More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0380 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0380  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
485 aa  1000    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  54.85 
 
 
480 aa  546  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  53.16 
 
 
483 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.95 
 
 
483 aa  531  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  52.95 
 
 
483 aa  530  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  53.16 
 
 
483 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  53.16 
 
 
483 aa  530  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  53.16 
 
 
483 aa  530  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  52.74 
 
 
483 aa  528  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  53.16 
 
 
483 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  52.74 
 
 
483 aa  527  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.06 
 
 
483 aa  526  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  52.53 
 
 
483 aa  524  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52.28 
 
 
480 aa  508  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52.73 
 
 
482 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2568  succinic semialdehyde dehydrogenase  56.12 
 
 
486 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.951924  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52.31 
 
 
482 aa  503  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.52 
 
 
482 aa  503  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52.94 
 
 
480 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  55.96 
 
 
491 aa  504  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  52.1 
 
 
480 aa  502  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52.31 
 
 
482 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52.1 
 
 
480 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.04 
 
 
479 aa  503  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3136  succinic semialdehyde dehydrogenase  55.7 
 
 
483 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52.31 
 
 
482 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  54.35 
 
 
483 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52.31 
 
 
482 aa  502  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  53.15 
 
 
480 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  53.81 
 
 
483 aa  504  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52.31 
 
 
482 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52.31 
 
 
482 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  51.89 
 
 
482 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  51.89 
 
 
482 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52.73 
 
 
480 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  52.73 
 
 
480 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.89 
 
 
482 aa  498  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.89 
 
 
482 aa  499  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.65 
 
 
482 aa  498  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.44 
 
 
482 aa  495  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.95 
 
 
489 aa  495  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.99 
 
 
483 aa  497  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.59 
 
 
482 aa  497  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.44 
 
 
482 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.44 
 
 
482 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.74 
 
 
484 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.43 
 
 
484 aa  493  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.38 
 
 
482 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.44 
 
 
482 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.57 
 
 
483 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.32 
 
 
486 aa  491  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.23 
 
 
493 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.38 
 
 
485 aa  491  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.05 
 
 
490 aa  489  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0112  succinic semialdehyde dehydrogenase  52 
 
 
484 aa  485  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.7 
 
 
493 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.57 
 
 
479 aa  488  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.89 
 
 
496 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1868  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.05 
 
 
486 aa  487  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.36 
 
 
479 aa  485  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.11 
 
 
493 aa  486  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  51.36 
 
 
483 aa  488  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1785  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.31 
 
 
486 aa  488  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1275  succinate-semialdehyde dehydrogenase  51.59 
 
 
482 aa  482  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.32 
 
 
492 aa  482  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2232  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.47 
 
 
490 aa  482  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.179886  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.42 
 
 
488 aa  484  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2291  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.91 
 
 
485 aa  482  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5593  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.03 
 
 
484 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.85 
 
 
493 aa  481  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3222  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.32 
 
 
484 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.85 
 
 
509 aa  478  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0100  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.13 
 
 
484 aa  481  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.97 
 
 
479 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.65 
 
 
503 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.65 
 
 
503 aa  478  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6540  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.67 
 
 
484 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.142006 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2913  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.37 
 
 
482 aa  480  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0320472  normal  0.673658 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3092  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.37 
 
 
482 aa  480  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.101414  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.23 
 
 
489 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0213  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.48 
 
 
492 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal  0.906241 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  52.02 
 
 
489 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  52.23 
 
 
489 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2307  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.41 
 
 
484 aa  478  1e-133  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.841119  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2402  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.28 
 
 
490 aa  478  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  52.23 
 
 
489 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  52.23 
 
 
489 aa  477  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2637  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  52.02 
 
 
480 aa  478  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.602715  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.26 
 
 
483 aa  475  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  52.23 
 
 
489 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  52.23 
 
 
489 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2995  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.95 
 
 
482 aa  475  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3193  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.35 
 
 
480 aa  476  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.21 
 
 
489 aa  472  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.57 
 
 
486 aa  472  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3273  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.59 
 
 
492 aa  472  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.42 
 
 
489 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.42 
 
 
489 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.42 
 
 
489 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  50.84 
 
 
500 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>