  550  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.38 
 
 
482 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.6 
 
 
482 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1275  succinate-semialdehyde dehydrogenase  56.96 
 
 
482 aa  544  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.55 
 
 
496 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.12 
 
 
488 aa  543  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.04 
 
 
485 aa  543  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2905  succinate semialdehyde dehydrogenase  57.26 
 
 
494 aa  543  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2913  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.33 
 
 
482 aa  542  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0320472  normal  0.673658 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2995  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.54 
 
 
482 aa  542  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3092  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.54 
 
 
482 aa  541  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.101414  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.99 
 
 
486 aa  539  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.8 
 
 
486 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.97 
 
 
489 aa  539  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.83 
 
 
485 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.87 
 
 
483 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0517  succinic semialdehyde dehydrogenase  57.17 
 
 
486 aa  536  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000530591  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.24 
 
 
484 aa  533  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.91 
 
 
489 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.49 
 
 
489 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.95 
 
 
490 aa  529  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.7 
 
 
489 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3095  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.33 
 
 
491 aa  529  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.628741  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.49 
 
 
489 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.14 
 
 
479 aa  530  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.12 
 
 
485 aa  531  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.85 
 
 
484 aa  531  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.49 
 
 
489 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.59 
 
 
493 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.91 
 
 
489 aa  531  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0100  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.76 
 
 
484 aa  525  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.93 
 
 
479 aa  527  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.06 
 
 
489 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4443  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.24 
 
 
483 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.094172 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  54.76 
 
 
491 aa  523  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.28 
 
 
492 aa  524  1e-147  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2291  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.99 
 
 
485 aa  523  1e-147  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  54.24 
 
 
482 aa  525  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.22 
 
 
489 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  54.22 
 
 
489 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  54.22 
 
 
489 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2232  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.45 
 
 
490 aa  521  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.179886  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  54.43 
 
 
489 aa  518  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  54.22 
 
 
489 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2568  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.46 
 
 
486 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.951924  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1785  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.4 
 
 
486 aa  521  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  54.22 
 
 
489 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2324  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.64 
 
 
492 aa  521  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.832005  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.83 
 
 
503 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3136  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.32 
 
 
483 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2534  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.57 
 
 
486 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.3 
 
 
486 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.07 
 
 
479 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2637  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  56.33 
 
 
480 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.602715  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>